Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA040509

[Submit comment/correction]

Sequence
AA040509
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA040509
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGGATGGTACCGCAGTTCAAAGCATAACACCAAAGGTGCAAGCTCACAA
AGTGAGGGTAAACAATGCATCCCGTTTCCTGGTGTCTCCTTTTGATAACT
TGATCAAAGTCAATTCAGACCAGGAGAATGTATACCAGAAGATAATGTTG
AGCAGCAAACATACAAGGCCAAGTCAATCCAACTTGAAAAGGTAAACATA
ATATATGTTTTCTAGTAGTTGTTTTTTATATATTCTGGTAGTTATTCTTA
TATGATCTGATAGTTGTTCTTATATAATCTGGTAGTTCAAATATATATGG
CAGTTATTTTTTGTCATAGTTGTTCAAATATATATGGTAATTGTTCAAAT
ATAATTGGGTAGTTTTATTCACATTTATCTGGTAGCTATTGCACTAAAGG
GAAAATCTAATGGTAGCTGCCACACGTTGTGGTGCCCCGGGTTAGCACTT
CAATCCACTAAACACATTTTTAAGGTGGTAACATGGTGGTTGTTCATGCT
TAATTGTTTTCATTCCTTCTTTTTTAAACTAGGTACCAGATTATAAAATA
CACAGACAACTGGGTTGTAACAGGTGACTTGGCTGATTCTATACACGTTA
GGGGTGAATTGTCAAATCACTTCATGGAAGTTGGTATTGATTACCTGCGC
CGTACAAACAAAGTGGAGGGCAAGATGAAAATGCCAGATCAGCTCTCCAC
TTTTTTGATTACTGGACAGTTTCAGAAGAAGGTTGTTGTTTCTTATTTCA
AAAGAAGATCAGATTACTCCCTCAGTGTAATGAAACAGGTTAGCATCTAC
TCTGAAATTAGTAGCAAGCTTTTAATTACCATATTAGTAGTGCTAAGTTG
CCTGTTTTCATCAGGTTAATTGCCATATTACCAATGTTAAGTTGCCTGTT
TTAATTCAGAGAAGTTGCCTATTTAATTCACATTAGTTACCTGTTTTTCT
CTTGTCTGTTTTTCGTCCAGATTTCTTTCCCAGTCCTTGAAGAGGTTAGC
AGAGGAACTAAGGAAGGCAATCACTGGTATTGCTTGTCTATGAACTTTCA
AGCTGAAAGGTTTGAAGCACTTGACTCCATGCGTGGCGAAGGTAGTGAAA
GTCTCACTAAACATGCAAACGCTCTAATCAGTAAGATCAAGGCTTTATGG
CAAATTCATTATACCACCTCAAAGGTCCAAATACAGGATGGGGAACTTAC
AATTATCAATGTGCCAGTGCAGGAAAATATGTATGTCAACTTTTCCTCTG
TCTTTTTTATTTCCAGATTAGGATTTCTGAATTTTTTATGTTGCAGTTTC
TGTTTCTAGATAATATTGATGTGTTTTTTGTTTTTCACCTTTTGTAGTTT
CAATTGTGGTTTTCATGTGCTGTACAACATCGAGTATTGGGATGGGCAGA
ACATCCCACAAATTGGCAAAGGTTATGCTTATAAATTGAGGAGGATTATA
CCATACAAGTGGATCACTGCTGATTTCAATGAGGAAAAGAACAACTGGAG
GGAAAATTCGAACAAAAATGTCATACGGTAAAACTACAATTCTCCATACA
CCATGCATTCGCAATGTCTTTTACAACATGAAACAACAACATACATTCGC
AATGTCTTTTACAACATGAAACAACAACAAAATGTAGAACATTAGTAATT
GTTTATGTGGTAATGCAGAGGGCTTTTTTTATTTCTGGTTTGGTAGCTGC
GATCTTTCTGGGCATGTTCTTAAATCATGTTCCGTCGAGCCACATTGTTT
GCATACACGGAGTTCCTGCCAATGTTCAGTGCATTCTCGAATGCATACTT
TCTCTTTCTTCCTTTTGTGTTTGATTTGCGGGGATCACCTATGTCAGCAT
GGGATGTTTCCGAAGATGCTGCAGTGGTTGGAGGTATTATTGGGTCTGAA
CTTGTGAAGTTAGGACTGTTAGTTGCCCTAGGACCATATGTGTGTGTTGA
TGACTTTGGAGCAGCCTTATTGCGTTTGGCTGGATGTGTTTCTGTCCCAG
ATTTTTGATGTTGTTCATCCATACTTGTTGTAGTTGCATCTTGCTGATTT
CTCTGGGTTGTAGTATGTTGTGAAGAATTTGTTGGGAGGGCAGAATTAGC
AGCAGCTTTTTTTGCTCTTTTCTCCGTCTCTCTCTTTAGTGTAGCCAAAT
CCTTCTTCATATTTTATGCATCCTTATTATCTTCTTCCCATCATCTGTTT
GATTTCCATATAGTGCCATGCTTTTGAACTCATTGCACATTGTTGCCAGT
GACATCTTGACTCCTCCGACAGCTCCGCTGGTTCGCCTGGTGTTTCTTCC
ATTAAATTCTCCTCTGCGCTCCAAGTCCACCTTTTAAGAATGTATGTCGG
TGACATCAGTGTCAATCCTATATAGAACATGGTCTTCATGTGGAAAAGCA
AAAATAGTAGGGTAGCATAGTTAGTATGTTTCTGAAAAACATAATATGTG
AAAACTAAATAAATTTTTAACTATGTTCATTTTTAATCTGGCAGTTTTTT
CATATGATTTTGCAAGCTACTATATTTTTTAAAACCTGGCAATCATTTAT
TTTCCTAACAGGTAAATAGCAATATTTATTCTGGGAACTGACAACAAGTT
TTTAATTTACCTTTAGAATGTGACAGCAGACTATGTCATCCCTCTCAAAT
TTGCAGCATTGACATTTGTACTCACTATTTTCATGGTCTGCATAAACTTG
GTAGTTTCTGTTGTGGTATGTGGGCACAAACTTTATGATGCATTCAAGTG
TGTAAATACGGTCAACAGTCTGTACTATGTTGTAGGACATTGTGTATAAA
ATTTCTTTCTGAAAACGGTTGTATATGCCACATATGTATACTGTTGACAA
GTGATGTTCAATTGGGTGCCAGCACCATGTCTTAGCTGTAGTTAGGGATA
AGTCTGTTTCTTCTTTGTTTTGTGCTTTCATTATCTTTTCTTGGATATCA
GCATATTGCTGAACAAACTCGAGGACTGAGTTTGAAGGACTAATGTATTG
TTTTAGCACTGCATTAAACCCTTCACTCCGTTGGGTTGTCTGCATGAATG
GGTAAAATGAGTGCATAAAGTATGCAGGGACCCAATAACTTCTTTTCTCA
TACAGTGCTAGAAACTTAGTATGTCCTTGCAAGCCAAAATTTTGTATCAT
GTCATTCCACCTCTCTTCAAATTCCTCTGGTGATAGGCTGCAATTTAGGC
AATCATTGATCACTTCTCGTAGGCCAGGAATCCTTGCAACTAATGGCCCA
ATCTCTTCTGTTGCCTTGTCAACTATATGCCAACGGCAGTTCCTATGCCT
AGTGTTTGGAAACTTGTTATCTATTGCTGACCTCATTCCAAAATCCTGAT
CTGTAATTATATTTTTTGGAGCTACACCATCCATGGCAATTAGAAAAGTT
TCAAATAGCCAGTCAAAACTAGAACTGAGCAGAACTGAGCTCATTCCTTA
AGAACTCACATCCAAGCTGGATAGATTGCCTATGATTGTTTATGCCTATA
AATGGAGCAAAAGGCATCTTATACTGGTTTATACAGTATGTTGTATCAAA
AGATATGCAATCATTGAAGTGTTTGTATGCTCTTCTAGCAGCTCCATCTA
CCCAAAATAAGTCCTCAACCCTGTTTTCATCATCAAGCGTGAATCTGTAA
TAAAAATCATTATCTCGCTGCTTCATTTCATCAAAGTAAGTAAATGTATC
TTGCATATCTGTGTACTTGTTCTCAGCTCGAATTGAAGCTCTGAAGTTTG
CCATGTCTTTTGGTGTATACGGAACTCCTTTAAGCGACTCATAGAGTGTA
GCCATAACTTGCATCATCCTACTTGTTTCCATATTCACCGAATGAAGAAC
TTTGATGAAATCTTGGTCCTCCTGCGGGATTTCTCTATGTGACCGTAGGA
ATCCTGTTAGTGACCATTTGTTAATCAGCGGGTGATTGTGCTGATCACAA
AACTCCGTCACAACCCAGCTGCCATCCCTAAACTTGATCATCATTCGAGC
TTGGCAGTTAGTTCTTGTGTTTGTACTCCTATTCCTCCCCGGCACAACAG
GCTTAGGATTTTGAGTGACTTCATGTTCTTTTTTCTGGTGACCTGCCTTG
TGACAAACAAGTGATGCCCTTATGTACCCTCCAGTTACTTCTGACTTCTT
CCTGTAGTTGTACCTAATGCCAAATCCCTTCCTCCGCGTATACATCTTGT
AGTGTCTTTCAGCTTCCTCCAATGTATCGAACCTCATGTGTGTAGTTGGC
GGCTGGGGTGTAGAAATGACTTCTGGGATGCCATCATTACCACTGTTTTG
TTCTGTCGGAGGTGTGTGAGCAGTACTTGACTGTGGCAGACTCATGTCAG
GGCCAGTAATTCCGAGCGAACCGCCCCTAGAAAGTGTTTCTTCATTGTTT
GCACCAAAAAGTATGATATCTGCATATTTTTTCACATTAGTATGAAGCAC
AATAGAATTCTAATGTAGAAAGCTAATTTTGGTAAAATAATCTGGTAGTT
ATGCATGCATAACCTGGTAATCAGTACATAAACAATCTGGTAGTTCTACA
TATACAAAGCTAATTTTGGTAGTTATGCATGTATAACCTGGTAATCTGGC
ATTTTTGTTTTTTCTAGCTTTTTGTCTGAATAATCAGCTAATCATTTTAT
AACTAATCTGGCAGTTCTGTATGTATAACTAGGCAATCATTTGATAAATA
TTCTGGCAGTTTTTAAATTTCCATCTTTGTCTTTAGTAACCTGGTAATCA
TTTCATAAATAATCTGGAAGTTCTGCATGTATAACCTGGCAATCATTTTG
ATAAATATGCTGGCAGTTTTTTGAATTTCTATCTCTGTTTTTAATAACCT
GGTAATCATTTCATAAATAATCTGGCAGTTCTGAATGTATAACCTGGCAA
TCATTTGATAAATAATCTGACAGTTTTCATTTTGTTTATGAGTTTTCAAT
GACACATCACCATTAGACCCATCCATCGCTAACATCTGATCTATATCCAT
GGTTTTTCTTCTATGTACCTACAAAGTGAATTGTTTTTGAATTTGGTAAA
ATTCATAATGCTTACTCTTTTTTCAATGTAGGAAAGAAAAGTGAATTTTC
AACATGGATGCAACATTTAAGTAGATACAAGGTTGAAGTTTATCATTCAC
ATGGAAGCATATGCAATTTTCTATGTGCAAAGGTTGAAGTTTATCATTCA
CATGGTTACAGCACAAGCATGAAAATATTTCTGTCATGATATCCCTAGGA
TCTGTTTGGATACATGTTATCCTTATTTCTTTTGCAGTTTGTTAAACTAC
TATTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.