Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AA011276

[Submit comment/correction]

Sequence	AA011276
Germplasm	CC7277 (oat)
Species	Avena atlantica
Probe	AA011276
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCAATTCGTCGGAGAAGCTCAACCCTCCGGGACCTCCGGAATGTACGCC GACATCGAGAAGGACCGGTCGGGCTACCGCCCCAAGAACGCCGCCTCGGC GGAGCTCACGAAGGTCTGGCCGAGATACTTCCCCGGGGAAACCGAGCCCT CCTCGGCGCACGACCCCAGGGCAGAACTCATCGGCGACCTGGTTAAGGTC CTGGAGCTGAAGGAGAGGAGCAAGTTCCTCCCACGAGTAAGCATGGGCCT CTATTCCCCACATAGCGCTTCATTTCTGTCACCTCTCACGGCGATGCGAC TCTGTTTCTAGGGTTGCTTACAGGGGTCGGGTGTGATGCGACAATCGCTC GGGTCCTGGGTGATATAGGTTGGTACTTCGGGGAATGCCTAGGGTTTTGC CGAATTGGCCGATCGGTTAGCTGAAAATGTTCTGGGAGTAGCAGCTAACA TCGGAACTGTATGGATAAAATGCTTGCAGGCTCGTGCCTAATGTCTGTTT GGTCCCGACTATTTTAGCTCCTAAGCTTGACAATCTAGCTATTTAAAATT TGGTGCCAACGTTAGTAGAATGTGTGTTGGTTGACTTTGGTTTCTAGTTT TTAGGAACTTAGGGTGATACATGTGTGCTAATTATTTTCTGATTAAGTGT TTGCTTACCTGATTTGATTTGATCCCAAAATCTGGGGCATAATTCGGGTT CACATTCTCCAATACTATGGTCCCAATGTGCTGTTGGTTCCTTGTAGATG AAGTAGTTACTCACATATATGTATTCAGGGGAGGGGAATAATCTCTTCTT AGAAAAAAAAGAATGGGATGGAGCTCGTAATTTTGTGAATAAGTTTGATA CTCTTGCTCGTAATATGATGCTGCTATAAGCTTATAACTATCCAAAGCAT GATGCAAAGGTTCCAATCAAAAGAGACCAAGTATCATGTAGTTGCACAAT AACTTACTATTCATATTGAGCATGTCTATCTAAAGACATGTATTCATAAT GTGCCTTTATCATTACAATGCACACATTTATGCATGGAACAAATTTTCCG GTTTCATAAAATGGACAAATGTACCCTGCTTTTGTTCATGTGGTTGTAAC TTATGATTACATTCACAGGTAGAAGATGATGGTGTTATCTTCTTCCTTCC GATTGATTTCCAGCAGCTTAAGAGCTTGTGTGACGGCACCAATCTCTTGG ATGCTCTCAAGAAAAATCCTAAAGAAGCCTTGATTTGCATGGGAGCTGCA GTTCATCTGGTTGATGATTCTTTTCATGCTAAAATTTATTAGTGTTACCA GTTATGCTTCCTTTTCACTCACTCCACTTTGTCCCTTGATGTTCTTTTCA GTATGAGTTCTCAGGTGGGAATGTGAACGATATAGAAAAGGTCAATATCA GGCTTTACAACCACACCGAGACAATAATTGCTTTGAAGAATTTGAAAGCG GCCTATATCAGTAAAGAATTTATGTCTATCCTTGTATTTTGTATGACCTT CTGCATCTAAATGAAGTACTGACTTGTTTCACCTCACAGAGAAACTGGTC ACAGTGCGTGGTACTGTTGTAAAAGTCAGTACTGTGAAGCCTCTAGTTCT GGAGCTGGATTTCCACTGTGTGAAGTGTGCTACAACCATCCACCGTGTGT TCTCTGATGGGAAATTTTCACCTCCAGTATCTTGTGTAATTCAGGGTTGC AAGGGTAGAACATTCACCCCAGTGAGATCTACTGCCAAGTTGATAGATTT TCAGAAAATAAGGCAAGTGATAAATAGACCATCTGCGTCATTCTCCTCTT ATAGCACTAAGATCTGCTTTTCTTATTTTCAATCCAGGATACAGGAGCTT GCTAGTGCTGAAAACCGCGAAGAAGGCCGAGTTCCACGAACTATAGAATG CGAGCTTACAGAAGATCTTGTAGATTGTTGCATCCCTGGTGAGGTTGTAA CGGTAACTGGAATTGTCAAAGTGCTGAACAACTATATGGATGTTGGAGGA GGTACGATTTTGAAGAAACTAGTATGTTGTTTGGATACTCTATTTGACAT TGCTTCAAAGCCTGAGTGCACTCTTCGAAAAACAAAAAGTGCTAATCTGC AGATGCCCCTGAGCACATATGTTGTCAGTCTTTTATTATGCTTGTTCAGT AATTTGGATTGATTGTCTAGTATCTAGTGCTTGTGCCTTGCGGACTAGTA GGTATAAGTAGTTCAGCAGAAGCATTATCAAGTACCATGTTACTCCTAGG TAAAACCCTATCTTCTACTATGTTTGGTATCCCTAAAACCACTCCCCATT CTAATATTCTATCTTTACCTTGCCATGACACTTGTTCTTTGTTAGATATT GACATATCATAGTTTGTATGATTTCGTTGAATGTAAGACTCAATATTTTT TTATAGAACAATGCTCAGAGCTAAAAGCTTACTAGGTGTGGCTGCCATAG CCTTGTCACAGGCAATACTCGTGATACTCTTGTCTGTCATGCACGGCATC ATGTACAAAGCCCATGCACGCCACACACAGCAGGGAGATGGCACAACAAC AGATCATGTCCAGGAGGGACACAAATCAGCAATGAAGCATGTCAAGGAGG GATATGGCAGGACGGACTCGGTGCTGTGAGAAGCAGCACCCACTGCCATC TTGCCTTGTCCATTAGTTGTGGGCGAGGGAGGACAAGACCGATACCCACG TCTCCTCAGTAATATCACGGGTTGGGGCAGATTATAGTTGGTAGATGCAA TGCATTGCATTAGAGATGCAACGAGTGAGAGATATAGGAAAATTGCTTAT GTAGCATGTATATATACCAGGGTATGACTTTATATCTAATAATCCTAACC CACTACAACTCGTATTTAATCTTGGTGGTCTGTAGATCTCTGAGACTTAT GGCAGAGGTCCAGATGGACTAACCGAATTGAGTGCACTGAAGTCCTTGTC ATAGACAACTAGGACTAGTTTTGGGTTGTTGCAGGGGCTGCAGCGTCGGC AGTCGGGACGGCTTGCCTGGATTCTAGGACCAGCTGATATGGGTTCAGTT GCTGCTCATCTGGTGGTTATACGCCCCACCACCACCGCATGATCGTACCC TTATCTCTTGTGTACTGCTTTCTGCTTCTACCATACAAATGCAATCAGGG AAGTTCATGTTATTCTGAAGCTGGAGCATTTTTTGTCAAAATTTCTGTTT TTTTACTACCTAGATGCACATTTTCTGAAATTATATTGAAGATTTTTTGT TTAATATCTTCAGGGAAGTCCAAAAGCAAAAATCAGGGTTTATACTACTT GTACTTGGAAGCAATCTCAATACGGAACTCGAAGGGCCATGCTGTTTCAG AAAATTCTGGTGCAAGCTCTACTAATACTCTGCCTAGTGGATCTTTCAGT TTTGAAAGTTTTACTGATAAGGATCTTGAATTCATTTTCGAATATAATAA TGAGCATGGTCCTGATCTATTTCGTCAAATACTTCATTCTTTTTGCCCCT CCATCTACGGACATGAACTTGTAAAAGGTATTATATTTTTACCTAATATG GTATTTTCTTGCAGTAATTTGAATAAACAGCATTTCTGCTGGCCATTTAA TGTGGTTAAATATTTGCAGTTTAGTTTGCTCAGAACTGTCCAAACATTTG AAAACATTTTTTGCTTCACTAGTTCTGGATCTATATAATGATATATGTCT GAATGATTATTTCATGGGAAGTGCACTGGCAAAAAACCAGGCAATTTAGT TGAGGGACTGACCAAGCTATCAGTAGTTGCAGTTCAATAAGGGGATATGT CTTTTCTCAAGAGCAGTGTTCTTTAATGTCTGCCGACAGCTGCTAATCCT GTTGGTGGACTATGTAAACTGTATTTTGGAACTACAATGTATTACATTAT CAGATGTTCCACTTATGACATACATTATTTTCTACGAGAGCAAACTTCCA GAATGCAGTTCGTCCACCTCCAGTTATTCATAACGACTCCCTCAAATAAA AAGTTATTCATAACGACTCCCTCAAATAAAAAGTTATTCATAACGACCAA TCCATATGATGTACTTGCACCTTCGTTATAGTAAATGACCAATTTGCCGC TGCCTGCTGACTCAAATCATGGTGGCAAGGGGGCACCTAGTGCCTAGGTG TGTGTCCACTTTTAGAACACTGTATATCATAGAAGTGCTCATTTCAGTAC ATTAGTATTTCCTTGGATGCCACCGCTTCTGATCTGTTTTATTTCTTCAT TGCATTATACTGGACATGGCTAAATTAATGTTTCCAAATTTCAGCTGGTA TCACTCTCGCTCTTTTTGGTGCTGTGCAGAAGCATTCAATGGATCAGAAC AAAGTCCCAATTAGAGGAGACATACATGTTATCATTGTTGGTAATCCTTA TAGTTTATCAATCTTGATCCATGGAGGATTTGCTTAGTACTATCCAGGAT GCAATTACACTTTTGCTTAATGTCATGGCAGGCGATCCAGGACTAGGAAA GAGCCAATTACTAAAAGCTGCAGCATCCGTTTCCCCACGGGGAATATATG TATGCGGGAATACAACAACCAATGCTGGTCTAACTGTTGCAGTGGTTAAA GATTCAATGACAAGTGATTATGCATTTGAGGCTGGTAAGCATGGAAGATT TTTTTTGGAAGATTTATTTGTTTCTTAGTAGACTGTTAGTTTACGCATCG TGTGCAGAATCTTGTCAGAAAGTCACCTAATTTGATCATTTCTTGTCATA TATTGTGTTCTACTGTTACATGTCCTGATGTGGTTTTAAGTCTTGGTTTT GTGATAGGATGAAAATAACGCTAAGCTCTTGGTTTTGCAGGGGCCATGGT ACTTGCTGACCGTGGACTATGCTGCATTGATGAGTTTGATAAAATGTCAG CAGAGTATCAGGTATTGTTCTTAGTTTTCATCTGATAGAAGCTTGGCGAT GAAATGCTCAGCAGTGGTAAACTTTTCAAACTCATCTTGTCATTTTTGGA ATTAATTTGTGTTCCCAGTCCTTACTGGAAGCCATGGAGCAGCAATGTGT ATCTGTGGCAAAGGCTGGCCTTGTGGCAAGTTTATCTTCCCGCACCTCTG TGCTGGCAGCTGCTAATCCTGTTGGTGGTCATTACGAGTGGGTTAATCTT TTCCATCCTTCTCTAATAAAATTTTCTATCCCTACTTACCGTATAATGTT TGTTGTTCTGGATATGTTGTCTCCATCTCATCTTTATTTTTCAATTGATA CCAATTACCGGTACTACTGGTCTGTGTGTGTGCGCGCTCACCTGGTGTGC AATTACTTATATGCTTGTTTTGACTTACAATCATGACCCTATACTGCGCC TGGAGCAGATAGGGCTGCAAGTAAATACAGTTTTCTAGTTTATTCTGGTG TTGTTTCTTCATCTTGCCTGTCAGCGAGAGATAATAGATATGGTTTATTT CCAACTTTTTAATATACTATTTCTGCAGCCGAGGGAAAACAGTGAATGAG AATTTAAAGATGAATGCTGCCCTCCTCTCTCGGTTTGACTTGGTTTTCAT TTTGCTTGACAAGCCAAATGAGTTTCTAGATAAGAGACTATCAGACCATA TAATGGCGGTAAGCTTCGGCTATATCTTTTTATTCACATCTCAAGCATAT TGTACTGATGAGAAATATCCTCACATAATGCAATGGTTCTGTAGTTTGTA ACAAAATGGTATATAGTTAGGGCTAGAATCTATTTATCTAACTGAAAAAC TAAGACAAAGTCATTATTTTCTACACGCAGCTCCATACCAACGATGGAGA CCATTGCACATCCAATAAGAGGTTAAAAACAGGTAGCTACTCCGTAATGC TCTTAGTTCCTTTTTGTACAACTGAAACCTTATCCATTGTTGCTGATTTG CAACTTTGCTCAGAGCCTCGATGTAATGGCAGTATGGGGGCCGAGATTGG TGAAAAAATAGTTTCAAGGCTGAGACTACATCCGGAGAAAGATAGGGATT TTGTTCCGTTGCCTGGACCACTTCTTCGCAAGTATATATCTTATGCAAGA AACTTTGTCACCCCTCGGTATTATGTCAGCTCCTTCTCACTTATTAATCC CATATAAGTAATGCAATGAGTTCTCATTTTGTTACTTTCCCTCCCTCTTA AGCATGTCAAAGCCAGCAGCTGATACTCTGCAAGATTTTTACTTGCATTT GAGAGACCGCAGTACTTCTGCTGATGGCACACCCATCACAGCCAGACAAT TGGAGAGCCTTGTAAGGTTAGCAGAAGCTCGTGCTCGGGTGGATCTAAGA GAAGAAGTGACTAAACAAGATGCCAAGGTAAAATGAGTTGAATGCTTAGT CCTCCTTGCACTGCCAGCTTGGATTCCTTCGTAGTACTCTGTAAATATAT TGCCAGCAGAGAATTTTCGGTCGGCTTAGGTTCTTGTCAATGGTTGCTGG GAAAAGCTGAGCTCTTTCTCTTGCTACTTTTCATCCTCAGAAAATTGCTG AATCAAACTTAAAAGCATGATGAATTATGTTCTTTAAACTCCATATCATG TCGATGTCTGCAGATTTAACTTCTCTGCCTGTTTGCTGCTTTACTTTAAA TCTGAAAAATGTCATTGTACAGTGCTTACTGCATGCCTAAGGCCTATGCC GGAGTGTAGTTTGGCAAATAGAACAGTTAGATGACATAAAGATGCACACA CCATTTTAATCTAAAATGAGGGCATGCAGTCTTAACGTTGTGCATTTTTT ATGTCGCAGGATGTTGTTGACATCATGAAAGAATCCTTATATGACAAATT TGTTGATGAGCATGGTTGTGTGGACTTCACTCGGAGTGGTGGGATGAGCC AGCAAAAGGGGGCAAGGAGACTTCTGAATGCCCTAAACAAGCAGTCTGAG TTGCAGCAAAAAGATTACTTTTCAAGAGCTGTAAGCAATTATGCGTCTAC AATGATTTTGTTGAAAAGCTTTTGGTCTGTTAGTTATAGCATTATACAAA ATCCAACCAGACATGGAAGAGTGTCGATTTCAGCTGGTTACAATTCTTCT CCTGTTATGACCGAAGAAATTTGCCTTACTTGCTTTTTTGTGCATTTTGG TTCCTTTGTCATGCAGTCTCTCCAGTAAATAGGATTCTTGGGGTTTCTTT GATGTTCTATAATTTTCCTTTTGCAGGAGATACAGAACTTAGCGGATAAA ATCAACTTACAAGTTCCAGATTTAGATCGCATTGTGGAAAGTCTGAACAG TGCCGGTCATCTTTTACAAAAAGGACATAAGTTTCAGGTATTGTCTCATG AAACTGCTTGACAGCAAGTTCCAATGTTGTCGTCGGTGTCAGTCATGAGT ATCATGCTGATTATGGATTATGACTAGTAGACTCATGATGAGCCCTCCTC GACTGAGAATCTAACATAATTTTTATCTATCAACAGCTACAGACCTCATC ATATTGACGGACCCAACCAACAAGGTCAAGATGGTGAGTTTTCTTACACC CTAGTGAAAAACATTAGGAGTTGGTGTTGGTGGATTCTGTTCTATGTGTG CCCCATGTTCATCTGGTCGATTAACAGTTACTTTGAGTCAATATTCAACA CTTTCGTTGTTAATGATAGGACAACTGATTGTTAGTTTCCTCCTTGTCGA TTCATGACTAGTTTCTTTTCTGACAGATATGGAGGGATACGCTCTTATGG ACCGTTATGTATTATGATGGCCTCTAATTTAGTTCGTGATCGGTTTGTCA ACAATGTTTATCTTGTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTTTAGG TTTGTGAAACAAATGTATCTAGACTACTTTTAGTAAATAGGTTCACTAAG TTTTGGAGTGAATCTACACACTAAAACAAGTCTAGATACATTTTCTCCAC AAACCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTAGAAGTTTATATT TTGAAACGGAGGGAGTAGAAGTTAGCTGATGTTGAGAAAGATTTGTAACA TTTGAAGTTCCAGCATGTTGACGGATCCCACTTTATTTCTCAACTGATGA CCATGATTCTTTGTCTAATCTAACAGAAACAAAATATGGCTGTTCGTCTG CTTTGCTTATACTATGG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.