Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AA008220

[Submit comment/correction]

Sequence
AA008220
Germplasm
CC7277 (oat)
Species
Avena atlantica
Probe
AA008220
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCAATTTCTCGTGGAGGCGAGGAGATAGAGAAGAGAGAGGAAAGGGGCG
GAGGAGGAGGCGTGTCTGGCGATTGGACAGGGCGCGAGGACCCCGAGGAG
CGCGCGCTTGTGATCCCCGAGGCGCGGCGAGTCGATTCCGGCGCCGGGAC
AGCCTCGCCCTCACCGGGCCGGCTGGTTCGAGACCTCTATCGCCGCGGAT
TCGGTGGGATCCGGCCAAGAACTGGTTGGTGGAGGGGAGAACGGAGGGGA
TGGGGGCCGGGGCGGAGCCCGTCGAGGTGGAGGAGGGTGCGACCGGGAAG
GAAGAGAAGGGTGCGTCCGGGAAGGAGGAGAAGGCGGCCGTGTCGTGCTC
GATCTGCCTCGACGCGGTCGTCGCCGCCGCCGGCGGGGACAGGTCCACGG
CCAGGCTGCAGTGCGGCCACGAGTTCCACCTCGGTAAGCGGCGACGGTTT
GATCTGTTGATGCGTTACTCGGCTCTATTGTTGTGATTATGTCACAAGAC
AGCCGTCTCTGGGAGCGAAATGATTTTTATTAGTTGGAATTCGGCAGAAT
TACGATCAATTCAAGCTGTTCTGATTTCTGACATAGATCCAATTTCCTGT
TAAGGTAGTTTTCGTGGGCATATTTTGCGGTACCTTACTCAGGCGCGACA
GGAAGTTCCAGTTTTTGGGGTTTGATTTGATGTCAAGATGAAGATTTGGG
TACACGACGTAATCGTGACTCGATTTGGTTAGCATGGTTACGTGGGTGTC
TTCTGTGGTAGCTTAATCAAGAGTGATAGGAAGTTGCAATTGGGGGTTTG
ATCTGATGTCAGGGTGACAATTTGGGATTGTACACGAGGTAATTGTGTTG
CCATTTTTGTAGCCTTTTTGTTTTTTTGGTGGAATAAGGTTAGGATATCT
ACAAGAAATTGATATTTTCCGGTAGCTTACTCAGGAGCGATAGCAAGTTG
CGATTGGTGGTTTGACCTGATGTCAGGGTGACAATTTGGGATCGTACAAG
ACCTAATCGTGTCTCAATTTGGGTAGCCTCTTTGTTTCTTCGATGGAATA
GGGTTGGGTTGTCTAGGTTGAAGAAGAATTTGATATAAAATGTGCTCCTT
TTCATGAAAATTTATGTGCTTCCGAGCCAGTTGTCGTTAATCGATTGTTT
GCTTAAAGAATACATGACCAGGAAATGTTAAGTTCTGAAGTTTAAAATTG
AGAGCGACTTAAAAGGTGATAATCAATATTTCAGGAGTTGTCACTTTGTT
GGTTTCAGCATAAGAGCATCCTCGATGCTGGGCACCTGTTTAGGCGCTTG
GAAAAAAAAAACGACCTAGCGTAGGTGGAAAGCGCCCATTGCTCCAAAGC
AGGTGGTGATTTAGAAATACCAGCCTCCCCACAAATCGTTCTGCGCTGAA
CACAAAAACGGTGGAGTGCCCGATGCAAAAATAGGCATCGAAGCAAGGAG
ATTTCCTAGGATTGAATCAGCCGTAATGGCCAGGAAATCTTTCCTGGCGT
CCTTCTTTTAGCGCCGTGCTGTGGATGCTCTAAGGCTGCTGATTTCAATG
TGATACTGTAATGGATTTAGGCTCCCCTGCCTTCTATTAATGCTGGATTG
GAACCAGCTGCAGTTTAAGAACATTTAGTAAACATTGCCTTGATCAAAAA
GGTTACTGAGAACATTAGCTTTACCGAGGAAATACACACATACATAGTGG
AAACAAGAATACACAAGGAAAAGGATAATCTCTATGGCTACGCACACAAG
AGTTTGGTACTCTCGGATGTCACCTCTTATCAAAAGCCTTTTCCCCTTCC
CTTTTTTATTATCTCATGCACAAACTACTAATGATTACTAGTTCTTTTAA
TAGGGAAATACACACGTCCAATCACAACCGCTTGATCCGAACATTGATCT
TGACTAGCTATGCACGCGCATAGCGTCACTCTACCGCTGCACAACCTCTT
CCCGCGCAATGGCCATACGACGCGGCCAAAATTGACACTTGTAGGTAGCT
TGACAGTCTGACACTAGCACATACAACCTGATCACTAACATCTAAACGTA
GGCATTATTATCTCTGTTGTGTGCATGAATTACGTGGTCAATTACACATG
ACTAATTCGCGTAACAGGTGCATACATGCTCTCAACTAATGGTTGCCGAG
TGCCGACCCAGCTGTGTGCACCCTGTGCTCTTTGCCGATCTTGCTTCTCC
GTGCAACACATGCAACTAACTATAACTTAGTTGACCACACATGCCTCTTG
ACTCTATATGACAGTAATGCAATGCATCACAACTGAACACGAACAAATCT
CCTAATCAACTGGCTTAACTTCAACAACAACAGCAACACCAACTAATCCT
TTTATCCCAAGCAAGTTGGAGTAGGCTAGATATGAAATCCAAACAGAAAC
TAGTGGAAAGTGCAAATACGGCAGAAACTAGTGAAAAGTGCAAGTCAAGC
AGAAATTAGACTGTGATTGAGAAGCAGTTTTGACCAAGGGGTTATTGTTG
TGGTGACCCTGTAGGGTGCAGAAGTGCAATTGCATGATTTATGCAATTGT
ACTGATTCTGCTGCGTCATGATACCATAAATGCTTTAACCAATATCAGAC
GGTGCTCTTGAATATCTGTTTGGTGATATTTTGTTTAATCCAAGGTCAAA
TTAACCATTTCCATGTCTCATTGACATGTGTGCCGTGGACCCAAATGCCA
GTTATACACTGAATGGCATTTAGTGATGCCAACTATTTTGAGTGCAAATT
GTTTAATCCATGAATGTAAATGTTTTCAGATTGCATTGGATCAGCATTCA
ATGCCAAAGGAGTTATGCAATGCCCGAACTGCCGCAAAATTGAGAAAGGG
AATTGGCTCTATGCGAATGGCTCGCGTCCCTCACAGGATGTCAACATGGA
TGAGTGGGCTCATGATGAAGACCTTTACGATGTTAGTTACTCTGAGATGG
TATGTGACCATGTGAACATTATTCTTAAATATTATAAATATATAATCATT
TTTAAATAGTAATCTGTACCTTTTAGCTGATAATATCGTTGTTTCCAACA
TACTTTTCTTGTGTGTGAAATGTTAATTGTCTTGTTGACCTATTGATATG
GTTTATTTCTTTGTCTGCACTTAATTGAACTTGACCATGCTTAGTTTATT
TGACCATTTAGTTTGTAGACACTTATTTCTATGCATGTTTTCTTATGCTT
TCTATTCCCTAATACCACAGTTTTAGCTTGTACGTAATGCTCTAGAAACA
TTTGATTCCGTGTGGGCTCCTCAACCACTGAAATCATTGATGGCTACTTA
TGTGGATTCTGTTACCAGACTTACCGTGTTCTTATAAATCTGATACAATG
CTGAATTGTTGTTGGGACCATGCCTTAGCTGAGCACTTACCGAGCAATAT
TATCTGAGCACTTACCGAGAAATATTATCGTGTCTCAAATTTAACCCCAT
CCTAGTTTAAGACTTGCAGAGATATATTCCTTTATCTCTTATTTCAATGT
TTTTCATATTCTTTCCAGATTGCTAGCTTTGTTTCTGTAGATATTGTCCA
GACCCTCTTCTATTGGAGGCCTTGTGGATTACTTTTGAAAGAAGTAGCAC
ACTTCTACACTAGAGGTCGTGCTAATTTTGTTATGCATAAACCAGTGTAG
ACCTAACCTGTAGAGTGCTTTAGTCTGGTGTTTCTTCAAATAATTTGATG
TTTGTCCATATTGTAATTCCTTGCATTCTGCTGAATGCATGTATAATCTT
GAGATCTACGTTGTTTCTGCTTATTTAACTACCCTGCTCATCTATGCTTC
ATCGTTGTTATTTTGAAACGTTTGTGCTATTTATTCTTAAATCATAGCAG
AGTTAGTCATTCTTAATTTTTCGTTGCTGTCTTATTTGCATAGGCACGCA
AGAAGGCGGTTACTTCTCCTTACATACTATGATGACTATATATGTCAAAT
TATTTCCGCACGCCAATTCTGACAGATATATATTTTAAATGTGCAGCCAT
TTCGTTTTCACTGGTGTCCATTTGGTCGCTTAGCACAACTTCCATCATTC
TTTGAGTATGTTCGATACTTCAAATTATCATTATTGTTTTATATTTAAAT
TCTTCACAGAGCTAATTTCTTGCATCCATGCATGTACAGATAGCTTTCAT
GTAGACGTTCTATTTTTGCTCTGTAAATTTGTAATGCAGGTCTAGTAGCT
CCAATATTACAACTATGGTATCTCACCCATGTAGAAATTGTGGGCACCAC
AGTTAGTTCCTGTGATTTTGTTTTTGCTGGATGTTGTATTCTACTATTCA
TAATGGCAAATGTTACACTTGTCCAGTTACAGTTTAGAGTCTAAAGCTGA
AAATGGTAACCTTTGAACCCAGGTGTCAACAATCTATTTAAGTGATGCTG
AAAATCATATGAAAACATTTTTCAATTGATCCTTTTGCAATTAAGAGGTG
AATAATCTGAAATTCTGTATATGCTTAGCCTTGTTGTGCTGCATGAAATT
ATTGACAATGTCCATGCTGATTTTCTTGCCACGATTAGAGTATACATGGA
TCTTCTGAAAATCATAGTATTAGTTTACAAGCGATACTGACATTGTGATA
CAGTGTATAATAGACATAATTATAGCCAAAGCACTGATCAGTCTCAGGGA
TGACAAAACTAGCAACACAGTTATTCCCGTCATTTCCTAATACCAGTATC
AGTTAGCCAACAGATTCCATACCGAATGAATATATGTTGTTGTATTAAAC
TTTTTTTTTACACAAATATTATATGTTGTTGTATTACACGTGTTTACAAA
GTAGTTTCAGAAATCATGGCTGTACCATATTTATATTAAGAGTTCTCCGT
ATATGGAAAATCATGCGATTCGTCTATTATGTTACTTATTAATGTTTCCC
CTCTTCTGCCAGGGAAGGAGAATCATCACCTCCAGTTACTTGTAAGTTCT
TGTGTAAATGAGATCTGTTTGTAAAATTTAAGTTTGTTGAGGTCTAAATA
TGTGTGGATATTTTTTCATGCAGTTCATGACTTTATGGGCCAGCATGTGT
TTCCGGAGCATCTATCTGTACCTGCTGCACCTGGGGCACATCCTTGCCCT
TATGTGGCATATTTGCAACCTCTTCCATCGCTGGCCTCGTCATCGAGCTC
CCATGTCCCTGAGAGAACTATGGATAGTTCCGTCTATCATGATCACTGGA
ATCACCTGGCTGGCCCATCAGATGGGAGGCCCTTGCAATCGGTGCAACCC
ACTGATTTCCATCATAACCATTGGGGGCATCTGCCCCATTCCTATGCTCA
ATCCAACAGCAATAATGGGGTGACCGAGCAGCCAGGGGTCCCTTTTGGAA
CAATGAGGGCTGCAAGGGTTGACGGTGATAGCCAACGTCGAGGATCTGTT
GTTTCTCCATCGTACTTCAGTAATGGGTAAATTCTTTGTCTTTCTCCGCT
CTCATGACATACTATTAGGGCCATGTACATAGTTATGTCTTCATACTCTA
GTGTCTGTCGTTATCTAGTGTTTTTGGTGATGGCTAGCATGTAGAATCAA
GCCGTCTTTGATGTAAGGGATACCCTGAGATAGCTTGGGCACAAGAACAT
AATGAAACTATCAAATAGACAATGGAAAATGGCTTTCCAGTGAAGATTTT
TTTCTAACACTTATTTTGATGAGAGGAGTGTGGAAGGACATATGATGATT
TTTATGACCAAATATTAGATACTGAGGAGACTTATCATGTTGTCCCCAGA
TGTTAATGTTTTGGAGGTGCCCTTATGGCTTTGTTTTGATATCTGTAAAC
TACGCTAGAAAATATTACATTGTGCTTTTATCAAAACCTTTTACTCCGTC
TGCTCCAAAACAGATGATCTTTTTGAAAGAGTGCACTAATTTCTCTTATC
TTTGACAATGAATTGTTAGTGGCCAGGATAGATTTGTCATGAAAAACTGT
TTTGCAATATTAAAAATAATCTCCTACTTACATATTCGAACAGAACTAAT
GGTCAAAGTTATGTAAACTTAACAATGATGTCATGACTTGTGTGTTTCCT
GTATCTATATTTGATGATGTTACATTTTTTCCTCGACCCTGGCAGCTTTA
TTCCAATCTTCTGGGGATTTCAGGGTTTATGCTATGTTGGTTAGGTATGC
TGTATCAAAATGTGAATCGGGTAGTCTGAAATCTGTAGCTAGTGAGGCTA
AAATCATTTAAAACAATAAAAAATACCTGATTATTTCTTCAGAATCAATC
TTTGTTATGGCAGAAACAATTGCAGTATAATGAAGCTTGTTATGCATGAG
GTCAATGTGTGATAATGTTTTTGTTTTCAGGTCTGGGTCTAGATCTAGAG
CTCCTAATGTTCCTCCTCTGGTACCTCAATTTATGAGGGCACATGGCAGC
CTCAACGAACAGTACCTGCAGAATCCATCATCTAGCCTTTTTGCCGGGGC
GCATAGATCGGGGGGCATGCGGCCTGCTCCGCCACCTCCTCAACCAGAGA
ACCCAACATTTTGCCTGTTCCCACCAGGTTCATCCGGCCATAGTTCAATG
GAGACTGATGACGCCGGAGGAAGCCGATTCTATGCCTGGGAGCGCGATCG
CTTCGCGCCATACCCATTAATGCCTGTGGACTGCGAGACAAGCTGGTGGA
GCTCACAGCAGTCTCACAGCGCATCAGAGTCCACACCTGCACCAACACCA
GCACCCGCGCCAAGGAGACTATTCGGGCAGTGGATCGGCCTCGGCCGGTC
ATCGCCTGAAAGCAGATCGCCGGAGGGCACATCATATCGACAACTGCACT
CTCCTCGGATGTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.