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GrainGenes Sequence Report: AE042086

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Sequence
AE042086
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE042086
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGAAATTGGAAACCCAAAAATTGCAGACCGCAACTAGAATCTCCCGGCCC
GGAACATCAAGGTCTCGCGCTCGCCTCTCTCTCCTACTCGTCTTCCGCGG
CGGCGGCGACGGCGGCGGTGATGCTGTCCGGCGACGTCCCCCCGAACCAG
ACCATATACTTCAGGAACCTCAACGAGAAGATCAAGAAAGATGGTACGGC
TCCTTGACCCGGCTGCTTAGAGCGCTCGCCGCGACAGCTGGTTAAATCCC
TCTTAAAACCCTAGCCTCCCGATCCGGGCTGTTGCTCGTTTCCGCTGCGC
TGCTGGATTCGGCGCTCTCTCGTGAATATTATTTTAAAATTTGTCCGTAG
GAGCTGCCTCGACTGCCAGATTTTTGTTTGGTTTCATGCTTTTACTGAGG
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AAAAGGGACAGCCTATAATAGCCTTCACCTTTTACAATGTTTTGAGTAAG
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TGTTGTGCTAATGCACTTCTTGCTTAGGTTATACTGTGAACATATACTCT
TTGAGAATGTCCAGATGATCTCTTCCTGGATGCTGAAACACGTGATCTCT
AGTCTGTTACTCCTTGTTAAATCCATTTTTTGTTGGTTAACTGTCTAATT
GAAAATGAGCCTTTACTCTTAGCTAGTCATTGCATCACTACACAGATAAA
AAATGACAGTCTTGAAAGTGCTGCCCTGTCACATGCCGAGGTTGAGACAA
CTTACTTCTTTCCCTTCCCTTGCGCAGATAGTACAATATGCAAAAACAAG
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GGAAGAAGCAAGAGGAGAAAGGTAATTACAATTGCAGATCTTATATTTGG
GTCTATGGTCTTTAGGGATATGTGGGATGGTTATATTACAGGAGTGGAGT
AAAAAACTAAAAATGGTAATAAATCTACACCAGCGTGCATATTAGCACGC
TTTTCTGTTTCCGAAATCAGAGCGTGCACTTTGAATATTCAACAACTAAA
TAGGTGGTACGGAGATTAGGCTAATTTTTTTTTCTGGCCATGAGATTAGA
CTGAATTTTATGTAGCCCTCTATCATTAAAAAGACTATAATAGCTGACTT
ATCAAAGTCTAGGTTCATTCAACTATGAAGTCTGAAGCTATCCTTAGAAC
CCTGAGTTATTAAAATTGTTGCAAATAACCCCTTCCACCCTTATCCTGGG
TGACTTTTGCCACACAGCATGCTACTAACAAATCGACCAAATTTGACTTA
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TAACATGCACCTTTTCAGCAAGTTACTGTTTGGAGTGGTAAAAGACTGTC
TATTTATATTTTTTCCATTTACCTCTTATTCCCCATTCAGCAGCTGAGAA
AAAACGACGTACTGAAGATGCGCAACAACCTGGCCCTAATGCTCCTGTTG
CACCAAGCAATGGAACTGTAAGTTCTCGGTTTGAAAACCACACTTTTTTC
TTGTTATTTAACCATGATGTTTGTTGTATTGTCTATGCAACAACTGGCAT
TGTGCCTTACTGTGAATTGTAGCGACGCATTTATCTACATAGTATTTTGT
ACTTGCCCACTAAAAAGCGTGTCTCCACGCCAACCTTTTGTTTTATGTAA
AAATTATATCTCTGTTGTAGCACTCTTGTCCTGTTTTCTATTAATTTTCA
CTTATAGCATCTTAATGATCTCGTCACTTGAACTACCATTATGCTGACAG
TGTATTCTAAAATTTGCATGTAAGCAACTACACCCAAAACATTTTCAATT
ACTCCCTCCGATCCAAATTAGTTGACTTGGTTTTGTCTAGATTTGGATGT
ATCTAGCACTAAAACAAGTCTACATACATTCAAATCTAAGTCAACTAATT
TGGATCGGAGGGAGTAGATCAATTCTAGCTCTGCAGACTTCATTGTTATT
ATGGCTAACTTCTTAAAGTTCTGGCCTCGCCAAAATGTTTCTTGAAAATA
TATAGCCCTAACAGTTTGTAGTTGCTGAGCTGCAAGTTGGTCTGTTGGTC
CTGGTATTTTATTCTGTTCAGTTTCATTAGGCCCTGCTTGAAAGCAGTAT
AGAATTTTCTACTTTGCTTATTTGTAATTGTCAATTTTCACAGGCAGCTG
TTTTGGCCTTCAGCCTCCATTTTCTTTCTTTTTCAATGTGTAACAATATC
CAGTAACTAAATTAAAAAGACACTATACTTCCGTTGAATATGGTGATTTT
CTTCGGATAGTCTTGCAATTTGGATCCGGTTCCTCATCAGGATCCAACAC
ATGTACATGTCGTTTTGTTCTGTCCAGCACTTTCTGAGGGTTTACGAACT
ATATGTTTACATATCTAAATGTTACATCAACCAATACTCTTAATTAAGCT
GATTGGTACACTTGAGTCATGGATGGTGGAGAAACTATTGCTGTCTGCTT
CATTAAACTGGAATATTTTCCAAGTGTCTCTGCGAGTATGATCATAGTCT
TGTGATACCTGTTCACTGTATTTAATTTGTGTTTAGTTATGTTAGCTCAC
CAATGTCCTTAGAACTCTGCCTTTACTGATCTCCCTTACCTAATCCAAAA
GATATCCGTCTTAACTCTTAACTGTTCCTAGTCTTGACATTGACAAGCCT
CATATTGTCCTTCCATGATGTGGGTTAAATTGTGGAGTAGTTAGTAAGAT
ATCATATCTTTCTATTTCCTCAATATTCTTCCCTGGATACAACGTCACCT
TCGCGCACGCATGATATATGTAAACAAAATCAAGTACCGCTAGTTAGTGT
ACTTACTATTTCCATATAATTATCATTTAGACTTTAGGAAATTTTATACT
ATGATCAACTACTATGCAACTTTGAGTTTCTTTTTGTAGTAATTTAGTTT
CTTGTGTTTACTTGTGTGCAGGGCGATCAATCTTCTCGTTTTGCCAAGCC
TCCACAAGAGCCACCAAACAACATCCTCTTCATCCAGAACTGTCCAGACC
AGACCTCAAGCATGATGCTGGAGGTCCTGTTCCAGCAGTACCCTGGTTTC
AAGGAGGTTCGGATGATCGAGGCCAGGCCAGGCATTGCTTTTGTGGAGTT
TGAGGACGAGAACCAGTCCATGGTTGCGATGCAAGCCCTCCAGGGTTTCA
GGATGAGCCCCGAGAACCCAATTGCGATATCGTACGCCAAAAAGTGATGA
TTCACAGGATCCCCAAACCGTCAGGAAAAATCTGTGGTCGTAAGATTTTT
CCCACCCTAAGCTGCTTTGAAGCTGATGTATTAGCTTTTTTCTAACCCTG
TATTTTCTTGGAAGTGACTTGCTTGTTAAAGAAGTTTAAGAGAGTCTTTG
CTACTACCTTAAATCAGGTTTTGGGCTCTACGTCGTCTTTGTGCGGAGAC
TGTTATTGTTGTTGCTGTCAAGTCTGGTATCGTGGCCTATGTAGGCTTCA
TGATCTGTTATCTAGTACAGTGGTAGAAGAGGACATGGGCACTGGCTTAA
AAGCAAAGGGAAAATCATCATGAGAGCCTATATGTTCCTCTTGCAGTCTT
GCTGCCTCTGGTCAGAGATGAATGAATGAATGAGGTGTGTATTCGATAAT
ATTCTATTGCCGGAAACACGAAGTGTCACCTCAAGTAGTTGCCGGCATGA
TGCCTTATTGTTGAACAGGTATTTTAGTGGTGGGATGGTTGGTTTGGTGG
CCTGTGTTTTTGTTTAATGGGAGGCGTGCAGCCTGACTACTAGTACCACC
ACAGTATCTGGCAATTATGGGATTGTTGTTGCATTCGTGGCCCTCAAATT
AGGTGCCTATCTTCCCATTCTGTTAACGAGTAGCTTTGAAGTCGAAGAAC
GTGTACGTGTGTGCATGTCTGTATCTTTTAGTGGAGAAGGGAGGTGGTCG
GCTAGGAATGAAGGAAAGGTTTTTGTTGCTGAAACCAACAAACTAATCCC
CCTCTTGTTGAGTTTGCGCACGCTCGTGCAACCTATGCTGGTCCTACCCC
TACCCTGGTTGTTGCGGGTGGCTACAGATAGGCAGCAGCACTAGTAAGGT
AGGGTTGGGGGGTTTGTTTGTTCTTGTCCCGTCAAAATCGCAACGAAATC
TTGTAGCCTACTGCCCCTTGTGACTAGTGTTTTCGTCGCTTAACGAGATC
ATGTGACATGTAAAAGGCGCCCAGTATCTGGTTCTGGTTGTTCACCGGCT
TGCCTGGATGTTTTGGATTTAGATGTCTTGATTTGATTGACTGATGCTGG
ATTTACTCTCTGCGAGCAAGTAATTACAGAGCTGAGCTGTTTGTTCATGG
ACCTTGGCAGCATTGGCGGTTAAAACTGCTGCCGGCAACCTAGTCACGCA
CGCACGCACGAATGAATGGCAGTAAAGGGGGGCAGGGGTCACAATTCACA
GGTTCCGCAACGGGTGTGCGAAGCAACATTGACTGGCTGGCTGTTCCTTA
ACAAGTTCACACGCACTACGCCGGCCGAACTATGGTCGGACCCCCCTCGT
TGAGGTGACAGAGAGAGAGAGAATAATAATTACTCGTAATCGCTCTCCCT
CTTTCTCTCTCAGCTTATGTGTGGCACCCTTGGAGGTAGTCTACGAAGAA
ACAGACCGAGACAGTAGGCAAAGAACACCAAGCCTTACAGACCTCATTCA
GCTCCACCAATCCAAACGTGTACACACAGGAGGATCTCCGTAGAGCTCTG
CACCTTTTACTGCCGGAGTCGAAAGGTGCATGCACCGCCAGACCAGAGAG
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GGTGGTCCGGAGCAATGCCCCTGTCGAGGCACACGGTCGCCAGCGAGTAC
TCCCTCGCCGCCCCACAACTCTACAAGCACGCCGACCAGCGCGACCCCGA
GGCCGTCCTCGATGGCGTTGCCATGGCCGGCCTCGTCGGCGTCCTCCGCC
AGCTCGGAGACCTCGCAGAGTACGTCCTCCTCCACGCTTCTTGCTCCCCG
GCCTGTTCTCTCGCATTTCAGCTTTTTCCTTTTGATTTCTGGGGAACATT
TCGGAATTCTCGATAGCATCTAACGCTTTTCTTATGAACAAATTCTGGAG
GTTTTCGGACTCTTTTTTAGGTGATTGATTGATTGATTCATGTATGCTAG
GATCGCGCCTTTGACTTCCCGGTTGTTTAATCCTTTTGATAGCCTTGTCA
TGCATTAGCTCAGCGAAAACAGAGACCACTTTCTTTTTCCTGGGGGTTGT
GATCGAGCACTACGTTGTCATTGTACTATGACCTCTGTTTTTTAATCTTC
TGTTGCATTCATATGATAATAATAATAATAATAATTATTATTATTATCTG
AAGCCTGAAGGTTGAAGCAAAGACAATACAATACTGCTCCAAAAGTAGCC
AAACCCCTAGAAATCACACCACGCCGCATTTCAGCCGAGCTTGTTGAATT
AATTCCTTTCTTCAGATCGATGGCGATGATTATTGGCATTACTGTTTTTC
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GGGACCAGTACAAGCGTACAACCCAGCTTTAATAACCTTGTTAATTATGG
CTTCAATGTTTCAGAGGTTCTTGGTTTGCACTTAAGCCACATGTTAGGAC
ACGCTAGTTCAATCTTCAGTATAAATATTCTTAGCCTTAGCTTAGGCTCC
TTCTGATGGCATTTAATCAATATGTACTAGTACCATTTACCACTCCTGAA
ATAGGAGACGAAATTCTGTCAGCACATACATTTTCCGCAGCAAAGGATTC
CATTGATGTATGTACCGGTTAAATTTCACACCACAGTAAAGCAATGACAA
ACTGCGAGAAACTACTGGAATTGTGGACAGATGCATCAAAATTCAGAACT
CACCATACTTGTCTGTGTGCAGATTTGCTGCAGAGGTCTTCCACGGGCTG
TATGATGAGGTGATGACCGCGTCCGCGCGGGGGCATGGCCTCGTGCTCCG
GGTGCAGCAGCTGGAGGCAGAGTTGCCACTGCTGGAGAACGACATCTGTC
AGACAGATTACCTCTACGTTGCTTCTAACAAGGGTAGGATCAGTACAGAG
CACAAACTTCCTTTTCCCATGTAAAACTTGTATCTTTCGACTCAAAAAAG
GGCGTTGCTATACAGGACTTGATTGGCATGCAAATGCGAGGGTGGACCAT
GGGGTTGTGACGACAGGAGACACGCCTCGCTTCATCATGGACTCCATGAA
GCGATGCCATGGGCCTCCTAGATTGTTCATGCTTGACAAGTATGATGAGT
TACCCCCGCCCTTTCTGTTTTTTTGACGAGGTGTGTATGAAATCGTGATC
ATCTAATTTTGCTCAACTTTGAGGTATGATATCGGCGGCGAGGGAACGTG
CTTGAAGAGATACTCGGACCCGTCCTTCTTTAAGACGGACTCCGCATGTT
CTAGGAGGCTGCAGGAAGGAATTAGGAGAGAAAGAAGACCAATTAGAACC
ATGGTAATCAACTCTTCGACTCTAGTGCTAATATTGCACGTAGTTCATTT
ATAGTTCTTTCAGTTGTTAACATGTGCATTATCACCCTACTTTAGGAATT
TCGAAGGATCAAGTGTAAATCGGATAATATGCTGGACTAAAAGTTTCTTG
TGCTAATTGTATACATTTATTTATATCTTCCATCGTGCATTTTATAGAGG
ATACTTGGCATATTTTGTTCCTTTTGCAGGAGATCAGGCCGGACCTACAG
AATGCTGACATATTCAGACCTCCCGATGGAGCCAGAGATGACTCCGAGTA
TGACCCCTATCCCCTAAAATCTTGTTTGAAGTGTTAACCTATTGTTCTCT
TCTAATTCTTCTCAAACAAACTTGTCATTTCTCTGTGTAGAATCAAGAAT
GATTTATCCGGTGAAGTTTTGGATGAAGTCCTGACAAGGAGGCAACGATT
GAAGTACCGACAACTAAACGGGTCCGTGTTCCAAAGCTTCAGACCTCAGA
TGCAGGATCTCTATGAGAAGGCTTCACCAGAGGAGAAAACCTTCTCCATG
GATCGATCAGAGGTGCAGATATCTTTCAGCGACTCACCTGATACAACCGC
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AGACCGTCAAGTTGTTCAGATGACCAGTCAGCAGGAAGCAGCAAGGGGTA
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AAGTGGAGACAGACTCAGAGCACAAGGACCATGGACGACGTGCCTTTGCA
TCGGCACCGTCAGGCAAGATGTGCTCTGATGCTCACGGTGTTGCGGTCTC
CAGGTCTAGTACCTTCATTAAGGAGGAGGACTCGCCGATGTCTTGCTCTT
CAGATGTTGGCTCAGAAGATGGGGATGTGGCTGAACACTATGGAGAAGAT
ATCACTGTCTCCGTGCCACATGCCAAACCTGTTGCTGGTGAGCATGAGAG
GACTAGCTCGTCGGAGGAATTGTTTGAGCAAGAAAAGCCGATTTCTTGCG
AGCACGAGAGGACCTGTTCCTTGGAGGAATTGCTCACCGGGGATGTCCTC
ATTTCGGAGCCCGACATGAGAGAATTAGCTACTGAGTCCAGTACTAATTG
TATTGTCAGTGATGCTACATTCTATGGTATGCTTGACACTACTAAAAAGG
CCAAGGGCAACATTTCAACCAAATCCTTCAAGAAAATAGCGAGCAAGAGG
TGTGTCGAAGGCATGGAGCTGTTTGCTTCAAAAGTTGGCATTTTTCCCAG
GAAAGTCTCCAAGAGGCATGATCTGTTTTCTGATTCCCTCCGGAACATGG
CAAAGGAGCTACTTGAGCTCAAGTGTGATGGCACTCAAGATATGGACTTG
TATGGCTACGAAGCAAACGGTGAGGTGTTCGACGTTAAGTGTCGAGAAAT
TCCTCACCATCCTGTTGAAATTATGGATGGGAGTTTTAGGAAAAGCATTT
CTTCTGATTCACATCAAGATGATGTTGTTTCAAGGGAATTCCAGCTAGAA
GAGTCTGATCATGCTGTTCCACCTACTGAGAGCCCCCAAGATTCAGTACC
CGATGAAAATGTGTTTCAGCAGGCCCATGTCTTCTTGACAGGCATCACAT
CACCGTGTGCCCAGGAAAAAGAAGGATGTGAAGGTGCTGTGCCAGATGCT
CATTCGTCCATTGGCATGCTCGATCCTTCACCAGAGATTATTCAAGAACA
GACTGAGGATACACATGCCAAAGTTTTATCTGAAAATGCATCTAATGTGG
GTGAAGAGCTGAAAGAAGTCTGCATTTGCGAAGATCATGTGAATGAGGAA
GATGCTGAGGAATGCAGTGAATCCGATGAATATGCATCAGATGATGAAAT
CACAGAGTACATAGGAGAGGATATGGTTGCATATGGTGTGATCACGTCGC
CGGTTTCATCCAAGAAATGTGATGATCCCTGCCAAGTAACTCCATTTACT
CTCACATTTGCAGAAGATTCTAAAGCAAGTGAAGACACAGACGATGTGAT
GTCAAGTGAAAGCACAGACAACTGCGTTCCCGAAATGGAGCATATCACAT
TGCTGGAAACAATCGCGGAAACTGAACAACCTGAAGCTGTACCTGAGTCA
GTAATCAGTAGTGAGGTTGCCGTGCCAGATAATGAACAGTGTTATCTACA
TCCAGAAACTAGTTTTGCACCAGACACTGTTCTCAGTAGCTGTGAAGTTG
TAGGCCGGGATAAGGAACTGCAGCTATGCAGCTCATCTGTGATGACAGCC
ATTCCAGATCTGAGTACAAACAAAGAGGAAATACATGGATTCCATCAGGA
TCTACCTAATGCATGCAACAGCAGCACCACTGAATATCTTTTTGCAGATC
AAATTGCTCCAGACTCCAGACATGTGCCGCTACCGAACATTTCAAGCTTT
GATTGGATGCTTAGTGGTTCAGTGAAGCAGTCGTTGAACGTGTTTCCTGC
TCAAGAATCTCATGGAATCCTACAAGAAAATCGCTCTTCTGAAGATACTG
AAGATGCCCCGCCGCTTCCACCTCTTCCGCCAATGCAGTGGCGAGCTACC
AAGCTTCAGACAGGATCCACATCTTTATTTGCAAAACTTGGGAAACCGCC
GAGGCCTCCAGTGAAGTACAAGGAAAGTGATAGTAACTCTGCACTTGTTG
AAATATATCAAGAGTCTGAAAATCTCAAGGAAAAAAGTCTGCGTAACAGC
TCTGTTACATCGCAGAAGGAAATGGCACTGCCAGCAGTTTCTGATGGGAT
ACAGACAAACCCGTTACTTGACAGGGATTTTCAAGAAAATCATCTCCATA
AAGGATGCCAAGAGCATGATGTGGAGTCTTCTAATATATCTTCTGCATCA
GAAGTCAAGAGCGTGAGAGACGTTGCTTCAGTAAAAGGCGAAAATCTGAA
CACTTTGCAGCCACCTGAGCTTATAGTAATTCCAGAGGAGGCTTGGTCTG
AATTTGTAGATATAGAACCAATACTGCAACAGGAGAAAGAGCGAACACGA
GAGCTTAGATATGGACTTTCTGACTGCGATGGCATGCATACTACTGGTTT
GCCAATGGAAAATACCGACGTGAAGCATGAAATATCTGATCAAAAGGAGA
ATGAATTACCAGCTGCATATAGCAACACAATTGCCGATTCAGGAGAAAAC
AAATCAAATGTGCTTCCTAGTAAGGATGATACTGAAACCCCTGACTTGTC
GGTACAAAAGGAAGATGGAGAAGATAATAGTTCCAAGGACAGTGCTAGAG
AGTTCTCTTCAGGAATAGAAGAAGAATTAGCAAAGATTGACGTGGAGTGT
GAAAGATCTGATCAAAAGGAGAAGGAATTACCAGCTGCAGGTAGCAACAC
AATAGCTAACTCGGAAGAAAACAAAACAAATGGGCTTCCTTGTAAGGATG
ATATTCAGACTCCTGAGTTGTCAGCGCAACAGGAAGATGGAGAACATGGT
CGTTCTGATAACAAGGCTAGGGAGTTCTCTTCAGCAATAGAAGAAGAACT
AGCAAAGTTACCTTCTGATCCAGTACCAGAACCACCTAGATATCCTCTGC
TCCAAGTTATTTCTCATGATAGAAGCATGGTATGCCTAATTTCATGGTTA
GATTATTTATAAAATACTTTAAGGTCTTCACCTGACGATATTGACAAATT
TTTCCTTTTCGTGATTTAGCTAAGAAAGGCTCCAACTTTGGTCCAGCCTT
TAAGAAAGCTTTCAGATGAGAAGAACACGATGCTGGAACAGATAAAGAAC
AAGGTATGCAGCCTTCACATCTGCACTTAAACATTCTCGCCGTTGAAGCT
AGATCGTATCCTAAATACAGTCGTACTTTGTTTACAGTCCATCAACTTGA
AGCCGGTTGTTGCAAAGAGACCAAATGTGATGGGCGGTCCGAGAACAAAC
TTACAAGTGGCTGCCATTCTGGAGAGGGCCAACGCGATTCGCCAGGTTGA
CCATGTTGAATTCATCCTGTGTACATATTGCTACAAGCTTCAGCTGATTA
TAGCTTTTATCCTATGATGTTGATATGTTCATTATTGTAAAAACAGGCTG
TTGCTGATGACGATGACGAGGATAGCTGGAGCGAGTAGCTGATTCCTCAG
AGCAATTTGGGAACGCTCGATCTTCGACAGGTTATGCGCGGATCCAGGTC
TTGTAGTCATGTTCTTGCATGGAGAAAATTATGGAATAGTCACTGTATTT
CATTTCTTTCCTCGAGAACATCATGCCAAGACTGTTGACCTGTGGCAGTG
AAGTATTTCGCCCTGTACATAGGAGACGCAACGCTGCAGAGATCGCCCTT
TCTCCCGTTTGGCCTTTTGGAGGCACATCACATGTCTATGAATCGTTGTT
CTTTTGATGTTTACTACATCCTGAAGGTCGGTACGCCTCATAGAGTCATA
GGACTAGTCACTAGTGTGATTATTTGTTACTCTCTCCGTTCGGAAATATA
AGACATTTTAGCTTTGTGACGTGAGAGTGTATATAGAAACTCAGTGCTGC
ATAATCACGCAGTTTATAATACTTATCTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.