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GrainGenes Sequence Report: AE042501

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Sequence
AE042501
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE042501
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGTCCCCACAAGTCAGCCTCCGAGCAGAAGCAAAGCCGCACACCGACCA
GGCGCGCCCCCGACTCGTGGCACCTGCGGTCCCAAAACCCCGCGCACCGA
CCGCAACCAAAACCCTCGACCCGAGTCGCCTCCTCCGCCCGCACCCGGCG
CCTCTCTCCTCCCTGCTCGCCGCGACCGCCGCCATGAGCGCCGGCTGGAG
GACTCTGCTGCTCCGCATCGGCGATAGGTGCCCCGAGTACGGGGGCTCCG
CCGACCACAAGGAGCACATCGTAAGTCCCCCACCTCGTGCTCCTCCCCCC
CGCCCTCCTCCCGCAAACCCTAGCCGCCGGTCGCACTTGTCTGGACGGGT
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TGTCTTCCACACCTGTTCTGACAAAACTTTTGCTTCATAGGATATCTGTT
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GTTGGTACCCAACATTCTACTATGTTCTTGATCAATTCTTGTACGTTCTC
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TATACTTAGTCTGCTAAAACGTCTTAGTATATACTTAGTTTACTAAAATG
TCTTATATTAGTAAACAGAGGAAGTAGAGAATAGATCTTACAAGCTGCAT
CCTATAGCATTTGCTTCTTTAATGCCTTCGATAAACATCGTTCTTTTCTC
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CTTCAGTGTGCAGAACAATTACCTCACAAGATTCCCTTCTTTGGAGTTTT
GGTATGCAACTATTTACCATGAAGCCTATGTTCTCTTCTTTTATTGATGT
TACTTGTGGATCAGTTTAAGTCCTTACAGAATCTCAATACATACTTGTTC
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GCTTTTTTATATGATTTTAATTTCTGTTGGCATATATTTTTATGTGCATA
TTTTCACGAGAGGAGAAGGCTTTGTCTATTTTTTTGGATCAACTTATGAG
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AGTTTTATAAATCTCAAATTAAATTAACTGTTTCTCTGCGTGTTCTAAGA
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TGATGGTTCTGTTTTGTTTTTATAATGTCAGGTAGGTTTGGTAAACTTAG
AAAATGAAGATTTTGCCAAGGGTATTGTCGATACAACACAGGCCAACTTA
CAGGTATGCATTTGTTTTTTCATCACAGAGCATGGCAGTACCTATTGGAG
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AAATACGGATTATCAAATAGTTCATGCTTGGACCTTGGAGGACAAACTTT
GGTTCCTCCTATAATCATCCTAGCTTTGTAATTACTGGTCATGGTTTCAG
GATGCCTTGCATAATGAAGACAGTGACAGAGTCAGGATATTGCTGCGATT
TCTCTGTGGCCTGGTAAGTTGCAGTAGTTTTGGTTTGATTTTCTTGCTGC
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TATTTCATATCTGACATGCTGACATGTTATTGACAACATGTTCATCAATA
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CGTATTAAATGAATTTGCTAGAACACACAGCAACAGTTAATTGCACGATG
TAGTCTCATTTGTAATTCTATAAAACTATAAAAGTACAAATGACAATCCA
ATAAAAAAAGGAAGGATTCTGAAGCAATGCTTATTATTTTGTTGGGTTGT
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AACCGCAAGATTCTGCCAGGAATGCAAGTGCAAAAACTGAGGTACGGGAG
CAAGGTAGTCTTTTGGGTAGAGAGACAAGAAGACTGCCTTGGTTGTAAGA
AAATTGGGTAATAAAGAGTGGGTTCAAATTCTTATGTAAATATGGGCATA
GGAATCTCTTGACACCATTTGCATGTGTGTTAGTGACAGCTTATTTTGGG
TAGCTTTGGCTTCTCCTGCACAGAAGTTCAGGCGCTGCTGCCCTGAGATA
TGATTTTGTTTGATTTATCATAATTCTTGTATTTTAAGAATGCAAAATTT
TCATTTGTTCAGCAGATTGTTTGGCGCAATTATACCATCTTTATGCTAGG
CTTTGGTATCTCCTATTGTTTGTTGAATTGAGTTTCTTACTCTATTCTGG
AAAAGAGTAGATGGATTTCTATCTGCCCTCTTTATTTCATGGTAGAAAGG
TTTTCTTGTATTTTGTGCCACATAAATTGGTTAATTTGTAGCATTTCTGT
TGTCCATTACCCTTCGTCTTGTAACTGTGCATTTATTTGTGTGTTGTAGA
TGTGCAGCAAAGTTATATTGCCAAATTCCATTATTGAGACATATGAGATA
ATGTTATCAGCTGCTGCAACGATATTGGACGAGGAAGCTGGAAATCCTTC
TTGGCAACCACGTGCTGATTTTTATGTTTATTGTATTTTGGCGTCCCTTC
CATGGGGTGGTTCAGAATTGTTTGAGGTAACGTTGTTACATTTCTGCGAT
TTACTGTTTAAACTTTATCACCTTTCGTCAGATATGAGTGATCTAGCAGC
ATACCTGCTTCTAATTCTCTGCTTGTATGAATCTTTGCGACCTTTATTGA
GCTATACTGTGAATTACTCCCCTTTTGGAAGTATGTATTGTGCTGTTCAA
TCTGAATGCTTCTTAAGAGGTTTGCTGGCACTGCTATTGTGCGTATGTTA
GTAGCTTAGTGTATTAGTGTCTGTGCAATGTTTAGTTTTTAGATCTTTGG
AAAGATATCTTTATTTTGTAAAATATCAGTCCATTTTATGCTGTTGTCTA
TTTATTCTATCACAAAGCGAGACTCAAGATACGAAACAGGGACACTGCCC
CTTTAGTAAGTAGTAAGGGGCGTGTATGATGAACTGCTCCAGTACTTCGT
CCCTAAATCTCAAGGATATGGGTAGTACTGACCTTGAAAGTCTGTCTGTG
TTTGCAGCTCAACAGGAACATCACCCATGATTTCATTTAGACCTTTAGCT
CTATAATAAAAAGTTCTACGCTCCTATATTATAGTTTCAATTTTAAATTG
TGTATTTAGAAAAAGGCATGAATTGATGTTACACTGATGAATTATAACTT
GCAGCAAGTTCCGGATGAACTGGAGAGGGTTCTGGTTGGTATAGAGTCTT
ACATAAGCATCAGAAGGCATTTTGATGATATTGCTTTCTCAGTCTTCGAG
ACGGATGAAGGCAACTCTCCCAATAAAAAGGTACTGATGATTTCTTTATT
ATGTGATCTCCTGAATTCTGATCAATTGAAACTCCTATGATATTTATATG
AGGTCTTTAACTTATATTCCTTGCAGGATTTTATGGAAGATCTATGGGAT
CGTATTCAAGTTCTTTCTCGTAACGGCTGGAAGGTTAAAAGTGGTATGTC
AGTACATGATATGAAATACACATTTTCTTACTGAAATAATATGTTATCGA
GTTTCACGCAGTAGTGTTAAATGACAAGACAACTTTTTCTTTGTCCAGCT
CAGGACTGATTGTATACATAATCTTAAACATGCTATTGCCTAATTGTTTT
TCATTCTGTTTAATTGCTCCCTTGCAGTTCCAAAACCTCACTTGTCGTTT
GAAGCTCAGTTGGTAGTTGGAAAATCTCACCGTTTCCCCTCAGTTAGTTG
CCCACCGCCTATTTTCACGATGTCAGTTTCTGAAATATTAAAAGGGCAAG
AAAAGCATGAAGCCAATCTAAAGTATCCTCAAAGGCTTCGCAGGCTTCAT
ATATTTCCAACAAATAAAGCTGAGGTAATTTGCTACTTCATGTTTTAGTC
CATTGATTATTGTTACATACTTGTATTTAGTGTTTCACTTGCTGTGTCTT
CTGTAATGTATGTAAACTGATATGAAATTAGCATTACTTAGTTTTACATT
ACAAAGTTCGTCTTTTTCTGTTCTTATCATTATCATGTCTAATCAGCTAT
CGGTTCCTCACAGAATATGCAACCTGTAGACCGTTTTGTCGTCGAAGAGT
ACATATTGGACGTGCTTCTTTTCTTCAATGGATGGTCAGTTACAACTTTA
TTCTTTCAGTATCTTTTTTTATGTTCGACACTTCCAGAAAAGCTGCGGTT
GTTGGATTCACGCATATGTTCGTTAACCTGTTCATGCATGACACCCGATA
CCATCTACTCACTGGATTTGCTTATCAGTCCTTCGTGTGAACACACCATG
GTGGTTCCTAACTTTCAATTGCCGAGTCTTTTGTTTTCTCCCTTTACTAA
CAACCGGTTGTATTTGGACATGTAGCTTTTGTCTATTATCTGTTGTAAGC
CCTAGGGTTTTCACATATAAACCTTATTCCCACAGTATGCAGTGGAGGGC
TTCTGTTTTAACCTAGTTTTTATTTTGCTAGAACTAATGCCCTTTATGTT
ACTTACAAAACCTTGCCACAATTTGTTGCAACAGTGTGGCAAACCATTGT
TTTTGTGGTGGGCAAATCTTTTGCCACAAGTGTGGCAACAAATAGGTCTT
AAGATAGTGTATCGTGCTAAAGGTTCCAGAAGGAACTAGACACAGCATAA
CAAGGTCAAACTCGCCTCACTCAAGTGTGACAATTTAACTTTCCTGCTAG
CATGCTAGAATATCAGTTTATAAGTGCAATAATTAGAGTTCACAACATTT
GTCAGGCTCACAATGGGAACATTCGTGGTTTTGTGTTAATATTTTCGTAC
TGAGCTGTATTATTTCAGCTTTCTTACTAATTCTATCTTGGTTATATTTT
TTTTGAAGGACAGTCGCAAAGAATGTGCGTTTTATCTGGTCAGCCTTCCT
GTGCCTTTTCGGTATGAATACCTGATGGCCGAGACCATATTTTCACAGGT
ATTTCTGAACCATCTTTGTTGCAAGTGTTCATACTATTAATAGTTTCTAC
ATGCCTGCTTTCATGTTAAGTGAACTTTATTATACTTAGTTGTAAAATGA
ATATTTTATGTTCTTGCATTCACTTTCTAACACGGTGATCATTTAGGTTA
ACCGCCATGAGATGGGTGGTAAACTTTGCTTTTCTGGGTGCATGGGTTGA
ATTTCGTCCAATCATTTCCCAACGACTTGCTGAATAAAACCTATTGTCTG
TAGCATGCACTGTTCTAAGCTAATTTTAGATTAGCTTTATAGATATTATT
AGTCACATATTGAACTCTTAAGTTTTAGTTGATTAATTTACACAAAAGTT
TAATTAAGGTTTGGAAAATTACTGTCAGCTGATCAATATCTATAAGTTCA
CCTATGTTTACATTATTTGTGGAAGATATGGTTCAAAGCTTTTGACTTTT
TAAGACCATTTTTTGTGTGAATGTTTGCCAATTTGCGATTTGTCTTCATA
TTGATATATACTCCCTCCGTTTCATAATATAAGATGTTTTAGCTTTGTGA
AGGAAATGTATCTAGACTACTTTTAGTGTGTAGGTTCACTCCGAACCTAC
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TATTTTGAAACGGAGGGAGTAGTATGTTGGGGGCCATTAGACACCATATT
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GATCTACTGAATTTGGATATAATAAATCCAAACTGTAGTTTTTTCAGGCT
GTTTTCAGTTTAGTAAATTTCAAGATTCCTTAACAGTGTCTTGATTATAG
CATGCCATTATAGCGTGTGCACTTGTCAAATGATGATGGATATCTTCCAA
TGACTTGTATGATATTTTGCAGCTTCTACTACTGCCGAATCCACCTTTCA
GGCCTATCTACTATACATTGGTTATCATTGACCTTTGCAAGGTAGTTCTT
TTAAAGCTTTGAGACTGGTTAGCTAGTATTTTCTGTATTACAGTCGGGAA
TCAATGTAGTTCCTAGACTAGTATGTAATGTGAGATTTAAGATTATGTCA
GTGTTAATGGACAAACACTTAAATTTTCCTTGTGTTTAATTATGCCGGTG
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GTAACTGCTGTAGTTACCATTAGCACTCACGTGAAAGCCACAGTAGAGCA
TCTTATGTCTCTCTGTGTTTGAAAGAATTCTATTATGATGCTATAGTTCT
TTCTTTGTGAAAGTGTGTTATGCACATGTTCTCTAGATCTTGGAACAATA
TAGTCAACACCAATGTGGATGTGAAGTTGCGTGGCACCCTTAAAAATTAC
AATGTGTTCACTTGTATGCAAGTATGCTTCCATGAGCTAAGGTTATCACA
AAGTAATCAACTTTTTGTATGGTGCAAAGCAATTTTTGAGTTCTAGTAAA
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TGGTCGACTTACCTTTTTCCCTTCCCAATAAAGAGAATGTTTTGCTTTTT
TTCCTCGAGGATGACTGGAATGAATCTAACTATCTTAAAATGTCTTCAGG
CTTTGCCAGCTGCATTTCCATCTGTCGTGGTAGCAGCAGTACATGCTCTT
TTTGACAGAATTAGTAACATGGATACGGAGTGCCGCACCAGACTTATCCT
ATGGTTTTCACACCACTTGTAAGCTCATTACTATGTATTTTTTTATGAGT
ATTCCTGCTTAGCTTATTTGTTTACCCTAATTTAAGTTTGTTAGAACTTA
CCGTGGCCTATTGGCTATTGCTTGATACTCTTCCTGTTGATGTCAATACC
CTAATGATGTTCCACTTCTGCTGCTGCTTAAAAAAATCAATGAAATGTTA
GATACAATGCTATATAGTTTCCAAGGTAACTGGTTGCGGAAATAACTGGT
CTTCGAACAAGTTTGATTGCTTATATCACTTTAAACAAATTGTAGTGGTG
TACCACTAAATTGTAATGAGATATTATCTGCTTACGCAGGTCAAATTTTC
AATTCATTTGGCCTTGGCAGGAGTGGGCCTCTGTCAAAGGCCTCCCAAAA
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TGCTATTTGATTGGGAAAAAGTCCTTTTACCACCCCTGAAGTATTACAGT
TGTTTGGATGCCGCCGATCTGTTTTTTTTTGGTCCAGCTTACTTCCCGCA
AGTTTATATACCATTTACCCCCTTACCTGTGGTTTAGACTTGTTTTGCTG
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CCTGCACACCATGTGCGTAAGTATGGGGACAATCACTGAACCTTTTTTGC
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GATGATGATGAACACACACGCAGACACAGATTTACCCAGGTTCGGACCCC
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GACGATCCCGACGAGGCTATGGTGGACGACCTGAAGTGTGAGAAACCCTA
GATCGGTCTTGGGTGCATGGGTGCTTCTGTGTGTCTTGGAAGGGATGTCC
CCTTTTGGAGAGCCTTGGGTCTTCTTTATATAGGGGGTTGGAGGAGGTGC
CTTGCACTCCAAGTCTTGTATATCTCCTTCCTTGTTAGGTTCATCCAGGA
GTCCAGGCGCCGCACCCCAAGTAGGTCGATGCAGCCCGTAGCGGGATCCC
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GGCTGGCCCTGTATATCGTCGACACATCCCCTCCAGAATCGTTGTGCACT
TCCCGTCGTCTTTGCTCATATTGCACCCTCAAAAACCGTCACCATCTCAA
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TCTTTCACCTGCATTGACAAAACCACAATATAAAACCAGCATAGAGGGTT
AAGTAAAACTTGGGGTGCACACAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG
GTGTATTCGAACAACTTCAAACTTCAGGGTTGTAAAAAAAGGATGTTCCC
TTTTGATTTCCATGCTTCTACTTAATTGTCTCTGTCGACTGGGAGGCGGA
TATTTAATCAATTATTTCCTTCATCTCTTTTGCAGAGTATTGAGGATGCT
GCTGAGTTGGAAGGATTGTTACCCCCAAAAGCTGGGCCTAATTTCAGATA
TCAAACTGATGAAAGCAAAGAAAGCACCGACAGTCACAGGCTATCGAAGG
AACTTGTTGGCATGGTTAGAGGAAGGAAGACTACACGTGATATTATTTTG
TGGGTTGAAGAACAAATAGTTCCTGCAAATGGTGCCAAATTCGCGGTTGG
TGTTGTTAGCCAGACACTTCTCGACATTGGTTCAAAAAGTTTCACCCATC
TTATCACCGTTTTGGAGAGATATGGTCAAATAATTTCCAAACTATGTCCA
GATGAGGAAATGCAGTTGTTGTTGATGGATGAAGTCAGTGCTTACTGGAA
GAACAGTACCCAGATGACTGCTATAGCTATTGATAGAATGATGGGTTATC
GCTTAATTTCCAATTTGGCTATTGTCAAATGGGTTTTCTCTCCTGCTAAT
GTTGATCAGTTTCATGTGTCTGATCGTCCATGGGAGGTACATCCTTTTTA
TCCTCATATTCATCTACTTTAAATTGCGCGTATCCGAATGTGGTGATAAA
TATCAACCAAATCTGTTTTCTGTGTGTTATGCTCCTGAAGTTGATGACAC
ATTCAAAAAGTTTTATGCCTTGTGCTATTAATGCAATGAAGCATTTCTTC
TGCCAATGTCGCACCCAATACGTTGCACTCCCTCCGTCTCAAAATAGATT
CTTAGGAACACTAAATAGTCTAGATACATCCAAATTTAAACAAACTTGTG
ACGTCTATTTTGAGACAGAGGGAGTAATATTCTTTTTGTTGAATCTGTCT
GATCCATGCCCTCTTAACAGATTCTTAGAAACACTGTTAGTAAGACATAC
AATCGGGTCAGTGACCTTCGGAAGGAAATCCAAACACTCAGGAAAAATAT
TCAAGTTGCTAAAGAGGCTAGTGCAAAAGCCATCAAAGAGTTGGAGGAGG
CTAAATCAGTACTTGAGGTCATAGAGGGCCAACCTGTGCCATCTGAAAGA
CCAGGCAGGCTAAGACGACTTCAAGCTTTTGCTGATAAAGCAAAAGAAGA
GGAAGTAACTACTGAAGATTCATTAGAAGCAAAGGAGGCTCTCCTTGCTC
GGGGGCTTGAAGAAGGCAAAGTATGCTACTCTCTTATCTTGGTTTATCTT
ATTTTTGTGAGCCCTTGCATGTCTGTTGATATGCATATTTTCCGATCTTC
CAATTTTCAGTTGTACTGGCTGTGCTATGCAGAGTTGAGCATCGTTCACA
TCAACTTACCCATTATCTTGCCATGTGTTTTGCAGGAATTGCTTAGATTA
CTATTCAAGAGCTTTGTTCATGTGCTTACTGAGCGTCTCCCACCTGTTTC
TGCTGATGGAGATGTTCCTAATTTACGTGCTGGAGATCCAAATGTAACTA
TTCCAGCTGGCGATCCTGAAGTGGCAACTATGGAGATAGACAATGAGAAT
GGGGCAGATAACAATGGGTCAGTTCTTTTTACATTGGGCCAGTTTAGAAC
TCCAGGTGTCCTGAAAAGGATGTCGCAGATTTGTCTAGATTTGCATGTAT
CTATACACTAAAACACGTCTAGATACATGCATATTTAGACAAATCTGCAA
CATCCTTTTCAGGACGGAGAGAGTATTTAGTTTCCAATGCCTCTTTCAGA
ATGACTGTTTTTTGCAAGTTTGGATTTACATTTGGAGAACCTGCTGGTTT
ATTGTTCAGTGCTTATTATGAATAATTTGTGCTAACACTCGGGGAGAATT
CTGTCTTTGAAATAAGGCAACAAATATTGGGTCGTGGATGAATTAACACC
TGCTGACCAGGATGTTAGCAACTGCTATTTGCGTACAATGATAAGACAGA
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GTCTAGATTCGCATGTATCTACTCCCTCCGTTTCAAAATATAAGATGTTT
TAGCTTTGTGAAAGAAGTGTATCTAGACCCCTATTAGTGTGTAGGTTCAC
TCCAAACCTAGATGAACCTACACACTAAAAGAGGTCTAGATACACTCCAT
TCACAAAGCTAAAACATCTTATATTTTGAAACGGAGGGAGTATACACTAA
AACGTGTCTAGATACATGCGAATCTAGACAAATCTGAGCCACTTATTTCC
AGACGGAGGGAGTACATGCTTTATGGTCTCTACACTAACTTATCTTTATG
TTTTGACAGTCAACTGAATGGTCAAACTACAAAAGCTGGTTACAGTATTG
GAGAGCTAGAGCAGTGGTGTCTATGCACATTGGGGTATCTCAAGTCATTT
TCTCGACAATATGCAACTGAGGTAAGCACTATTGGTGCAATTGTCTAAAT
AGTTTGTTCCTTGAGCTGATAAATCCATGAATCGGTGGGGACTTATCATG
CTTTAGTATGGATACCACGTCTTAGTTCTGTTGAAAACTGTTGAGACAAA
TTGGACTTGTCCAGTTTTGGAAACCATGAAGTAGTACGGTTTAAACTTGT
AACAATGTGTAGTACTGTAGTACTACCTCTGTTCCACAATATAAGCCTTT
TTAGCAAACTAAAACAGCTTGCTAAAAGGGCTTACATTTCGGAACGGAGG
TAGTATTTTTTAATATTCCCTCCATCCCAAATTAATTGACACAGATTTTG
TCTAGATTCGCATGTATCTATATACTAAAACACGTCTAGATACATGCGTA
TATAGACAAATCTGCGTCAATTAATTTGGGACGGAGGGAATACATTAGTT
CATTGCGGAGTTGAAAAATGGCTAGATACATGCGTATATAGACAAATCTG
CGTCAATTAATTTGGGACGGAGGGAATACATTAGTTCATTGTGGAGTTGA
AAAATGTCTGATTTTTGTAGTGTTCCAGAGTACACTAATTAGATACAACT
ATATATGTTGCAGATTTGGTCTCACATTGCCTTGTTGGATGAGGAGGTTT
TCGCTGGGAGTGTCCACCCTCTTATCCAGAAAGCTGCATTCTCCGGTTTG
TGCAGATCAATTAGCGACGGCTCTCACCTTTGATTCATGACATCTTCAAA
ACTAGTGTTGTAATTCACATGTATCATACCGAAATACAAGTTTTAACCAT
CCTCCACTAATTCTGACGTGTCTAGAACACTACACTTTGCTAATGTCTCT
CGAGAATGTCCTCGTTTTGTTTTGTTTCATTTCATTGTTTGGTGAGGTAT
TGTATGTGGACATATGTATTCATCAGTGACTTGCGTCGGTTGGTCCTGGA
ATGTCATGCTTATCGGTGGGCTGGTGACATGTAGTACCACTTTCATACTC
CCTCCTTGCACA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.