Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE046779

[Submit comment/correction]

Sequence	AE046779
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE046779
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCAGAGCCCCCGCCACACTCTACTCACTCCCTCCGCCTCCCAGCCAGAA ATAATTTCAAACCCTCGTCTCCGGCGACGTCGGCGGCGGCGCCATGAACG TATTCGCCGGTGTCAGCGGCCGCGCAGGCGCGGGGGAGGGGGCGAAGGAG GCGGGATCCGCAGGCGGCGAGGCGCTGCTGGAGCTGACGCCGCACAGGAT GGCGGTGTGCCACCTCGTGCAGGTCTTCGCGCCGCCGGCCCAGCCAGAGG GGCCCGTCACGCTGCCGTTCCCCTTCGCGTCCGTCTCCGATTACAACCGC CTCGGGCTGTTCCTCTTCTCCCTCACCCGGGTACGCACGCGCGGACGCTT CTTCTCCCTCCTGGCTCTCTCTGTCTACTACCATTTGGGCGCTGTCTGTG ATATCGTGTTCCACATTGAGTGCGGCTTGCCTTTAATCATGTGGAAACTA GCATTACCGTTCTCTGTAAGCCCCGTTGCATACGGTAATTAGCGTCTAAA TGTAGAATGATGAGCTGCTTAACTTCTGGGTGTGAAGTAGTATCCATGTG GTGTCCAGCAGCTACAGAGAAGTAGTGATTCCCTATCTGCTATTCAGTAA AGCATCAGTTGTTACCAGTTTATCCGACATTATTATTATGATTTCCAATT AGCTGGAAGCATACTTGACAGCTGATGCAGCCACATTATCATCACTTCAC TATAGCTTTGCAATTGCAGCATTGCATATATTTGCAATTCAGACTTGGCT CAAGAGGATGTTCGTCTATACATTTATGATTGATCATTTGCGTGTAATTC ATCCACCTGTTTTGATTTGTATGATGAGATGTTGTGAAGTTTGTGGCATG TGTGTATTGCATTGTAGGTTTCATTTTCACTCATATATGTCTTAACTGTT TACCTTATTGTTCTTGTAGTCATGTGAGGATTTTCTGGAACCGCCACTGG AAGAGCTTTTAAGGCAGTTGAAGGTGGTAGATGATTTAGTTAATGGTTGG CTCTGTGAGCAGTTGACAACTACACTGTCAGGGCTTAACTCACCGGACGA TCTGTTCAATTTCTTTGATAAGCTACGAGGTGAGATTAGCATCATGGATG GATTTTCGAGTCCTTGATACTTACTGCTTGATATAAGGCTCCCAAATAGA CTACTTAAACTCCAATGGTTTCTGCCAGGTGTGCTCGCTTCACCGGATGG TGCAAGTGTGGAAGACGAATTTCTGGATTCTAACAGTCAGCTTGGAGTTT ATCTTCGTTGCTGTATACTTGCCTTCAATCAAATGACTTTTGAGGTGCTA CAAGTAGAATATGGTGTTCACAGCCCTTGTTTTTTGATACTTTTATGCCC TTCTCTTTTCTTATTTAGGGTTAGGGTACTAAGTGTATTCGCTGAAAATT CTTGTAGGGTGTCTGCCATCTGTTGGCAAATCTCGTGGCGTACTGTAACT CTGCTGACACTTCATATGATATGGCAGAAGATGAGGATTTTAACAGTGAA ATGGAAATGAGCGACCTGATGGATGCAGATATAGGTGTTAGAGCTGGAGT ATTTGATAAATACGGTCAAGGTTATGCCTCTGAGAGCCATATGGGGGAGA GCTCTACGTCTTTTATCCATGCACCAATTTCACTCCATGATTTTGATGAA GGTAAACTGAACCCTAAACCCTTTAACCTTTTCATTTTGATGGGACTGTG GATTTTCTATAAGAAGCCAAGAAAGAAAGAATACAATGCACACCAGAGTT ATCTGAATCAATTGCAGCTGATTAGAAAAAAAAGAATGTAACGAGCACAA CATGGAAGAAAATCTAGCTCAGAATCTAGCATTTTGTCTTTTTATTGTGT ACTGTCATATGCGATCATGAAAAGAGCTATCCACGACCTGAATTTGTACT GATATTAATGTTATAAACAGCATCTAATATAAGGACATTTTTTACTCCAA GCATGTAATGTTTGCTGCCTAAGAAGCCATCTTGACATCTTATAATAGAA AAATGCATGCAACCATGACACCAATTTCCTCCCAACACGTATTTGAATAA TTTAACTATCTAGCTGGGTCACAATTGCTGCACTTGCTTTTCTGTGGCAT AATGTTTTTGGTTGTAGTAACACCAGCCTTTGTGGCAAAACGTCCATGCT GCTTCTTCTCATGCCATTTGTGTGCTGAAAGGTGGACCAAACATATGCAA TCTATTTGTGGGAATTACTTTTTGTTTTTCCAGACGGGCAAACCTATTTA TATGAAGTATTTATATCTCCTTTTGCCAGCCAATATTTTCAAAGCAGATG ATAATCCGACTTGTCTGAGATCAAGGTGGCAATTAGAGGCATATCTTAAC CAGCAAGCTGACATTCTTGAGAAGTGAGTGTCGCTTCTTACATTTAATCA GCTAATACCACCATGAACTTGTAGTACTTACTGAAAACTAAAGGATATGT GCAGTTTCTTTAACAGCAGCCTTTTTGCTGCAGGAATCCTAGCTCGGTGC CTTTGAATTCATTTAATGCAACTATGACACAGCTTCAGACATTAGCTCCG GAACTTCATCGTGTAAGTTTTGGCACAGTATAATACATCTCATTCTTGAC TATGCAGGGCAGTGAACAGATCCCAGTACTTTTGGTTTATTTTTCTGCCT TTATTGTACCTGCCAGGTCCAATTCTTGCAATACTTGAATGCTCTGAGCC ATGATGACTATGTTGCATCATTAGACAATCTTCACCGCTATTTTGATTAC AGGTCAGTCCTAGAACCCTGACCATACTGTGGGAAGTGCTCAATATTTTG ACCACCTTTTTCTATGATTGAATGTTACGTTTGGCAAGTCACCAGCTCTT TTCTGTGATTGATTGATGTTTTGACACCTGTTCTGTCCATTTAAACAAAT ACCTGATGGCCAGGCCTGACAACATTTTTGTTAATTAATCAATGCCTTTA AGGAATACAAGAACTAACATGTTCTCTGTCTACAAGGGCCTTTGTCGTTG TTCGAGAATTCAGATTTCTAGTTACCAAGACTGAATTGTGATAATGGAGC ATGTTGATAAAAACCTACTGTTGAAGCATATATGCAAAGCAAAACTACCA AAAAGACTAATTTGTTTACCAGTGTGCCACTTTTATTACCCTAGTTTTAG TGTTGCTCAATACTACTGCTTATTTCTTGGTCTTCTCACTAAGCTGAAAG GTTGGAGTCTTTTGTCCACAAGATAATAGGTGATAATGATATGTTGCATA TACTACTCCCTCCTAGAAATATAAGACATTTTAGCTTTGTGAAACGAATG TATCTAGATGACTTTTGTGTATAGATTCGGAGTGAACCTATAGACTAAAA GACATCTAGATACATTCGTTTCACAAAGCTAAAATGTTTTATATTTCTGA ACAGAGGGAGTACATGTTAACATCTTGCAAATATGTTCTTTACTGGTTAT ACTTTATGATGGTATAGTGCAGGAATGCCAGGACTTTTTAGTCGTTCATT GTCTCCGAACCAAGATATTATTGTTGGAAAATATGAGAGTGCCCTGCTCT GCTTAGGTAACTTGCATTGTTACTTTGGACATCCGAAGAAAGCCCTAGAG GTAATATAAGGTATTGGTTTTTTTCTTGTTTTCTTTGAGCAGCCTATCAC TTCATTGGCTTATTTGCACATTGCTTACTGTTCTCTTGGGTTGCTTTCTT CCAGGCATTCACAGAAGCAGTGCGTGTTTCTCAAATGGTTAGTTACTGAA CTGGTCTATTTCTCAAATACAATTCTATGCAATTATTTTGGCGTACATAT CACATTTTCTAGAGATATGTAAATATAATGCAAGCTGCTCTTCAGTTTGC TACTTAACAGATGCTATAATTTGTTTTTCCAGAACAATGATGATTCCTGC CTTGCATATATATTAGGAGCCATTTCCAATCTACTATCAAAGATAGGCAT ATCAAGCACAGTTGGAATAATTGGTTCTCCATATTCACTTGGAAACAATA TTGGACTAGGCATGCCGCTGTCCATTCAGCAGCAGTTGCTTGTTCTTTTG AAGCGATCACTTAAGAGAGCTGATATGTTGAAACTTACAAGCTTACTATC CTTTGATCACATCTCGCTTGCAAAATTTGATCTGAAGGTAAGATCTCGGT TTGATAATATTTGACTTCAGTTTTTGATGTACAGTGTAGTTGTGGATTTA TTTAGCTCTGTGTCAGGCATACGTTGTTTGATCTTGACCAGACTAGAGGA CTTTTAGCATGTGTTCTGATTTGGTGTGTTCTTGTTGATATGACTTTTTT CTGACTGTAAACGTTGGCTTACCAGCATGTTCAAAGGCCATTGGTGTCGT TTGGCCCTAATGCTTCTACAAAGCTTAGAACATGTCCTGCAGATGTCTGC AAGGTATGTCACACTTACCCTGTACTCAATAATACATTAATACCACACTC AAGTCACTCATCCTCGATATAGAGGATGTATATGTTTGGTTATAAATTAA TTACTGTTTTGTCTTATGTTTTATTGCAGAACTTAAGATTAAGTTCCCAC GTGTTGTCCGACTTTGGCGCAGATGGCTTAGAAACTTCACATGATAATGG TAGTTTCAGCACCTCGTGGCTTAGGAATCTGTCTGCTGCTTCCAGTTCTT GGGGTAGCAGCTCAACAAAGCCAAGAACACTAATTGCAAATGACTTCGAC AATTTCCACTTCAATGCACAACCCAGTCCAATACCTACATCAGTATTACA ATTAGCTGGTTCAGCATATTTGATGAGGGCCACTGCCTGGGAGCACTATG GAAGGTACTTAACTGTTCTCTGTAAATGTTTACTGTAAAAATGCATTTTC ATAGCAGAAATTGCAGGTTGTATACTGATTGTTCCAGCTTGGCACAGTAT TGTGGATGTGTGGGGGAAAGGGAGCAGAGTGGTTGGATAAGAAATTACCA AGGGTCCCAACTTAGAAACTGCAAATACTTAGGTCGGATGCTGTTGGTTT ATCGATTGATACTGCTAAATATTAGTCCTACTTTTAATACTACAAACATA GGGATATTGGCCCTGCTCTTTGTTCTATACTTATTTAATATGCATCAGAC CTTTTAGAAAATCTTGGTTTTACGTAGGTCGTAGCTTTAATTCAACCCTG TGATTTATTTCAGACTCTTGCTACGTTAAACATTTCATCGTCCCCTTTGT TGCCAAGTTTCCACTGATGTTCTTTTCCATTCCATTGTTACTTGAATACT AGTCATAATGAGTCATATTTTGGAATGAACTCCAACTTGGCTCCTTTCTT GCATACTTGTTATCTGCATCCTTTATAGAAAACTGTCAGGATGCAGAGGT GGGACAAGTGGGACAGGTGGGATTCCACTTTTAGACATCTAGACTAAATC TAAACTAAGTGGGATAAGCAGGATAAGTGAGATTTGATAAATCCTACTTG TCCCACTTCTCCCACTTAATTTAGAGTTAGTCTAGGGATCTAAAATTAGG ATCCCATCTGTCCCATTTGTCCCACTTCTGCATCCCTAAAAACTGATGTT GGTTAACCCTCTCCACAGTGCTCCGATGGTTCGAATGAATACTTTGGTCT ATGCAACCTGCTTTGCTGATGCTGCAAGGTATAACAAATGAAACTGTAGC AATTATATTTCTTCAACACTTACAACTTTATTTACATTATTTTCCTGTTA CGTGTAAGCTGTATCTTGTAAATCATCTTATGCTTTGCTAATCTGGATAT GTGATAATATTGTATGTTCTTTTACAGTTCACCAGAGCTGTCGCTAGCAT ACGTCAAGCTAATTCAACAGTTAGTAGTCTTCAAAGGATATTCTGGTTAG TTACCATATGACCCGGAAAATCCTTTTAGAGGACGGGCTCCATGGAGCCC GTTTTTGAATTTTTCAAAAATCATCAAAAATTCGGGCGCAGCAAAAAAGA CAAATATGACAAATTCTGGGAAAACGGAGGTCCATTCAAATTTGCACTGT TCACATCCAGATCTGAATTTTTCTCTTTTTTGCTGTGGCCAGAATACAAA GTATTTTCGAATTATTCTTTGCACGCGTGTATTATAAATCATTACCTACA TCACAGTATTTTTTTTGAATTTAAAATTTAATTTTTTTGAAAAAAAATAA AGTCCTCACTGGAGCTCGTCCTCCAAAACGACGCTCTCCCATATGACCCA AATATATGTGCTGTAAGCTCCAAGAGGCATGTAAGTTTCCGTAGTTTCTT GTAGCCTGACATTATGCGATTGTTCTGCAGCGGCATTTGGTGCTCTAAAG CTTACCGAAGAGAAGTTTCAATCCTCGACGAATTCACATATCCAGCTTCT CAAACTGCAACTGCTACATGATCGTGCCCTGCATCGGTATAAAGCTATTC CTTCACTTGTTTGGTCAACTGCATTCTGCATCCACAATCTTATCTGTTAA TATTTGGTGTAAAATTGATCTGTCTAGAGGACACCTGAGAGTTGCGCAAC AAATCTGCGATGAATTTGGGGTGCTCTCATCATCTGTCAGTGGAGTAGAC ATTGACCTGAAGACTGAAGCTAGTCTACGGCGTGCCCGCACCCTACTTGC TGCAAAACAGTTTAGCCAGGTTTCGAGTTTACTTGCTTTCTTGTAGTTTA CCCAGGCATCTGTTAGTCGTCTTATTGGTCCTTTTTACCTTTCATCTGTG CAAGTGGATTATAATATATTTGAAACTCATCAAGTCATTTCCATATTCAA ACGCTTTTCCTCTTTACTTTCTTTCATACTTTCTGGTTCATGAGCATTTC AACCATGTTGGCCCAACAATTCAAGGAGAAGATCTATTCCCTAATACTTG AGTGCCCTATGTGCAGGCAGCAGTTGTGGCGAACTCTCTTTTCTCTACAT GCTACAAGTACACCATGCAAGTAGAGAATGCAAGCGTTCTTCTATTGCTT GCTGAAATACATAAAGTAAGGCAAATGATTTTTTGTTGAGGCTAGAACCT AATTATTACTCCCTCCATCCCAAGGCTTAAGGCATATAATTATTTTGAAA AGTCAAGCCATGTAAAGTTTGACCAAACTTTTAGAAAAATCTATTAAGAA CTATTATATTATATAGATACCATGTGAAAATATGTTTCATGATGTATGCA AGGGTATGGATTACATAGTGTAAATATTAATATTTTTCTCTAAAAACTTG GTCAAACTTTAGTTGGTTTGACTTTTGAAAAAAATTATATGCCTTAAGCC TTGGGACGGAGGTAGTACTGCGATATCACTCAAAGAGAACTAATATTTCC CCTCTTCCCTCCCCAGAAGTCTGACAATGCAGTCCTCGGCCTCCCGTACG CATTAGCCAGCCAATCGTTCTGCAAATCATTTAACTTGGATCTGCTTGAA GCCTCTGCCACTCTTACTCTCGCTGAACTTTGGCTAGCTCTTGGATCAAG CCATGCGAAGAGGGCCTTGAGTCTTGTTTATCAAAGTCTTCCCATGATTC TTGGCCATGGTGGTCTTGAGCTGCGTTCTCGAGCTCATATAGTCTTGGCA AAATGCCATTTAACTGATCCAGAATTTTCAGGTATGTCCGGATGATGCTC TCCTGTTAACGTCCTTCTAACCTTGCACTCTGTTGCTTCATGGTGCTTTC ATTATTATGACAGTTTCCGAAGATCCTTGCTCTGTTCTGGATCCTCTAAA CCAAGCGGCCGAAGATCTGCAGGTTTTAGAGGTGAGCTGACGATTCCATC TCAAACATTCTTCCTGGCACACGAGACATTACCGGATCAAGTCCAAAATG CATGAAAAGGGTCTAGATCCTCACTGTTAAATCCGTTGTGATATGCAGTA CCACGAGATGGCGGCAGAGGTCTACTACCTGAAGGCAATGACATATAACC ATCTTGGCAAGGAAGACGAGAGGGAGGAAGCAGCGGCTTGTTTCAAGGAG CATTTCACTGCCCTCGAGACCCCGTGCGACGAGGAGGCTTCACTCGCTTA CTGAGGCTGGCAGGTCGGATAGCTAAGCACTAGATTTTAAGACACGCCCT GGTATGATGGAGACCGACCATGCAGGGCAAGTAGCAAAAGGTAGACATTC TAAGGTGGTGACTGCTCAGTCTTCCTGATATCAAGACTCCGTTACCGTAT CTTGGGGTTGGGGATGCACGCTTACTGGAGATTTGCACAGTTCGAGAGGG CGGTGACAGATAATGCCTGGCGTCATTGTGTTTGTGTAATTATTGGAGAT TCCGGAGTCTTGGTACTCGAACGAGAGCTAGGTGCATGCCTGTCTGACAG CATATCCGGCAGCTCCAAACCTGATGGAGTCATTTGTGTGACATGCTGTG TGTTCTTTGGAATTTCGTTCCTGGTATGTAGCAACTTTTAACCAGTTTTT CCCAACTGCATGTATCTATTACGTTAGTTACTTCTCCCCCCCCCTTTTGT CTGTCAAGGTTTGTTTTGTTGTGGATGGACAGTGATGTGCATATTGTGTT TGCCTGAGCAGCAATGGATAGGTTTAATAAGGAAACAAACATCTGAATTC A

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.