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GrainGenes Sequence Report: AE048895

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Sequence
AE048895
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE048895
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCGCTTCCCCTTCCTTCCTTGCCTTCGCTCTCCACAACCTCTCCTTCCC
CCTCTAGGGTTTAGCGGCCGAGGTAGCCTACTCCAGAAGCTTCGCGCGGC
GGGGGCGATGGCCGCGCGGCCGGCCGTCGCGGTCGCGGCGCTGCTGCTGG
TGGCCGCCGCGCTCTGCTCCTCGGCGGCCGCGGCGAGCGGGCCCCACATG
GCGGACCTCAGCGTGCTCCTGCCCCCGCGCATGACCAGGCCCGTCGAGTA
CCGCCTCGTCGGCGGGGACGGCTGCTTCTCCTGGTACACCATCCTCCCCC
CCCTCCCGTGCTCCATCTCCCCTTTTTATCCCCTTCGCTGCAAGTCGCGT
GGTGCTCGCTCGCTCGCGCGTTTGGAAGTGTGGTGTCCCGCACTGCGGCG
TGCCTCGCTGCTGCTCCTGTAAATCTACTGTGTGCGGTTACTGGCTGCAG
TCTGCGCATTAGGGTGGTTCCCGTGGCGTGATCTGCTGCTGGACGCGCTT
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ATGATGGACTGTTACCACTCGGAAGGTTTGGAAGTGTAGCGTGCTTCCGG
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TCTGGGCACGCATTTGCAGTAGACCTAGCAGTGTGTTCCGTGATTTTTCT
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TAAGCCCGAGTACAACGACAGCAGCAAGTGTTCGACTAGTGCACGCCTTG
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GATATTATCAGCGGGGTCACCATACACTGCAAGGTTTTTGTGGACAGGAT
TTCTCGGATCAGGATTTTCCATCATTCTGTTAAAATTGATCTGGATGAAG
TTGCCACATTGCGAGTTCATGCCTTTGACGACGAAGGTTAGTCTTCATAT
AACTCTTTCCATACTTGTGGAGGACAGTGGCCATGTGTCTCTGTTGTCCC
CTGCTCAGGCCTCATTAAAAGTGCCTTTTAAACTGTGGTACTGCTTCTGC
GTTAGTCAACCTAGCTGCCACGTTGATGATAGAACATCCATTTCTTACGT
TTGCTGGTTCATTTCAATCAAATATCCCTGATGCCAGTTCGATGTGATTA
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TTTTTGAGTTTCTCCTGATATTGGTTCTTAGTTGTTAGCGCTTCTTTTCC
TTGCTCTAAAAACATCCTAGTGGGATAACTAATAGCATAGTAGTTTCATT
AGCCATTTCCCTGTCAGAGTACTTCTAGTAATAGTATTTCAAAGCTGGGT
CATTACTTATCTTGTTCTCCTTTTGATTCAGACAATGTATTCTCCACCTT
GGTGGGATTGCAGTTTATGTGGCAGCTTACCCCAGCATCGCTTGATAACA
GTGACCATCATCTTCTTCATATTCCACTGAAAGAGACACATTTAAGTGAC
TGTACTGGTTTTTGTGTTGATATGAATGCACGATTTGAGCTTGAAGACAG
GGTATGCAACTACATTGTACACTTTATCTTGTTTCCAGATTAACTCTACA
AGTATTCATTTACATTTAAAAATACATGCTCTGAATTCCATTGCAATACT
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GGCCAAGAGGCTGTTAGTGCTCAGTTACTTGAACCACAATTTGAGCATGT
GAATGACACAATCACCTTGACAGTTGCCGAGGCTATGTCGCTAGAGCCCT
CTTCACCCGTCCTTGTAACTCTTGGTGTGTCGGTAAATTTCAAATTGAAG
ATTTTTCGACAAAAGGTTGCCCAAGGTACTCGCTAACATGTTGAATTTTG
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TTTCTTTCTGATCAGAAAGTTAACTGTGGTGTCATGTTGTATATTAGAAC
AGATCAGAAGAGAACCACAATTTAAAAAAAATATGCTGCAGTTTACAGTA
AAATACCCAGTTATAGGTGCTGCACTTTGGTTCTGTGGTCTTTACTATCA
TTTTTAGAGAATGTCTGCCCAAACTTTTTTTATCGGATGTCTGCTAATGG
AACTAACATATCCTCTTTCTTTATACCCTTTTAGTGGTTAATCTGCCTTC
GCAATATCACCTTTGGCATGTGACAAACTCTTCTGTCGCCCAAGTGGACA
GTTCCTCGGGTGTTGTACATGCTTTGAGTCTGGGATTTACGAATGTTGTT
GTTGAAGATACAAGAGTTTCTGGCCATCAACAAGTATCATCTCTACATGT
TGTTATTCCACGGACACTCTTCCTTTATCTAGTTCCAGTTATGGAGGATT
CTGATCATCTTTATGGGATAACAAATATTCCATCCTCAGAAGTGTGGTAT
GTTTTTCCTGGTAAGGAGTACATGGTTCTTGCGAAAGCTTTTGCAGAGGG
ATTTGATACTCGAGAGATATTTATCACAGAGGTACTATTCATCTGACCTA
ACGTAGTTTGTTCCTTGTTATCTCTGTTTCTTACTATTGGACACACTAAT
AATGTGTAAGTGCTGATTAGATCTTAGTGAACATCCTTTGCGTAATTCTT
CCAATGGTTAATTTAAAATTCCTAAACTATATTTAATTTAATAAATAATG
AAAAAAAATATTGACCAGCAGGCACCAGCAACCGTGACATCTGTAATTAA
GAAAACAAGCGTGAGCACACCTGCCAGAGGTGGGCCTCACTGCGTTTCTG
GCCAATCGAGCAAGCTCGGTTCTCTAAAACTGTACTTATATGCTTCTGTT
CTGTGAAGTAGTTATGTGGCATGTGATGTACAGCAAATTAACACAACATT
GCTAAAGCATAAATGTAGTATACACAATCACACATGGAGTATTCTGTTGC
ACTAATTAACATGATTTTTTTTTTGATATCTGAGCATGCCATAAGTACCA
GCCTCTAGATGCATTTTCCATAATAAGTTCACTCCTATGGTTCATGCAGA
TAATGGCAGGCTTGCATGATTGCACCGGCATAATTGCATATTCACATCAA
ACAAATGCATATTCCTCACAGTACATACTTCTGCATCTTTTAGTAGTCAT
GCCTTCAATCATGTTCATCTCGTCTTGATGCATGATACACACGCATCCTT
CAGTACATACTCTGCATATTTTGTCAGTGGAGGAATGTATGGAGAAGGAA
CAACACTTTCCTTATTTTGAGCAATGAAACTCAACAACTATAATGATTTT
AGCAGTTTGGTTATGGAAGCGTATACTACGTGGAATATTATTTTGTTTAT
TCAACAATACGGTTATTTTTTGTTGGTAGGAAAACAATCTTAGATTGGAG
AGCAGCACAGTGGAATTCTGGAACTTATCGCGGGTTCTGGACAACTCTGT
AGTGCAAACTTCTAGATTGCTATTCCCCATTTCCCAGGGAAAAGGATATC
TGGTTGCTTCGTTAACATACCAAGCAGAGGCATCTGGATCGACAAAGGTA
CGTTCCATGTTTACTTGTGTTATTGCTAGCATTCTTCTCGGGGTGGTGCT
AACTTTTATGCAAAGATCATTAGAAGGGTGTTGGCAATTCATCACTCAGC
CATAAAGGTTTCTGATTACCTGATCGACACTTCCATTTTAGGTTCTCAAG
CTGGTGCAAGAAGTTAATGTATGCAGTAAAGTGAAGGCAACCTGGGATGA
GGGAACGGAAAACTCCAATATTATTCGCCTTCCCTGGGTTCCTGGAGTTC
ATCAGGAAGTCAAACTGACGGCAGTTGGAGGTTGATTTATGTGACATCAT
AGTCTTAACCCACTTTTGATTTATAAATTGATTTGATTGATAATTTTTTT
TACTGTTCCGAAGGATGTGGTAGGACAATGGAGGATTACAAGTTCTTTTC
ATCTGATGAAAGTATTGTTTCTATATACGATTCCTGTACCATCCGGGCTA
AAAAGCCTGGTCAAGCTGTTATCAAAGTATTTTCTGCTTTTGATTCCCTG
AATTTTGATGAGGTACGTGAATATAATATCTCCTTTGTGTTGTCATTCTG
ATCTTTTGTAAAGTGTAAACTACCAGTTTATACTCCTATCTAGTCTGAAT
ATGTAAGCTTGAATCGTTGATGCAAAATACGCGCTGTCAACATGATTAGA
AGAGTGGTGCCATGATTTTGTACTTGCTAGGAATTCTATTTAGTATTTTA
TTTTCTACTAGTGCTAAGCTTACTCGTTGTCTCTGAGATTTATACTTCTG
TGTTAAACTAATAACTTTGAACTTCAGAAAGGCTGTATTTTGCAGTACCT
AGTTGCACTAGTTCATGCACAACACCACCATGCTTGATGTCCTCTTTGCA
TATGCATGCAGTCATGTGGTCCAATCACTCAATAAGTCAATATGCATATC
CTGTGGCCGTTATTTTTCTTTTACGAGTGAACTATCTTCTGCACAACTCA
TTGTCTTTGCTTGACAACGCAGGTCATTATTGAAGTATCCACTCCTTCAG
CACTGGCTATATTGCCAATCTTTCCTGTGGAGGTGGCTGTTGGAACACAA
CTTCATGCTGCTGTGACATTTAAGACATCTAATGGTGATTACCATGACAT
GTGCTGTCTATTTCGTTATCTGAGAGCACTGATGAGTTCATTGTTTTTCT
AAGCTATCCTATTCCTTCTAATAGCTATTCTTGATGTTCCTCTTTGCAGG
GCACTCATACTCGAGATGTGATTATTTTAATGCTTTTATAAGGTGGAGTC
TTCTATCTGAGAATCAAACTTTTGAAGTTGTTGAGACAGCTGAGGCTCTG
AGCATTGATGCCTTAAAACATCATACTTCTTGGAAACAATATGGGAGTCC
CTGTGCTTGGATATCTCTAAATGCATCTGCTGCTGGTCGAGCCACAATAG
TTGCGACAGTTTCCTCTGAGTCAGAGTCCTATCTTGAGACTTTTAATGTG
CCTATTTTTCTGAAGGCCACTTCAAAAGTATCTGCATATTATCCTCTTAT
GGTACTTCAAGCAGGAAATGGAAACCAGTTTGGTGGTTACTGGGTTGACT
TACCTACATTACAGAATGAAATTCAGAATATGGGTAACAACTTCCCCAAG
GAGTTGTATTTGGCTCCTGGATCAACCATGGATGTTTTTCTCTTTGGAGG
GCCTGAACAGTGGGACAAAGTGGTTGATTTTGTGGAAACTGTTGATGTTG
TTGGTGAACCCAATAGTTATATGACTGGCTCTATTGCTGTGCAAAAAATA
TCTAGTGGACTATACCGAGTTTCTTGCCAAAGCAAGGGGAACTTTGTAAG
TATATTTGATTCGAACTTTCAGATTCAACTGATTCCTGTCAATAGTTATG
TTCACATGCGTTTCCAGTTCTGCACTCAGCTCTAATGCATCATCTCCTAG
CTGAATATATTTTGTATTTTTGATGTAGAAACTGCTGTTCTCACGTGGGA
ACATGATTGGGAAAGATCATCCTGTGCCCGCTGTAGCCAAGTCAGAGTTA
TTAATTGTTTGTGACTTACCGTCAGCAATAACATTAATTGCAAATGAAAA
TGGTACTATCTTGTTGAATACACCTCTTACTGTCCCATTCTTTAAAGCTT
AGCTGTGGTACTTATCCATTTTTGACACTTTGATAGAAAATCGGCTTGAT
ATTTTGGAAGCAGCAAGCAAAGCTGACCGTAGCCCTGATAGACTGCAACT
ATCTCCTGTTGTAATCTCAAATGGAAGGAGCATTCGTCTGGCTGCTGCTG
GTGTACATCGAAATGGAAGATTCTTTGCCAATTCGTCCTCTCTTTGCTTG
AAATGGGAAATCATGGAGTGTGAGGAGCTTGCTTACTTGGACCAAGATGA
AGATGCTGAAACTTTAGATCAGTCATCTTGGGAGAGGTTTCTTGTCCTAC
AGAATTCAACAGGACTGGTTAGTATGGCTGGCATGACAAACTCCCTTACA
GGCCATGCCGAATTGTTTTGAATATTGATGGTTAACATCGACTAGACGCT
TATCGTCAAGTCTTAATGTTTAATTTCCAGTAGCACTAATATTTTTGTTG
AAGCAGTTCACTTCTATATATGTATATTATATATATGAGTAACTGTATGG
CTGTTTGTGAAATATAGATCTAAATAATATAAGTATGTCCTTGAGTGGTT
TAGAACTGGGTATAATTTGAACTTCTTCATTGTTTGAACTTCCAGTGCAC
TGCCCGTGCCACAGTTATTGGCTTTTCTTCAAGAATTGCTAGCCAAACCC
GTGAAGAACACTTGTTTCTTCAAAGCGCAAATGACAATCTGACAGATGCC
GTTCAGTTGCAGGTAATTATACTAAATTTCTTTTTGGTTTGATTATTTAC
CTTGATTTCGCTGAAGCTTTTATCTATTTTTTTTGGATTGCTCAGATTGT
TTCTTCCTTGAGAGTCACTCCAGAGTATGTCTTGTTAGTTAACCATCCTG
AAGCACAGGTATGCAATTGCAACTCTAAATTATTTGCATAATAGGATAAA
TTTCCTTCTTGTACTTCATGTTCTGATGTATCTGTGCAGGAAATCTTATA
TGTCAGTGGTGGTACATGCTTCCTAGATGCATCTACCAATGACACACATG
TGGTGCAAATAGTTCAACAACCAGGAAAGGCGCTATGTTCCCAGTTAGTT
CTGGGTGCTAGAGGCTTAGGCAGTGCTTTTCTGACAATTCAGGACATTGG
TCTTTCTCCCAGAGTAACGACTAGTTCTCTGGTATATTTCTTTGCCACCT
TTCTTCCCTGATTTTTTCAATATTCATTTGCTTATGTCACCAAGTATCTT
TTGTAAGTTGTTGCTCGCCGTGTTTAACCTTTCTTTATTGTCTGTGGGGT
TATATGCTATTACAGGTTAGAGTTGCAAATGTTGATTGGATTCAGATATT
GTCAGAAGAGCACATCAGCATTATGGTACACTGATATGCTTTCTTTGTTG
CATATCTTATTTTCTTCAGATGCTAAATCTTCGTGGTTAATTTCCATCGA
CACCTTGTTTTGTTTCTAGGAAGGAACCACGGAAGAGTTTCAAATTTCAG
CTGGAACCCAAGATGGACAAGTCTTTGGAGATTTTCAGGTCTTTGCTGGT
GCCACTGCATCTATACTTTAAAATCTCTCCTATTGTTTGTATGTGTTAGT
GTTAATTGTTGCACTCTTTAATTGTGAAAATTTGACTCCTCCATTTGGAC
ACTTTGACTGTAATAGTAATATCAAGTTACCTTAACCTTTCGCTGAGCAA
ACTTAAATTTTTGTTCTTTAGTCTTACTAGATATCCTCTTTATCTTTGCA
CTGACAAGTTTCTGTTCAATCAGCTACACAAGATCTCAAGTTATCTTGTT
TGTCCAATCCTATCATTATAGTTGTCATATGCTCTTATTATCCTTTACCA
TTTTCAAAATTTTGTAGCATATCAAGTAAATCCATTTTTCTGCGGCCCTG
CATACATTTGATTATTACAGAAATATGCTGCCTCTGGGGGTAATATCACC
TCCTTATTTACACCTTTGTAAAGCCAAATCTGCAGTGTTGCTGTTTGTAG
GACATGGTCAATGCATTCTAGATTCAGCTATCACCTAATCATGCATTCAT
TTTTAGTGCATCGCATGTTAATAAGTCTGCAGCGTTGCTGTTTCTAGGAC
ATGTCACTGCTATCTGTCTTTCTACTCTTACCAATTTCCTTCTTTGCAGT
ACAAATACATGGGAGTTGAGGTACATCTTGGTGATGAAATCCTGGAGCTT
ATTAATCCAAGAGATTTGCTTGGTGGACCAAAATTTTCAACTAAAGCTTC
AAAGACTGGCACAACATCTCTTTATGTAAGTGTTTCGAGCCGGGGGGTGG
GGTGGGTGGTGGGTGGGGTGGTCTCTTTATGTAAGTTGATGCTTATTGGC
TGACAGCGCTCATTATTTCTCTAATCTTCAGGTCAGTGCGAAGCAACACT
CTGGGCAGAGAGTTTTGAGTCAAGTTGTGAATGTGGAAGTGTATAAACCA
CTGCAAATACATCCTGAGTACATCTACCTCACACCGGGTGCCTCTTTTGT
GGTAATCATTATGTTAGCCCCTTTATAAAATTAACGTCACATATGTAGGT
ATTTGCATTTCCTCAAGACTGTTTTCTGTGGACAATGGATTCCCCCTTAT
TTCGTACAGAAAACTGAGAATCACACTAAAATGTGCTTCAAACAGGCTTT
AAACTGCTAGCGTTTGTAGTTGCCATAAATATCATCTAGTTGTACTTATG
TAAGAAACAGTGGGCTCTGAGTGCGTTCTCCTTTCTCTTTAGCTTTCTGT
TAAAGGTGGTCCAAAGATTGGAGTTTCAGTTGAGTACACAAGTCTGAACG
TGGGAACATTGGAAGTTCAAACTGCTACTGGAAAGCTGTCGGCAAAGACT
GTAGGAAACTCTGTAAGTCATATACTGAGTCATTTTTTACTGCACTACAT
GCATGCGTGTTTCTTTTGTCATTGCTATAGGTTACATTATAACATTTCAG
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GAGGCACCATCATCTGTGAAGCCTTTGGAAGAGTTGAAGTGGGTATCCCA
GTGGCTATGGGATTGAGTACTCAAAGTGACCGTCTCTGTGTTGGCTGCAG
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AGTACCATGTACTAACAAACTGTTGTACCTTAGGTGATGACATTCCAATC
AAATGGAAGTAGCAATGCTTTTATCATCAATCATGTGATTGGAAGGTACT
GCTTGGACAATTCAGTGCTCTAATCTTTTTAAACCTTGATGGGGGAGCTT
TTTTTTGGGTATCGTATCTTCATATTAAGGGAACTAGTCATGCCCCTATT
TATTCTTCATTTTTATAACTAAAATGTGTTGGTTGAAACACATAAATTTC
ACATAGTAAATGGGATAGCAACAAGTGAGCTAATTTGTTTTTTTTTTTTG
TAACAGATCTGCTGGGAAAACGAAAATTTCTGTTTCCGTTACTTGTGATT
TCTCGCTGCATGGCAGTTCTAGATCTGTATCTTATGATGCCTCGAAGACA
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GCTATTTCCACCCTTTTATACTACCACAGACCTTTTACCTAGATCAGTCA
ATTCATTTGGAGAACCAGACTCCCATGACCTGGAGAGTACAATTGGATAT
TCTCTGCTAAGGAGCAGTGGCAGAAGTGATCCTGCTATGCAGAATGCCAA
CGTTATTGATGGAAGTAAAATTAGGACTGGAGAAAGCAATGCACTTGATT
GTATTCAGGCCAAAGATCACTCAACTGGCAGAACAGAAATAGCATCATGT
CTACGTGTTGCTGAGGTCAGAAAGACTTGTACTCCCTCCGTCTCAAATTA
GTTGTCTCAGATCTGTCTAGATACGGATACATCTGTATTAGAAAAATCTA
AGACAACTAATTTGAGACGGAGGGAGTATTGATTTTTATAGGCTTTAAAT
CATAAATTACTAGATATGACTACCAAGTCTCTGTTCTAGAATATTTTGTT
GTTTCCATTATTCGTCTGAATCACATCTTCAGTACTGCCCTTGCTATGAC
TGAAGTCATTTATGAAACAAAGTCCATTTGTGAATGTAGCAGTACCATTA
GCATTTGTGTAGATGTCACCTTTTGTGTGGACGCCACGTGATTAGTGGAC
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TTTTATATTTCATTAGTTTGTCTAACCCATACAATGAGTTCATCTTTAAT
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TGATAAAGTTGAACTGGATGTAAAATATGCTGATGAATTAGGTAGATCAA
TGACAGGTTTACTAGTATCAAGTGCTTAACTTAATCTTTGATATATAAAT
CTCATTTTTAACCTCATTCCTGTTCAACCAGGTTATATCTTCAGTGAAGC
ACTTGGAATAGCACCTGTAAAGATCGAGACAAACAGTCCTGATGTTGTGT
CAATTGTCATGCACAGAGATGGCAATGGTACATATGGGGCCCATCAACGT
TTTGTGTTACAGGTATTTGCTGGTTGCTGAGACTCAAGCTTTTAAGTTTT
CAGTATTGTGTCTATTGGGGGCTAAGGTTTTCTAAATTTACATCGTAAAT
GGGTTTCATGTTAGGAGTTCAAGATTGAGCATGTTTCTCATTAGTTTGGG
CAAACTTCTTTACGTTTTGTTCTTTTTTGAAGGCGAGAAGTCATGGGACA
GCTCTTGTAAGGTTGCACATCAGCCATCCTTCCAGAAAATCAGATTTCAT
AATGGTAAGGTTGTTTGTTACTATTCTAGAATATATGTTCTATGTTTGAA
ACATTGGATGTGCACATTGAAGCTATCATCTATTGGCTAACATTTGTTTT
TACTCTATTAGGTATCTGTTGTTGATTCTAGTGATGTGGTGATTCATTCT
GGCCAGCACCTGAACTTCACTATCAACGGCAAAGGTATGTCCATTGAAAC
CATTTTCTTACTAGTAGATGTTTCTTGAACCACCTTGTTGTCGATTTGTA
AAACTTAGTTCTACACCGAGTCTACTTCAAATCTGGATGAGAAACTTGTT
AATTTTTTGTGTATGAGTTCTCACTGAGCAACTGTAACTTGGCATTGTTT
CCCCCTTTACAGGCCAAACTGAAAACGTCAAAATCGGCTATGCTAAAAGA
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TGCTGGAGAGACCGGCCCGGCAGGTGCCATCACGGCACGCAGCGCCCTCA
CCCTCACGGGCAGCAGCAGGCCTGGCTGCGGCCCTTGACCCTGCTTCTCC
TCGCACGCCTCAGCCTTTCATGGAGTACTTGCGGAGGACTGTGGATGACA
CGCCTTACTACAATCGTGGCGCGAGGAGGCGATTCAACCCCCAGAATACA
TACTGAGGTGTGTAAACCAGGAGGTCATGGTCTGTGCCGTAGAGTTGTGT
AGACTGTAGCTTGTAGAGCCTTGTAGTTATTGTACGTGTGTATGCCCGGG
GCGGTGCTGTCAATTTTCAAGCTGTGGCGGCATCTGTGTGCCTGTGTATG
AGCAATGGCTGGTTCCGTTTTAGCTGAGAAGAAGATGCTAGAGGTAGACG
TAGACCACTCAATGAAGTCCATTACTGTAAGAACCTGGCCGCTTGTAAAT
GAAGGGTGCATTGGGTAATTAAACAGTGAATGTGGAACCTGTATTCCCTG
TCTTGTTTTTTCCACTTTAAATTGTGATTTTCTTTTCTGAAAATCGTTAA
CGAATGTTGAATGTTCAGCATTTGCAGGCACAAAGGTTAT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.