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GrainGenes Sequence Report: AE006131

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Sequence
AE006131
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE006131
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGAAGATGGGGTTCGTCAAGGCGAGGTCGTACTGGGCGCTGCAGGAGCC
AGGGAGGCGCTGGCTCGGCCCGGAGACGGGGCAGTCGCAGAAGGATCAGG
GCAGGCGCCTTGTAGAGGCGGACCGGCGGCTGATGGAAACGGACGCAGGG
ACACCTGCGATGCGACGTGCTCAGGCACCTGGCAGCGTGGGCCTTGGGGG
TCAAGGCGGCAAGCTCGGGCTCGGCAGGCACGAAACGACGAGGAAGCGCT
CGGGGAGGACGAGGAGCGCCGGCGAGGTCGCGGTAGGGAGGAGATCCGGC
CAGGGCGCCGAGGATGGCCTGGTGGAGGGCGACGCTGTGACGGAGCGGCG
GCCGGGTGCAGGGCGCGCAGCCCAGGGGGAAGACAGAGAGGCGGCGAGCT
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ACGGCGACAAGGAGGAGCTAGGGGAGCCGGGAGGGAGGCGCCGGCGACGC
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GAGAGAGAGAGAGAGGCGGCGGGGTGGGGAGATGGTTTGGGGTTAGACAG
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GAGTGTTGCTTCTCTCTTGCTCAAACTGCAAAATCAAACACTAGCAGCTT
TGCAGTTCGGCAATATTAACCCGCTGGTTTCTTGTACTAACTTTAAGCGA
GTTTGGACATCATCAGAAGGTACTTGTTGTGTGTTAGTTCATCTAGTTTT
TGTTGGAAGTCACACTTTCATTCTGCTGTATTTATTTTGTTTTTTTTCGC
TCAAGTGGTTATGTACCCAGTTAAGCTCATTGATCGATCATATACTTTAG
GTTGTCTGCCTGGTTACAATCTCACCTTTTGGAGGCCGGAAGCTCCTTCA
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GGTTAACCATTTTTCTTCCGAGCTATAACCTATTGAACCTGTAGGTTTTG
GGGGAAAATTTCTGGATGGGCTGATCCCTTGGACCTCCACACCATCTTAT
ATATATATTTATTTAGGCTTACATCTTCATGCATACACTAAACTAATCTA
GGTTCTAGTAGGACACTACTGTACTAACACTCCTAGAATACTCTAGACTC
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GATGGGTGATAGATATCTATCATTCCCATCTTGAGTACTACTACTACACT
AACTTAGAATCCAACACTCCCCCTCAAGATGGGTGATAGATATCTATCAT
TCCCATCTTGTTACATGCCAATGAACATTCCTTACTACCCAATCTCTTAG
TAAGACAATCTATAGTTGTTCTCCAGAGGTTACATGACTTAACTTCAAGG
TGCCTTTGTCGAGCTGCTCTTTGATGAAGAATAGGCAGCTACACTAGCGC
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CCCCTTCTTCTCCCAGCAGCAACGCCAACACCTTCTCTCTGCTCCAGGCC
ACCTCCAGCAGCGCCCTTCTCTGATCCATGACTGTAGCAGCAGCAGCACC
TCCACCTTGTGTTGTGATACCATGTAGGTTTTGGGGGAAAATTTCTGGAT
GGGCTGACCCCTTAGACCTCCATACCCTCTTATATATATAGCACAACTTA
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AGATGTTTTAGCTTTGTGAAGGGAGTGTAGGTAGACCCCTTTTAGTATGT
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ACATTATGCAATGGTAGTTAGCACAACTTGTTAGGAAATAAGAATGTATA
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AGTATATTCAACAATCTAATGAAATAATATAGGCACGAATAGACCAAACA
CAGCAAGGGCCTACCTTTTGGTAGTTATCGTGCTTTGCCAAGTAACCACA
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AGACAACAAACTGTGCTCAAACACAGGACACAGCCATCCGGCAGCATGAT
TCGGGAATCGCAAAAAATAGGCCATTATCTCATCCTATAGATTTTTACTG
ACCTACAGATTGGTTCTGTAATCTGTCTAACAAACTAACCTGCAATCCTG
CATAAGCCCAGATTATAATAGCATGCCACACCTTACAGGACACTAAGAAA
CTCTAGAAGCTTTGATTCTGCCCATTCTGAAGCATATTCACGACCTTAGT
GAGGCCTTTGATTCTTTCTCAATTTCTTTTGTAAGGTGGACTGCTAATTG
CGCAGCTCTTATAACTGCCAAGCAAGCATCTGCGGATGATCTGGACTGTA
CCTGGCCTTCCCAGGTTACGGTCTTCCTTGCCTTTTGTAGACATCATCAG
AGTTCTTAATTCACCGATGACAATACTTGGGGATCGAGGGTGAATCCAAT
GATAATTAGTGATCTCCCATGAGAGCCAAATCCAACAGATTCCTGACGAA
GAGTAGACATGTTTTTTACGTGTTTCATCAGTTGAGCACCCTCACGAGAA
ATGAAAATAAAGATTGTCAAAGTAAACTCCGAAGTACGTCAACCACACCT
TGTTTTTTTGTGAAAATTCCACCGATCTATTAATAATAATCATCAACAGC
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GCACCAGATCAGCAACCATCGCCAATGTTGACAACCGTAGATCGGAAGGG
ACCGACGTACTCAAACTAGCAAGGAATTCCAAGTGCTCACGAACTGTCAG
TCAAATGACTCAAAATAGTCTGGGACTGGGCTTCAATCTCCAAGAAAACC
ATGGTGGGGTCTTTGACGTCGTCGGCGGCAAGCTTGTGGCGAACACGGCG
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TGGTCGAGGGAGGCGGCGAGGTGGGACCATGGCGCGTCGGAGCAGAGGCG
GCGGCGACGGATTGGTGCAGGACTGCAACCGGGAGGCGGCAATGGCCGGG
CAGAAGCTAGCGGGAGCGGCTCGTCGACACAGGGAGGCAGTGCTCGGGAG
CCGTGCATAGGTAGTGTAGCGGGTAACCTAAGGTGGAAGGTATCGAACCA
AGAAAACCAATTGCATATTACGGTTAACCCATGGGGGCCATTCGGCTCTT
TTTTTTGGTTAGGTTAACCATTGGTTAAACAGGAATTAAGTCCTATATTT
ACTGAGAAATGTAGTTCTAATGTAGTGTACATCATGTCATTGACCTGAAA
CAGACCAAGGGTTTACAAATTATAAGAGCTGTTTATTTAAAATGATACTA
GTATAGGTGGTACTAGTAGTTTCTGGAAATTTGTGCAAACCAGGCTTAAG
AATCTGCCAGGAACTGCCTGGCTACCAACAATTATTTGGGGGCAAAGGAA
GTACTGTACTGACTTGTCTTGTCGCATCTATCTCCTATCTGAACATAACT
ATTTTGCAGGGATAATCAAACTTTAATAGAGTTCCTTTTGGCCCTAAGCA
TGGATAAAAAGAGCAGGCCATTGAAAACCACTTGAAATATCAATTATTTG
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ATGGCTACTTCAACTTCTTTTCTATTATCTTCCATTATGTATGAAATCAG
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TGTAAACCAGTGTATCTGTGTTCATGAATTATCTCATCAAACAAGTTAGA
ATTGAGGTTATTGCTCAATAATATTTTAGCCCAGCAGAAAATATGAAAAG
GTTTGGCCATTGTGTATTTTATTTGTTTACATTTATCATTATGGAGAATG
GTTTTATATAATTTGGTTGTTCAACCATGTTAATCTAACCGACACTCTAA
ATGTTGTACCTTGCATATTTTTAAAAGTTTATAGATACATGCGAATCTAA
ACAAATCCACGACATCCTTTTTGGCACGGAGGGAGTAGAAAAGATGCAAT
TATTTTACATTGCTTCCTGTTTACTGTTTTGTGGAGCAGCTAGCTGATAT
GTGGCTGCTACTGTGCTACATCTTCCCTTAATTTTTGAAAGATCGATGCG
CTTTCAGGTTTTAATTAGGAACTTTTAAAACCTTGTTATCTTTTATCCTG
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ACCTTCTCAGGTTGTGGTTGCTGTAAGCAACACCTATGGCCGTGTGCGGA
AACCTCTTGGATTTAGGCTTGTACATACATTACCTGAATCTCTAGAGTTA
GCAGATTCAAAGAAGTCAACTGAGGAAAATGACTGTTCTATCTGGATTCC
TTTGCCGCCACCTGGATATTTAGCTATAGGATGTGTGGTAAACAGTGGAA
GGCAGCCACCTTCAAATAATGTTGTGTACTGTCTTCGTTCTGATCTAGTC
ACTTCTGCAGCATTTTCAGATTGTCTATTGTCTGCTCCTAGGTAATCACA
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CTCCGCAAAAGAGTTTCTAGTACCTACATTGGACTAAAATGAAAATACTA
ACAAAATTTCAATTTGTTCTTGTTTTTATTATCTTCTTTCTGTAGAATGC
TTTCTGGATTTAGCATCTGGCGTGTGGACAATGTGGTTGGTACATTCCAT
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CAGATTCTTCTGTTCAGAGTGAGCAGCCAACTGATCAATTAACTCATCGC
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GTGATACAAGGCGGCCATTTTCAATATGGCGGCCATTACCTCGTTTTGGC
TTTGCTTCTGTTGGCGACTGTATAACTGAAGGGTACTGGTCTCTTTATCA
TGTAGATTTTGAAGACGATACTTTTCTTTGTGATACTTAATTGACATGCC
CGTGTTTCTTTTAGGCTTGAACCACCTACTCTTGGCATTCTTTTTAAGTG
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ACCATCAGCTCGATTGGCATACAGTATTGCAGATCATGCTAAGCCAAAGG
CACCTGACAATATTACTGCTGAGTTCAAGCTGGGATCATTATCAATCAGC
ATCCTGGACAGCTCCTGTGGAATGGTGTGTAGGCATGCTACATTATGTTT
TCTTTAAGATGTCAATCGTTGAAACAATTGTTTTTTCTATTTATGTAATT
TTCAAATATGTAGGTCACACCAATTTTTGACACTACAATCGCGAGTATAA
ATCTCGCAACACATGGAAGATTTGAAACAATTAATGCGGTGTTGATCTGT
TCAATTGCTGCATCCACATTCAATAGACACTTGGAAGCATGGGAACCCTT
GGTTGAGCCATTTGATGGAATATTCAAGTAATCTTTACTTATTTCTATCT
ACCTGACAAAATTTTACTGTTCCTTTCTTTTAAATTCTCACTAAAACTGT
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GTTCCGTCTTATCATTTCAAGTACTCCCTCCGATCCATAATAAGTGTCGG
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AGGTCATACTCACACACTTATGTTATGCTTTGCACATGCACCTTCTTTAG
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ATGATGGCAATGATCATAGCTACTTCTGTGCTTTGCGCTTGCTCATAGGA
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ATGCGTAAAACCTGTTAAAACAACAGAGTTACAGACACATCATGCTAAGT
GGAATGAACATTTTATATTTGAAGTTCCAGAACAGGTAATTTTCAATTTG
GTAGTTTCAGTGCAGTATTTATTTTTCGTGAAAACGTATTAGACTATTGC
GTTACATTTCACTGCAAAGGTAGAGTTCAAGGGTACAAGCCTCCTAAGAG
GTGGGAACCGAAATATCCCATGGACTGATTAATTTGTAATTCACAAAAGC
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TGAAAAGAAACGCAATGTCATTCTTTTCAGTGTAGTATTTAAACACAATG
TCATTCTTTTCCATGGACAGATCTTTTCAGTGCAGTATTTAAACTTTTGT
TTGACAGGTCATTCTTGTAAACCTGTCCTGCAATATCCCATGGACAGATC
TTAGTGTAAATTAATAATTTGTTTATTTTTAACTTGCTGCACCCAATAAC
TTCTTTGTAGACACAGTTGAGCCTGATGGCTTACTATATCTCATTCTGTA
ATATTCCGTATCATTCTTTTTGTAGTGTGATTGTTGTCTTATGGACTTTG
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CATATAAAATGCACATGAGATCCCTAAGCAGCAGCCTCTTTTATCTGCGA
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CTTTATGTTTCAATAGTTTGTCTATTAGTGCTTAATTCTTTTTGAAGTAT
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TCCTCCACTAACTAGGTTGTTTCCTAAGCCCTCTTGTTGTAGGAAGTGCA
AACATCTCATATGCAAGACATGCCATACTTTCGAGTTTTTACATGATAAT
TGTTGACAAACTGCCATTTATTTTAAATGTTTGGGATTTGTTTAACATCC
TTCATTTATTTGTAAGGTGAAGTACTTGGCTCTTTGTCGATCCCTATTGG
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AAGCTGCTGACGTCAAGCGAGTAATGACATGCCCTCTTACAAGGAAGGTA
CTGTTGTTTTCTAGAATTTGCTTAGCTATTTCGACAATATTAAGAGACAT
GTTGAATTATATTGAGTCTACTCTTCATTTTGTATCCTGAGTTACAGGCA
ACTAAAGCGTATTTTACATTTTGTAGGGCACAGCACTTAACGAGGGAGAC
AAGAAAGGCTGTGGTGCTTTAGTACTTTCAAGTTGTTACATAGAACGATC
TACTCAAACAAACTTCCAGAACTGGAAATACAGTATAAGCAATGCAGAGG
GTGGTTTCTGGGTAGGGCTGACCCCAGATGGTCCATGGGAAAGTTTTACT
GCAGTTTTACCAGTGTCAATCATCCCAAAATCTCTTAATAATAATCACTT
TGCATTTGAGATCACCATGAGGAATGGAAAGAAACATGCAACTTTGAGGG
CTCTTGCTATTATTGCTAATGATTCTGACATGGAACTTGAAGTTTCTGTA
TGTCCTGTAAACAAGATTAGTAGCTCCATGTTAAATTCTGGATCAACGAG
TTCCACCAACACTGTTGATGAAGTATTTGAAAACCAGTGGTACAGACCCA
TTTCAGGGTGGACAAGTAACTACTCGAGCGATCATGGAATTGAATTAGGG
CAATGGAGCACAAGGGATTGCTCTTACTCGTCCAAGGTAATTTCTTTTGG
GTCTGTTGATGAATGAAATCACCCTTTCCTTTATTTGATGAAATAAACCT
GGTAATTATCTATTGTTTTAGATGATGCAAAAAGTGAATATTATAACAGA
AATTGTTAGCTTCTAACAAAAATATGCATTATTATGAAGGCGTTCTTTGA
GCCTCGTCTTCCACCTGATTGGAAGTGGACTTCACCGTGGAAAATAGAAA
AATCTAATTTCGTGGATGGTGATGGATGGGCATATGCTGCTGATATTCAA
ACCTTAAACTGGCCATCGTCCTGGAGATCTTCTAAATCACCACATGATGT
TGTTAGGCGAAGGCGTTGGGTTCGTTCAAGGCAGCTATTACAAGAACAAA
GTGGGGAAATATCTAGGAAAATAATTGCTATTGTTGAGCCTAATTCATCG
ACGGCATTGCCTTGGACTGCCATGATTAAGGATATGGACCTGTGTTTGCA
AGTTCGCCCTTTTTCTACCAAATCAGATGAGTCATACAGTTGGAGTCAGA
TTCTTTCACTAGGTAATGACAGCCTACCTAAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG
CAATCTTCACTTTCTAGGCAAAGCACCTTGAAACAATCATCTGTCCCCTC
AAGGAATTCTGTTCTTAGACTTGCTGAGCTTGAGAAAAAAGATGTGCTTT
CATGCTGCTCCCCTCCTGTTGGTATTAAACAATATTTCTGGCTTACTGTT
GGTGTCGATGCTTCTGTTGTCCATACAGACTTGAATATGCCTGTTTATGA
CTGGAAGTTCTCCTTCAATTCAATCCTTAGACTTGAAAATAAGCTTCCAT
ATGAAGCTGAGTATTCTATTTGGGAGAAGTCCGCCGAAGGCAACATGGTT
GAAAGGCAGCATGGTTCTGTATCATCAGGTGGAAGTGCGTTCGTCTATGC
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GGATTTTAGAGAAGGTAATGCATCTGTATTTTCATAGAATACTTCCAAAC
CAATTTAGTGAATCATGGTTCATGTTATGAAAACGTTGCTAGAGTTCTAT
AGTAGATAATGTGATGAATCAGCTGGAATGCAATTTGTTCTTCCCTGCTG
TTCCCTTCATCTCATTTGTTTTACCAGATGGATTACTTCTTTCTGTGGCC
TCTTTTGCATGTTCATGTTACTTGAGGGATGAATGTAATTTATCCATTTC
TCATCCCTATTAGGATGCTGTATTGATAATGGACTTGCTGTCGCTGGAAC
ACGTTTCTTCTTTCTGGATGGTTCAGAAACAAAGCCAGAGGTTTGGAAGC
TTATACACTTTCTCTGTGTTTCATTAATATAAAGTTTTCTCAAACAATTA
ATTGAATCAAACACCATGTAGATTTGCCTCAAGAAATCTTCAGATGGAGT
TCAAATAATATGCTAACATGGTTATTCATAGGCGATAATTGAAATACAGT
TTAATAGAACTATCTATAGTCAGTTTGTTTCATCGTGGACTACTAGAATT
TGAAGTAGCTTAGTTCACAGTAGTTCATTTAGCCTGTATATTTGATGTTA
ACTGTGATAATAGAGTTGATTCTAATAATTTCATTGTGTACCAAATTAGG
AGATTGCGTGTTAGTGTTGAACGTGACCTGGGAACAAGTGATGCAGCTCC
AAAAACGCTAAGATTATTTGTTCCATATTGGATAAAAAACAATTCTTCCA
TTCCACTATCTTATCGGATTGTAGAAGTGGAACCAGCAGAAAATGCAGAT
GCAGACTCACTTAGCAGACCAGACTCATTGAGCAGACCAGACTCATTGAG
CAGAGCAGCTAGATCTTCAAAATTTTCCCTCAGATATTCTTCAAAATCTC
TTGTCAGAAGAGGCAGCATATCACAGAGAAATTCCCAAATATTAGATGCT
ATTGAAGATTGTGGTACGAACTATGTAATGCTTTCACCACAGGATTACAT
GAACCGCTCGGCATATATGCGTGAGTCTCGAGATAACAACTTCAGCCCAG
CCCGGGTTGCGATTTGTGCGGCTGTTGGCAGTTGCAAACAGTACAGTATT
GGAGTGTCTCTCTTTGATCTTGAGAACAAGGTATTTGTGGCAATATTAAA
CACATTCGATAATACTTTCAAGCATTGCTTTCTTGATTTAGTGTAATTTA
TCTGGTGCCAGGAGCATGTCGATGTCAAAGCATTTGCTTCTGATGGATCA
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TTGAATATTTATGTGTTATCTTTTGGATGTTGAAGTTCATTTATGTTAAT
TTCTGTACAGTGGTCTGTAGAATCTATTGGGTGCCAAGTTCACTGAACAA
ACAAAGACCTATTTTAATTACAAGAGTAATAGAAAGACTCTAGCGATATG
TAGTCAAAAAGCATTTAGCTCAATATATATGTAGTCAAAGAACATTTAGC
CATTAACAAAAATCCTTTACAAGTTCCTCTTGAGAAATTCTCAAAACAAA
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TTGGTCATATTTATCCGTAGTGTTTATATCTTCTGCACCTACACTTCATA
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GTGCTGTATATCAGTATATGTATCAGTGTATTTTTTTTCCTCCTGAATAG
TATGCCTGTTCATGATCGAACGAACAATTCAGGGAAGTGTTTTGCTAATG
CAGGTTGTGAATTTACTTCCGCGTGCACTTTTTATCAACAGAACTGGGAC
AGGTATTATTTTATCTGAGTATTATACTGACCTTGAGGAGCATGTAAATC
CAACTGATCCTCCAAAGGTGTTCAGATGGCGTTCAGAATTTGGAAACGAA
CTTTTGAAGGTTATTAACTTTGAACTGGTGCCTTTTGCATCCTTCTTTAT
CGAGTTTCTTGACTTCTCTGTTTTCTTTTTCTTACTCCATTTTGTATGCT
TGCAGTTGCGGATGGAGGGATACAAATGGAGTACACCATTTAGCATTCAT
GCTAATGGGGTTATGTGTGTGATCATGAACAGTATTAAAGGAAATGATCA
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TCAAATTTACACAAACATTTTTTACTCTTAATAATCAAATTATAAATCAC
ATACACAGGGTAGAGAATCGCTCCATGTTCTTGCCTGTTCGGTTTCGGCA
AGTTGGTGGTGATGATTATTCTTGGCGTAGTCTACCTCCGAATTCATCAG
CTTCATTCTTTTGGGAGGATCTTGGCCGAAAACGTCTGTTGGAGGTATTG
GTTGATGGAACTGACGCTACAAGCTCCATGACATATGACATTGATGTAAT
CATGGATCACCAGCCACTTACCTCAAGTGGGCTTAAGAAAGCCTTGCGCA
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CTGCCAGATAATAGAGCTAGAGGGCAAACAACTGAGAGGCTATTATCACC
GATCTTTCAGCCATCAGAGGTAGACTGTGGGCAGTCATCTCAAGATCTGG
ATAGCGAATTTCATGTTACTTTGGAATTGACAGAGCTGGGGATTTCCATA
ATTGACCATATGCCTGAGGAAGTTCTTTACCTCTCAGTGCAGCAGTTATT
ACTTGCCTACTCATCTGGAATGGGTTCTGGTATCAATAGGTATAATTTTG
GTTGTTTGCTTTGTTACTTTATCACTGCTATTCTCTCCCTCATTAATTTA
TGCTCAAATGTCTGAAGTCTTCAATCTTTCAATGGTAGGTTTAAAATGCG
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ATATATTGGTGTGCAGGTGAGCTTATTTATTCAATGTCGGTTATTATGAA
ATGGCCTTTGGATTGACAAAGCTATTTCAGCTCTTTTTCACAGGCCTGTC
ATAGCTTGTACTGTCAAGTAGAGATTTACTTACATGTCTAGTACTCATCC
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TTTCCAATAACACTTGTGTATGTTTGCGAGTTCCCAAGAACTGTGTTTTT
TTTAACATCTATGAACCGATTATTTGGCGCCTCCATGAGATGGTTACTAA
GTAGATAATATGAAGTATTTGAATTTCGTTTCAAATAACAATTGCGTATG
TTTACAGGTTCCTGAGAATTGTGTTTTTTTTGTTAACATCCATGAACCGA
TCATTTGGCGCCTTCACGAGATGGTTCAACACCTAAAAATTGATAGGATA
TCTAGCTCTCAGCCTTCAGCTGTTTCAATTGATCCTATAATGAAAATAGG
GTATGCAATTAACAGCATCTTACCGGTAATTTTTTCCTTTTCAATCTATT
TTTTTGCTGTTAGTACTGAACTTTCTCTTACAGGCTTCTGAATATCTCTG
AGGTCCGATTTAGAGTTTCAATGGCAATGGCCCCAACCCAAAGGCCAAGA
GGAGTTCTTGGTTTCTGGTCATCCTTGATGACGGCACTGGGGAACATGGA
GCACATGCCGGTAGGGTAGTGTTAACAAAAAAATTATCTTCGTTCTTTCG
TACTGCTCATAATTGGTTCTTTTATCTCTAGTTTTACAAAGTGGCAACCT
TTTTGCTTCTGTAATTAATTGCTTTCTCTAAGCTGATGTATTTTTGTCGA
ACATTAAGGTTCGTATAGCTCAAAGGTACCGAGAGGAATTGTGCATGCGA
CAAAGTGCACTAATGAGCTCTGCTATATCTAACATCCAAAAGGATCTTCT
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GCGAAGAAATTGGTACGCGAGAGGAGGCCCTCAGCCAGTACCTCCCTCCG
CACGACGAGCTCTAG

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.