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GrainGenes Sequence Report: AE040469

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Sequence
AE040469
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE040469
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CGACGATGGACTGATCCCCAATCCGGGACAGAGCCGCCGGTGGCCAGGCC
ACATCGGAGGAGAAGGCACTGCCCCGTCGCTGTCGCCGTCGTCCGGCACT
CCGGCGCTGCCGCCTTCGTTCCTCTCCCGCAGCAGTCGGGAGAGAAGGAC
GAGAGGCTGCTGGAGCGTGTCGTGGAGCAACCACGGACGGAATTTGGCGC
GCGGAGTTGCGGGAGGAGCTGCTGGCGGCTCAGGAAAGAGACAACGTTGC
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AACTAGGGCGTCTTTTCTCCTGGCATTAGCGTTGGTATTGTACATGACAA
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AAACCCTACACCATAGTTCTAGAATACTCTACAAACACTAGATATACTAC
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TGAGAGATAATGTACTCTAATCTCGAGGACTGCAGTGTCCGTCGTCGCTT
CTATGACGACTGTTCCTAGGCTCCAGCCTTGTAAGTAGGCGAGCACCTGC
AGGGATCCTGCTGTTTCTCTAAAAGTGAATATCTTATAGGTAAATTATAT
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TTGTGATGCAGCATGGTTGCAGACAGGGTATAATTAACTCCTTAACACGA
AAATTTATGGTTGCCATGGAAGTGGTTTGAAATTTATCAACTAAGACTGC
TGTCCTGGAAGCTTACAATTACAAAATAAAAACCATTGTCATTGCTTAGC
CCTCCTTGCAAAGTCATGAAGACCTTAATGATCCACGCTCGCTATTTTCT
TTCAGGAGAGCGCTAGGAGGCTGAGAGATAAGGTACTCTAATCTCAAGGA
CTGCAGTGTCCGTCGTCGCTTCTATGACGACTGTTCCTAGGCTCCAGCCT
TGTAAGTAGGCGAGCACCTGCAGAGATCCTTCTCTAAGAAGCGCCGGCAG
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GTTTCTATATTCAGTACTAGGTGCAACCAATCAGTGAAACCAAATGCATC
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CCTTGCACTGCGCTCGCGCTACTCTGTGTTCTTGTGAGCCCTTGTTGTTC
CAATGGCAGAGCTGGTGGCCACCATGGTAGTCGAACCACTGCTCTCCATC
GTGAAGGAGAACTTGTCCAGCTACCTCCTCGACCAGTACGAGGTGATGAA
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TGGACGTCATCACCGACGCCGAGCAGGCGGCATCCTACAGAAAAGGTGTC
AAGGCTTGGCTCGACGAGGTCAAGGCGGTGGCTTACCAGGCGAATGAAGT
ATTTGATGAGTTCAAGTACGAGGCGCTTCGTCGTAAGGCCAAAAAGGAGG
GATACTACCAGGAGCTTGGCTTCGGTGTGGTAAAACTCTTCCCCACTCAC
AACCGTTTGGTATTCCGTCATAGGATGGGAAGAAAGCTCCGCAAGATTGT
GCAGGCCATTGAGGTCCTTGTGAATGAAATGAATGCATTTGGCTTTAAAT
ATCAACAACAACCGCTGATAACCAAGCAGTTGCGGCAGACATATCATGTT
ATCTTTGATCCAAAGAACATCACCAGCAGATCAAGAGACAAAGATAAGAG
GTTTATTGTTAATATTCTAGTTGGACAAGCTAACAATACAGATCTCACGG
TTGTTCCTATCGTTGGAATGGGGGGTCTAGGCAAGACCACGTTGGCACAA
CTTGTTTACAGTGAACCTGAAATTAAGAAGCATTTCGATTTGCTGCTATG
GGTGTCTGTCTCTGACGGCTTTGATGTGGATTCTCTAGCTAAAAGTATAG
CTGAAGCAGATTCCAACAAGAAGGATGGTGCTACAGAAGCAGCTGTGGAG
AAGAAGGATGATGATACAGTAGCAGCTGCCGACAAGAAGGATGCTGGTAT
AGAGGCAGCTGTTGCTTTCATGAAGACACCACCGGATAGCCTTCAGAGTG
CCATGAGCAGGCAAAGGTACCTCCTTGTACTAGATGATGTCTGGAAACGA
GAGGTTGATAAATGGGAACAGCTCAAAACCCTCCTTCAACATGGTGGCAT
GGGTAGTGTGGTCTTGACAACAACTCGTGATGAAGGAGTTGCTAAAATAA
TGGGCACTGTTAAAGCTTATAATCTCACAGCTTTGGAAGATGAATTCATT
AAGGAAATCATCGAGTCAAGAGCATTCAGATATTTGCACAAGGAAGAGAA
AAGGCCTGACTTGTTGGTGGCTATGGTTGATGAGATTGTGAAGAGATGTG
TTGGCTCTCCTTTAGCTGCAACAGCACTGGGCTCTGTACTGCGTACCAAA
ACTAGTGAGGAAGAATGGAAGGCTTTATCAAGCAGAAGCAACATTTGCAC
AGAGGAGTCTGGAATCTTACCAATACTCAATCTCAGCTACAATGACTTGC
CATCACATATGAAGCAGTGTTTTGCATTTTGTGCTATATTTCCCAAAGGT
TATGAGATTGATGTGGACAAGCTGATCCAACTATGGATTGCCCATGACTT
TATTATCCAGGAAAAGCAAGTTCGTCTTGAGACCACTGGCAAACAGATTT
TCAATGATCTGGCATCAAGGTCATTCTTTCAGGATGTGAAACAAGCCCAA
GCCACATATAAGCAAATTAAAAGCACCGGGGCATGTAGTTCCAGAACTGT
ATGTAAAATCCATGACCTTATGCATGATGTTGCATTGTCTGTAATGGAAA
AGGAATGTGCCTTGGCAACTGAGGAACTATGCAACATTAGATCGGTTGTC
GCAACTGAGGGACCAAATCAGAATGAGTGGCTTCCAAACACCGCTCGGCA
TTTACTTTTGTCATGCAAGGAACCAGCAAGAAGATTGAATAGTTCTCTGG
AGAAAAGCTCTCCAGCCATTCAAACACTTCTGTGTGATAGTGATATGGGA
AATTCATCGTTGCAGCATTTATCAAAATACAGCTCTTTACAAGCATTGCA
GCTCCGTGCTGGGACATCATTTCCTCTGAAACCAAAGCATCTACATCACC
TGAGGTACCTAGATCTCTCAAGAAGTTCTATCACATCACTTCCTGAAGAT
ATGAGCATTCTATACAACCTGCAAACATTGAACCTCTCTGGCTGCATATA
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TCTACACTCATGGTTGTCCAAAGCTGAAGAGCATGCCTAGAGACCTCGGG
AAACTCACATCCCTACAGTCACTTACATGTTTTGTAGCAGGTAGTGGCTC
TGATTGCAGCAATGTAGGAGAGCTCGGGAATTTAAACCTTGGTGGTCAAC
TAGAGCTACGTAATCTCGAAAATGTGACAGAAGAAGATGCAAAAGCGACA
AACCTCGTGGACAAGAAGGAACTAAGACAATTGAAATTACAATGGACTTT
TGGACAAACTAGTTGCCTGGATGATGCAAGAGTGCTCGAGAATCTCAAAC
CTCATGATGGGCTACATGCTATTATGATAAATGCCTATAGAGCCACCACA
TTTCAGGCTATTTTTCAAAACATGGTTGTGATCCATCTTTACAATTGTAT
AAACTTGCAATGGATTTTCAGCTGTGACAGTGATACATCATTTGCATTTC
CAAAACTGGAGGTGCTTAACCTAATCAATCTTGTCTGTTTGGAAAGATTG
TGGGAAATGGATAATGATGGGATGCAAAAAGAGATAATGTTTCCTCAGCT
TGAGAAGTTGGGTATTGTTCGCTGTAGGAAGTTGACAGCATTACCAGGAC
ACGCGGCCTTCCCTAACCTCCGACTTGTTAAAATTAAGGAATGTCCAGAG
TTGACAGCTAGAGCTAAATCACCAAAGCTCAGTCATTTAACAATGGAGGG
ACTTGAGATAGACCTGTTACTGTGGGTAGCTAGGCATGCGACTTCATTGA
CCTATCTGGATCTGACGAGCCTTGAAGCCAGTACAGAAACCACCTTGTTG
GCGGATGAGCATAGGTTTAAGGAAGTGGTGGAGGACAATAAAAAAGGGAA
TGATCATGATTTTCCTCTGACATGTTTGATGTTAACAAACTTTAAGTCCT
GTGTAACAGGCCTTTTTGCATGTTTTGTACACCTCCGAACATTGAAAATT
GAGAGGTCTCATGCGCTTGTCTACTGGCCGGAGAAGGAGTTTGAAGGATT
GGTATCCTTGAGGAAGCTTGAGATTACCAACTGCGGTAATCTGAGTGGAT
ATGCACAAGGTCTTGCCGAGCCATCAACATCATCAAGCAAGAGACGGTTC
CTACCACGTCTAGAGATTCTGAAGATATCTACTTGCGGAATGTTGGTTGA
GGTCTTCGATGTCCCTGCGTCTCTCAGGAGAATGGATATTCGTGATTGCA
GCAAGCTTGAGTCCGCATCTGGCAAGAGGCTGCAGCAGGGACAGTCAGCA
TCTTCAATGCATCAAGTGGCATCTCTGGAATCATCATGCGGAGCTGGGGT
GGAGCATTTAATATTAGTGGGGTGTCAAGGCTTAACAGGGGTCCTCCATC
TTCCCACGTCCCTCGAGACACTACAAATTGGTCAGTGCCATGGGTTGACA
TCTCTGGAATCTCGGTCAGGAGAGCTCCTGTCCTTGGAGATACTTGTGCT
TCGACAATGCCTTACCCTGTCATCCCTACCTATTGGGCCGCAAGCATACT
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TGCCCATTATTATCGAGGTAAGCACGCAGCAACTACCATCTCTTTTACTT
AGTAGTGAGTGTAAAACGTACCAGTTAGATAATGATCATAGTATCACTAG
TAGTATGACAGAAGATCAGAGTAAATTAAATGGTAATTTAGCCTAAATCC
GTTGTTTCTTTAATGATGCTCCTCTAATTGTAAGTTTTTCATCATTACTC
TCTGCAGATACTCCAAGGTCTATGCCATCCGTAAATATTACAGAGCTATA
AACATAATCGCGGGAATACCAGCGCGGAAGTTGGCATGCAGGTTTGTGAT
CTAAAAACATGCGACACTGTTGGAACCCTCTGGGCTATCATTTTATTTCC
CAGAAAGAGGAATCTTGTTTGGATAATAAGTACTTCCTCCGTTCACTAAT
AGTTTGCTAAAACGTCTTATATAAATGAACAGATGGAGTACTTTTTTTTC
CATTTATCATTGTATTTCCATTTATCATTGTATTCTACCCTAGGCATTGT
TAGTTTTTGTAAAAATTCTGTCAGAGTTTCTCAATTTTTTCTATGAACAG
TACTATTTACAACCAATATTCTGTTTTCCAAGCATGGCAGTACTACTGTT
TCTACTTGTATTATGGATAGAAGGGTGTGTGAATAACATTCTAGAACTAG
AAACTTGTATTTATCACAGCTGAGCATAGAATGTTCTATAGTATATACGA
TTCGAATATCATGCAAATCCTAGCCGCACTGTTGGATATAAAACTGGGCA
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AATACATACAAGCAAAACTAGGGATTTGCTCCACCGACGGGGACCCAAAC
CTGGGTAAATCGTGTGCAATCATGTTCCTGGACATGCGTTATTTTCCTTG
CTTCTCTCCTCTCGATAAGCCACCTCGATGGCTATATCCGTTACTTTCCC
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AATAATTAATAATATCAGTCAATAATAGGAATAATACACATTTAAACTTT
GAAAATAATATATCCATTTCATACGGGTTAATTCATAAATATCTCCATCA
TGAGTTAATAATATCGGGTTAGCATCTCTATCCCTAGGACAGTTCATACT
ATCATTGTACGTACAATAAGTAGTTTCACCGATGATATTCAAGGATAATA
GGATTAAATTGTTCATGAATACATGGAAATATTTATCATCGCATGATTGA
TTCCAGGGCATGCTTTCAACACTATGTGGGTACGGACTTTTTTACATGTT
ATCTTGCTTAGAAAAATATTATACTCAGACATCATTTTCTCAACTTTGAC
CAACTACATGGTTATTTTATATATCCATTATTTATCAAAAGGCTTTTCAT
TCTGATCTCATTTCACTCGTAATTTTTTTCGCAAAAACGCAAAAGCTTTG
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AAAGGCTCAGAAGAGCCGACACCCCATACAACTCAACTCACTAGTTCTAC
GGGGCCGCCGGGATCAGGGCACGAAGGCCACATGCGCCTGCAGCAGCCCA
GGAATAAGCTTCAGATCGAATCGTGCTGAGAAGGGTCTCCATGTTGGGCG
ATGCATTGTCGAAGATGACCGCGTTACGTTGCTTCCAGGTCCACCACGTC
ATCAGCATGATGAGCGAGGACGTACCCTTGCGCATTGCCCGGGGGGTAGA
GGACGAAGCTTGCAGCCACCAATCCACGAAGTTTCCTTCTCTACCCGGTG
GTGTGATCGTTGGCCGAATCCAGGAATGCACATCGTGCCAGATCGCCCTG
GAGAAGGGGCAAACACCAGAAGATGAGTCATGGTCTCGTCCGACTAATCA
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TGGTCTTCACGGTTCTCGATCTTGGAGGTATTTTCTTAGACATCAATCTC
TATATACATAATTATTACTCCGCATCAGTTTTTCTATACACAGAAGCTCT
CGATTCTCCTCATGTCACAAGGTCCAATTAATAGATAGGGGCAAACGAAG
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GCACTGCAAATGCTGAAGCTGATGCATTAGCCAAAAAAAGGTTGTTCCTT
AAACTAGCGAAGTTTAAACGGACTAAACCACTGTGTTTTGGTCTTCTACC
ACCCTAATTTCTGTAGACAGAAAAGAGCGGCTGTTGTTACATGAACAATA
ATGAGCACATGTGTAAATAAAAGATGCATATAGTATATAAAGACCACCAA
ATAGGCTGGCAGATGATTACAAAACCAAAGGTTGCGAGCTCTGCTGTCCA
GTCGTTGCTTTGCTTCAGACAAAACCAACAAGCTAGGTCTCTGGTCTTTG
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GTAAAGTAGTAATGTAGTGGAATTTGCGGTCACAAGCACACGTAGAGCTG
TGCTGTCATTTACTGGCATATTTTTGGACATATTTATGCTAGGTGTCATT
TGAAACTATTCAATACATTGCACCATTTCTATGTGCCTTCAATGAGTTAG
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AGTCCCAATATTAACCAATTTTCTTCTAATGAGAAACTAAAGATATCTTT
CCTTAAATCACTGTGGAAGAAACTAAAGATATCTTCATGATAAGTTGAAA
ATCATATGTAATTTCTTGTGAGGTAAATATATGTGTTCGTAGCTCTTATT
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AACCCGCAGAAATCTAGCTACCTTGTTATTAACGGAATTTTTAATGCCCA
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CCACGGGATCAGAAACCTGACTTGATTTCTGTATAACAGAATAAGCCCAT
AATCTGAGTCCGGAGCTGAATTAGCCTGGTGCAGTAATTTTCCCCTTTGG
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GGAACAAGACATGGTAGTCACTTCGTCTATAATATCTTATATATTTTTGT
GTCATCTTCAAATTTATCACATTGCACTAATCGATGACTCTTAATAAGAT
ATATGTAATAGTATCTAACAGTTCACAATATTTAGCGCACACATATGTTT
CATATGTATGCCTATTGGTAATCATGTTGACGCCTTTCAGAGGTGGAGCC
TCTGCCGTTCTTCAGATTTAAATGCATAATAAAACTACTTCTAAGAAATA
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ATCTGTTTTCCCATCGTTATTGCGCTAACCTATTTTCTAAAATTAGATAG
GCAATAAAAGGTATCCAATTAAACTATGCCTGCATTTGACTAGCCAAATA
GATTAAGGGCCTAAATTATCTAAAAGATAATTTTGCAATAAATACAAGCT
CGGCATTTTCTCAATGAGAAAGGGGTGATGACAACAAAAATAAATGGGAG
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TGGTGTGTGTAAGTGCGGGTGGTTGTGGCTTGGGAGCCCAATTCCCCTAT
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CGCTTTAGTAGCCATGGCGGCTTCGATGCAGGTCAACACCCTTCCCGATG
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GTTTATTTGCTGGGTTAGGGTTTGCTGGACGATCAGTTCCACCAGCTGCA
GCTGCTCCAGGACGGGAGTGCGCCGAACTTCGTTGCTGAGGTCGTCAAGC
TCTTCTGCGAGGACGGCGAACAGATCATCGGCGAGCTCGCCAAGCTGCTG
TAATTGTCTTTCCTCTATTGGCTCGCTTGTCATGTCCTGTGAGATCAGAT
GTTTGATGCTTTGCTTGCAGGAACAAGCCATGTGTTGACTTTGACAAGGT
GGATGCTTTCGTACACCAGCTCGAGGGCAGCAGTGCAAGGTGAGGTTCTT
TTCTTCGTCTTTTATGTCCTGTAGGCTGTAGCTTATGTGTTTCTGCAATA
GCATAGGATTGATGGTTCTTGTTACCGGTGCATATCGGGTATTATGTCCC
CATGATTTTTTTAACCATGTTTATATCCCCATAGATTGGAAGGACATAGA
TCCTTTGTAAGGTACGGTCATCTTGGGGAAGACTTATCGTCGGTTTGATC
ATTCTAGTGTTTTACGAAGTAGATCTGGCAAACGCGATCCATTTCACGTA
TTGGTGCATTATGACTAGCGCTTCCGATCCATATAGTGAGGGATGAGATC
GGTTTGTCCCTTGTATTGATTTATCATTTACATCTGACAAACTTGATCCA
TTCCGTACACATTGGTGGCATCTTCCAATTAATTCGCGAAGAGGTTGAGA
TACCATTTCATGATTTAGATCCGACAAATCAGTTGTCGTTTTACTGTTTT
GTGAATTATATCCGACAAATCATTTTGTCATCGTAATGTTTTATGGTTTA
GATCTGACAAACTATTTGGCCATTGTAGATCCGCCAATCCATTTGGCTGT
TTTATTGTTTTATCATTGAGATCTGACAAACCATTTGGCCATTTTACCTT
TTTATGATTTAGATATGACAAATCTTTTTGTTGTTATACTACTTTATTAC
TTATCTGCAAACCTTTCGGTTGTTGTAGATATGACAAACTGTTTGGCTAT
TTTACTGGTCTATGTTTTAGATCCGTCAGATCAATTAGCTATTGTGCTGG
TATATGATTTAGATCTGGCATATATGAGCCGCTTCGGTCAAATCGGATAG
CTCAAGGCATAGCACTCCAGATTCTCCCATGACAAGTTTTTCACCCAATT
TGTATTGGAGGGGCTGACAGTCGTTGTGCCATTGTAGTGTTTTAAACAAG
ATATGATAGGTTTGCATGTTTCGCCTTTGTTTACGAAAAATATAGCAGCT
CTTTTTTGGTTTTGGGGCTTTGTTCAACTGGTATAGGTTCCCAGACCATG
GTATTTGTAGTTCATACAGAAGGTTTGCTAGAGTTAACTAATAATTATTT
ATGGAAATAAAAATTATTAGAGAAACTAATTTTATTACACTTACAAACTA
GCATTATTGTGCTTAGGAACTACTATTATTATGCGCAAACCATCCTATTT
CCGTATCCAGGTGGTTATATGAAATCAATGTTTGTTAGCCAATGAGTCTA
CATGTCTTTGCTTACTATAGGTTGTAATTAATTGGCTTGTTAACCCATAT
ATGGATGATCATAGTGCTATAGTTGTATTTATTGTTGGGAATAAGAAGTG
AAGAGAAAGAAATACAATGCTCTCTTACATTTATTAAAGAAAATTTGGTG
GCACTTTCCTGATTGTATAGTATTAAATATTACAGTATTGGTGCTCAGAG
AGTGAAGAACACCTGCATTCAGTTCCATGAGTTTTGTCAGGAGAAGAGCA
GAGATGGGTTAGTATCTTGTATCATTATGCCACAGTATTGTATTTTCTAT
CATCGTCTTATAGAAATCTTCATACTGAATATGGCCTAGTTTTATATTAA
TGGTATTAGAGTATTTATCGATATAATTGCGTGGTCATTGCTTTTGTAAA
CTGCTAAAATATTCAGTCTTGGCAGAAATATTGGCTGACTCTACCGAGCT
TGGTGGGTTAGGAGTGTGACTGTTTAGTACAACAAATATGTGCTTTGAAA
ATGTTATATTATATGTAGAAAACTATTCCACTCATGATTAAAAATTGTAG
CTACCATGTTTTTTCTGTAATTATTAACATGCTCCTTTCCTGAGCTGTTA
ATGGAAAGGGTGCTTCACAGCTTACTGAACTGTTCCCCTCGTCAGGTGTC
TCAAGGCATTGGATGCTCTGAGGAATGATTTCTCTGATTTGCGCAGCAAG
TTTCAGACTTTGCTTCAGGTATTTACCTTAGATTTTTCTGACACTCGTGT
TTAACTCTCAGTAGCATTGCAGTCAACTGGATTAACTTCTTCCAACGATT
TTTTTATTTCTGAAGTTTTCTTTTTACGAAAAATATTAAACTAGACAGAA
AACAAGATGCTAATGGAATGGATTCAGCTAGTTTGCTGCATAACAACAAA
CGAAAATCATGTTCTTGAACTGAATGCAGCTAGTTTGCCTGACATACATG
AAATTACTAGTAATAACTCTGGAAGATAAACAAAGCATGGACGTGCCATC
TTCAGTTCTTTATATGCAAGTCCGTGTGGCATTTGCAGTGCTAAGTTTTG
AGTTATACTTGGACCACCACATGGTGTCTAGAGCACTATTTAGGACTACC
GGAAAGCTGAGATGAAAACAATCATTTACCGATTACTGTTTTGGGTATGT
ATATATCTGAATCTTAGGTTCTGTCGCTCTAAAATGTCATTAGAATTTTT
TTCATCTCAATTTTCGAAGCATTTATAGACTTCATGCATCTGGCCTATTT
TTCTGTTCTGCAATGCAGCTGGAGCAGCAGGTCGAGGCCTTCCATCCTAA
GCAGTAAGCTGGAGCAACAGAGTGGGGGCCGCATGTTCTGACTGGCACTG
TTGCCTATGAAGTCGTAGAACATGCTCAGTTTGCTTTTATCTTGGAGTCG
TTTGCCTCTGTGAGGCCTGCAGCCTGCTTAGCGGCAAGCTGGTAATGTTT
GTGTCGCCGATATGGTAGTGTCGTTTTGAATTCTCAGTGGTCGAATAACA
ATCATCCGCTGTCTCTTTCCGGATCGTCAGTGGTTAATCTGGCTGCTCAG
TTCTAGCCGGTTTCTAGGTCGTAGGTTGGTCCGCAGTGTAACCGTGACAT
AGTCGTTCCTCGTCGGTCACCGACCGACTGTGGTTGTATGTTGTGGAGAA
CATTTGTGGTGTTATTCTACTGTCAAGTTACGTTTGCTGTTGGAAAAAAT
GTGCGTACCATGAAGCTATAAAATTGCCCAGTTCAAGCTTTTTCCTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.