Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE016117

[Submit comment/correction]

Sequence	AE016117
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE016117
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	CCCCCCTTCTCCAGTCGACACCGTTCACACCAACTTCTCTCTGCCTTCAC AGCTGCTCCCCGCCTTCCGGGGGAATTCAAGAACGCAGGAAGAACCCTCG TACTATCCTCCCTCGCTTCTCCGAGGAGCGTCAGCGTCAGCGCCTTCGCT CCCTTGCCTGTTCACCGCCCGGTTCTTGTTTGCCGGTGGTCGGGGGCTTC CGCTTCTCGGACTTCCTGACCACCCCTCCTCCCATGAGTGCGTGGAGGCA GCTGGATCTCCGCGAGTGACCATGAGCCAGAGTGAGTTGGAGCTCTCCCA TCGTTTTCCCCCTCTGATTCTTGGTACGCGGAGCGGGCCTCCTCTCTGCT TGTGGGTTGACCTGGGTGGGAGACGCGTTCTTGGCTTGTTAAAGTTGATG ATGTAGTGAGGCGTCGCTTTTTGTCAAGTTTGTACAGCGCAGTTTAACCC TGGATTTTTTTTTACCTGGAAACTAGTACTAGTTCCTTGGGCTCCTCTAT TATGCGGGCGATTGATCAAATTTGGTGCTCAAAGAAGAGTTGTTTGATCA AGAGTTGTTTGATCAAATTTGGTGCTCAAAGAAGAGTTTTTTACCTGGAA ACTAGTACTAGTTCCTTGGGCTCCTCTATTATAGCTGCCCAAGATTGTTT GATCAGCTTGTTTTCCGTGGCTGGAGTTGGCATTCTTGATGCCGTTTTTC GTTTTAATTTCTGTCATAACTGTAAGAGGTCGAATGTAACTAGAATATAA GCATACGTATTTTTATTTGATTTTTGCTTTTGTCAGGATTTCACTAATCC CTCGTCATATTACTGTACAAACGCTGAATTAGACTTGAGTTCCCAACTTT TTTTCTGTACTGTAGTAGCAGCATTGTTTCGAGGAGAGGATCATTGATTG CTTCAGCTCATGCATAACTAAATGTTTGGCTTTGTAATTTTGGGCTTGGT AGAAAATCCCCTACCATTTTATCTTATCATCTACCACTTCTTTCTCCTGT AGGTTTTGACATCAACGGGCTCCTCAAAGAAGCAAGGGGGAGGTGGTTAA AGCCTTCTGAAGTTTACTTTATCTTGCTGAACCATGAGAAGCTCCAGATC ACCCATCAGCCACCAAATAAGCCACCCAGTATGGCACATCTCCTTAGTTT TGTGAATACTTCTGTCTTTACTTTGGTACAATAACAGTATCATTTGTTCT CTAGGTGGCTCACTGTTCCTGTACAATCGCCGTGTGAATCGGTTTTTCCG GAAAGATGGTTATGCATGGCGAAGGAAGAAGGACGGAAGAACTGTTGGGG AGGCTCACGAGAGATTGAAGGTTTCTTCCAGAAATCTCTGTGTAGTGTCA ATATTATTCCAAAAAAAAATCTTGTTGTCAATACAGTCTTCCCTAGTTTT CTCAATATTCAACAACACAAGTATTACAAGACATGGTGTCGTCTGTCAGG ATCTTAGGGTGACTCAGTGTGCATGTTCTGCTATTGATGCATCATCCTTA CAAGAAGTAGCAACATAACTGTACGATGTTGCATGACAAATCAAATATCA CGAAGTGATCAGACCACTGATGTTCCTTTTTGCTCAATCACATTGAACAT TTGTACAGATTCATGTATAGTTCTTGAATGGATATCGTTGCACTGGTTGC TTTGCTCTATAGTGTTTCTCTGTAAAGCGATACATCAGAACTGGAACAAG GCAACAAGCACGTAACTATATCACTTATAGTCATTCTTTTCATGGGAATA GAGGCTTACAGAATAACTGATAACTGATTGGAGGCTTTCCAAATTAGTCA TGATGTGATGCAACATCATTGGAGCAACATGAACAATTTGATTTAAACGT TTTAATAGCTAGGATCCTCTTTTGCCGCAACTCATGCCTTGTATATAGTA TACTAGATGTGATATCTTAGAAATCCTCTGTTGTATGGTTAGCTTGATTT TTTCCTTGATTACTGGGTATTATAGAATATTTTATAATCAGAGCTTCAGA ACGAGTTGTTAATCAACATGCTTCAACATCTTGTATATGAGTATATGACA TTTTCATATCATCACAGGTTGGAAATGTTGATGCTCTGAGCTGCTACTAC GCTCACGGAGAGCAAAATCCATGTTTTCAAAGACGATGTTTCTGGATGCT GGAAGCGTAAGATCAGCTTTGCCATTCAGCTATCTCAAAATCTTCTTATG ACTTGCTTGAGATTGTGAACTATGTTATGTATAACATTTATGTTACAATT GTGCTAAGATGCCGAGTGCTACTTGCTATTCATTTGCTATCTGGGAAACA TTCCAAACATTTTTCTGTGCAAATGGTGGTTAGTAATGTTTGTTATAATA CATATTGTCCTTTTCTGCAGTGCATACGACCATATTGTGTTGGTACAGTA TCTAGAAGTGGCTGAGGTATGTGAGTATTATCTTTGGGAGCAAGGATAGA TCTGCATGATATACTTCTCTGTAAATATTTCTGGTGTTGTTTTGGAAAAA TCATCTGTCCGGGAAATAAATGCTGAAAAGACTTGACTGATTAAGCTAAC ATATGCACCCATAAAAATTTGATTCACCATTATCTGCTTATACTAAACTT GATCTGGTCATCATATGTCAAATGTAAATAGTTATAAACCAATGCGCCAT TTCAGTCATCACTGTAATGCATATCTCAGGAATTTTTATTCATATCAGGA TTCAATTACACATCCTATCAATCTGTCATTCACAATTCTTAAGCCTGACA GTAGCTCAGTCCCACAGTTAACCAATCACTTGTAGTTGCAGATCGCTCTT GTAATATGCATGTAAAAAAACCAAATAAATAAGACCGGAAGCTTCAGTTA TGATTACGCATCACTCCATCTGGCACTTTGGCCTTCTGCCTTAAATCTTT CCACAATAGAATAGATATGATCTTCTTCACAATTTTCACCAAAATAACCA GTGGCAGTGTATATCTTTCTTAAGAACTAATCCACACCGTTATAATCTGG TTTTTGAAAATAAGCAGTACAGGTCTGGAACTAATCTACAGCGTTATAAT CTGGCCCAACAAAATAGGGCTTGTGTAGATCTTTTCTTTTTTCTCTCAGT AATAATGATAATTTGTAGATTTTTTATTTAATATTTGCTACCCCTCAAAT TAATATTCAAATCAATTAGATTTGATCCCATACGCGTGTAAGTTGTAATA GTGATAACCTCCTTGGGTCCACTCCTGTTGTATTGAAATACAACGGAAGC ACATCATAGTAATGTTGTTCATGAAACTTTCTTACAGGGACGATATTATT CATCATTATCAAATGTATCAGCAGGATCTATTTCGACCCTGAGTTATCCA AGTGAGAAATATGGAAACCACGGCTCCACTTCAGACTTTAGTGAGGGCAG TGAATCCCGCCAGAGCTCTGTAACTGAAGTAAGTTCCTATTTTGCGAACA AAGAGTACAACCATGATAGCGGCCTTCTACTAAGCATACCAGAGGTTGAA AAATCAACATTAGTAGGGAAACCAGAACTTGGCCAGACTAGTCTGGAACA AAATTCCGAATTTTGTATGACAGATAGTAATGATTCAACAAATAAATCTG GGCTTGACAAAGCTTTGAAGAGCATCACTGAGCAGTTAAGTTTGGGTGAT GATGACTATGTTTACGTAAATCAAGCGCGGCCTTTGGACTTTGTTACGAA TATTGAGGCTGCAGAAAGACAGGAAAATCAGACAAGCAATAGTCCAGGTA AAGTTCCAGGTTTTCCTGCTTCTCTTTAATACTACTAGATACACGGAAAT AAAATTACACTAGAATATGGAAATTAATAAAACTAGATGTTGGAAAGCAT GCTTTGTGCTTGATTTGCCAAAACTCACTCCTCGACACCTTTGTGATCGT ACAATATTTTTTTGCTGATCTTTTTTTTTTAAGAATATTTGCCGATCTTG GTAGAAGTTAACTTTGTGCCAAGAGCCCACATCCTTTCGTCTAGAGACGT TCATACACACCATTAAGCTTGGGGTGTCCAGAATCTGGACCAGCTAAATG ATTGTTTGATATTTGTAAACTAAATTAAATTATTTGCATCCTTTACAGGT GATGATAAAGCAAATCAAATTCGAGCAGAAGGAACTCAAAATGGTGGTGG CAGGGGGATTCCACCATCGTGGGAAAATGACCTGCAGTTCAATTCAGGTT TGCCAGAGTCATCTACATACCAGGTAAGAAATGATGACTGCATGAGTTTT TATTATCCTTCTGTGATTTCTTCAACGTCAGGAATTAGTTGTAAACAGTC TAATATGTTATTTTGTTTGCGTTTTAAGAGGGATACCTGCAGAGTCATCC CTGATGAATAGCTTGGAAAGTTATTTCTTAACTAATACTTTACGGGCATT AAGTTACTTTGCATTTAAGATCAGGTCCGTGATACTATTGTGAAAGTAGC AGAAAATACACAAAATTAATGTGCTAATCATTTTTGTTGGTACCATGTCA AACTAGTGCGTTCAGAACGTTTTTACCGTGACCAGAACTATATCATCTGT ATTACCATGCAAGGGGTTGTTGATTATTTCTACATTATCACCCTCAATGA AGTGTATTGACACCTTACATCTTACATGAGCAGTCTGGTGCCCACTATCA GCAAAGTTCAGAATATCAGCCACCAGAAGGCCTAGACAGCAGTGATTTGC AGATGCAAATTTCTGCTGCTAAAAGATTTCTTTTAGGGCCAGAAGACTCT GTTGACTCACCATCTTATAACTTCATACCAAGAGATGAAGGAATCAATGG CATTGATACTTTTTCAGCTCATGACAGTAGTCTTCAAAGCTATGTGAATC CGGACTGGACAAGAACAACTCCTGTAACACTTCAAAGTGGTTCGTATCAA AGCAATCTGTACCACTCTGAAATATCAGAATCGTTGTTCGACCATGGTCA GTTTGAAACATCCTCGGGAGAGGATAAAAGACTAACCTTGACACCGAAGC AAAAGTTTAATATTCGTGAGATCTCTCCTGAATGGGCATTCTGCTATGAG ATCACCAAGGTACACCAAAACATTTTCAAATTTCTACGTTGTAATACCAA TTGTTCTTATTTTTTACCCTTCCTCTCATCAATGCAGGTCATAATTACTG GTGATTTCTTGTGTGATCCGTCAAATTCATGCTGGGCAGTAATGTTTGGT GAGAGTGAGGTGCCTGTTGAAATTGTTCAGCCAGGTGTTCTTCGCTGTCA CACACCACTACACAGTAGCGGTAAACTCACACTCTGTATTACCACTGGTA ATAGAGAAATTTGCAGTGAAGTCAAGGACTTTGAGTTCCGTGCAAAGTCA GCGGCTTCTAGTTTGACAGACCTCGCACCATCATCTAGATCTACAAAGTC TACTGAAGAGTTGTCACTTCTTGCCAAGTTTTCAAGAATACTTTTGTGTG ATGATGGATCCTCTGCAGTTTCGAGTGGTTTTCCACAGTCTAGACAGAGT CCACAACATAAGATTAATGAGGAGCACTGGCAGCGGTTGATCGATGAACT CGATGTAGGATGTGAAAATCCACCGAGTGTGGTTGATTGGATTATGGAGG AATTGCTGAAAAGTAAATTACAACAGTGGTTATCACTGAAGCTACAAGGA AACAATGGAACATATTGTTCTCTGTCCAAGCATGAGCAAGGTATGATACA CTTGATATCCGCGTTGGGCTATGAGTGGGCACTGTCTTCAGTTCTCAGTG CTGGTGTTGGCATAAATTTGCGTGATTTGAATGGATGGACTGCACTTCAT TGGGCTGCTTATTTTGGAAGGTAATCAGACATTAAATTCTATTGCTAGTG ACTTCGATTCTGTTTTGACTATCCAGGAAGTTATGCATAGATTTCTAAAT GAGAAGTGCTCCACAATTTTACGAGCAAAAGGCATATCCTTTTGTTGGCT GAAGAAACCATTTTTTATCCAAAATTATAAATGGCGGTGTTTGTACTTGG GTACATGGCAACCTAGGTCGCGTAGAAATGGTCATTTTACATTGGATAGA AAAGATAAGTATTTAGTAAGCAAGACAATACATCAGCAGTGTTCTTTAAA TGGTAGTGTATCTACTGATTATCACGGAACTGGCAAGCAACCTTGTTAAA ACATTATTAGTAATACTCCCTCCTTGCCGTAATATAGTGCATGTAAGATT TTAAAAAAGGCAAACGTCATCAAATTTGACCAATTTTATTGAGAAAATTA TCTGTATCTACCATACCAAATGTAAACCATATGAAAATATACATCACGAT GAATCTAATGGTATTGATTTGGCGTTCTAGATGTTGATAGTTTTTCCTAT ATAAAATTGGTCAAACTTGATAACGGTTGACTTTTATAAAATCTTATATG CACTACATTTTGGCAAGGAAGGAGTATTAACCAGTAACTCCATTTTTATT GCAGGGAAAAGATGGTTGCTGCACTTCTTGCTTCTGGTGCATCAGCTCCA GCAGTCGCCGATCCAACTGCACAAGACCCAGTAGGCAAAACAGCAGCTTT CCTGGCTTCTGAACGAGGACACATGGGCCTTGCTGCCTATCTTTCAGAAG TGTCTCTAACTAGCTATCTAGCATCACTGACTATAGAAGAGAGCGATATT ACAAAAGGATCAGCTGCAGTTGAAGCAGAGCGAGCAGTAAAGAGCATTTC TCAGAGGAGTGCCCAACTGCATGGAGGCACTGAAGACGAACTCTCACTGA AGGACTCTTTGGCAGCTGTGAGAAATGCAGCTCAAGCAGCGGCTCGAATT CAGAATGCCTTCCGTGCCTTCTCTTTCAGGAAGAGACAACACAAGGACGC TCGACTTAAGGATGAATATGGGATGACACAAGAAGATATAGATGAGCTTG CAGCTGCATCAAGGTTATACAACCAACATCATGTTTCGAACAGCCAGTTT TGTGATAAAGCAGCTATTTCAATTCAGAAGAAATACAAGGGTTGGAAAGG ACGCAGAAACTTTCTCAACATGCGCAGAAATGTGGTTAAAATACAGGTAA AAGAATGAGAAGATGTTTTGTTTTGAAGCTGTGTTCAAGCTGAACTCACT GGTGCTTGATTGCTTTGCTAACCTGAAAGAGCTTATTTTGTACAGGCTCA TGTAAGAGGTCACCAAGTGAGAAAGAAATACAAGACTTTCATAAGCACTG TTAGTGTGCTAGAGAAAGTAATACTAAGGTGGCGTCGGAAAGGACATGGC CTACGTGGCTTCCGAGCTGAGCAATCAGCAATGATTGAAGCAGCAGAGGG AGAGGAGGAAGATGACGATGACTTTGCTGATGACGAAGCAGTCAAGAACT TCCGTCGACAGAAGGTTGATGAATCTGTGCAGGAGGCTGTGTCGAGAGTA CTGTCCATGGTAGACTCTCCTGAAGCAAGGATGCAGTACCGCCGAATGCT CGAGGAGGTCCGTCAGGCAACAGTAAGTGGTTCATGGATTTACCATTTAT TAAGCAATTTTCTGATTATAAGTCATGTTTCCCAAGGAGACTTACTACAA TGTAGAGATATTTATAGAAAAATAAAGAGGAATTTTCTCCAGAAAAAACA AAAGACTAAGGTTTTAATCCCTTCAAAGGGGCCAAATCCAAATGCAGCGC AATCTTAATACAGTAATGATATACTTCCTCTGTTCCAAACGTAAGCCTTT GGAGGTCCGTCGGGCAACTGTAAGTGGTTCATGGATTTACCATTTATTAA GCAATTTTCTGATCATAAGTCATGTTGCACAAGGAGACTAGTACTGCAAT GTAGAAATATTAGAAAAATAAAGAGGAATTTTCTCCAGAAAAAACAAAAG GCTAAGGTTTTAATCCCTGCAGAGGGGCCAAATCCAAATGCAGTGCAATC TTAATACAGTAATGATATACTTCTGAAGAGTTCATTCAGTTTTGTCATTC CTGTCCAAAATCAAATCTCAGCGGTATTTTAACCATGCTGGTCTGGTCTG AATGCAGGCTAAACTGGGTACATCTGATGAGGCAACATCATCCATATTCA ACGATGACTTACTACTAGAAATCGAAAATTTCACATGGTGAAAGAAGCAG GCAACACGAGGAGTGCTTGTTGAGCCGCCTCGAATGATATAAAGTAACTA GGAATTTAGTACGGTATGCAGTTCACTATGACATGATAGTGTCCAGTTTG TACAGTGTTTGCCCGACTGTTGTAGAGTGATGGTTCTATCCAACGATGAA GACACGAGAGGATGATCCGTGTATTATCTTAAGTACAAAAAAGTGATGGT TTATTTATGTAGTGTCATATGTAAGCTATGTATTAACTGGGAATGGCAGG TTATGAACACCCTAATTGGTTATCTTTAACTTAAGAAGTTGCTCAATAGA ATTTGATCAGCGTGTCAACATCTGTT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.