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GrainGenes Sequence Report: AE039201

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Sequence
AE039201
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE039201
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CTCGCTCTCCTATCCTCCTCCCCTCCCCCTCAGGGCCATCCCCACCATGG
CCTCCTTCCCCTCCCCCTCCGTCGCGGCCGCGCCCCCGCGCCTCGCCCCG
GGCCTATCCCTATCCGCCGCCGCCGTCCACCACTCCTCCCACGCCTTCCG
CCCACGCGCAATCGCCGCGCGCCGCCCTTCCCTCGCCCTGCGCCCGTCCG
CCATCGCCGCGCCGGCCAGCCCCCTCCGCTGCTCCCACCGCCGCGCCGTC
TCGCCCAGGTGAGTACCTACACCGCACTGACCAAGCCGCCGGTTAGTGTT
CATCCTTCGTGGCTAATTCGCGTCGGTTTATGCAGGTCGAGGAAGCGGAC
GCAAGGGCTCGGGTCGTCGGCAGCTGGGATTCTCGGCGAGGAGAGGGACG
GGTGCCTCTCGTGCTTCCCCAGGACCCGGAGGCGGGGGCGACCAGGCCTC
GCGAGGTTCGCCCCCTGCGCGCTCCCGCACGCCTCGGGGTTATCGCTTCA
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ATGCAAGTAGATGCAGGATAGTATGTCATTAGCACAATAAATGTGAACTG
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AAGCCCAACATGGTCCGAGGCAGCTCTTGATAAACCTTATCTTGATCATG
CCATTGGAAACGAGGAGCTTGAAGCTGTCCTGGACACTCCTCTTCCTTCC
CATCCAAAGCTAATCCGGGGTCAATTGAAGAATGGCCTCAGATATCTTAT
TTTACCAAACAAAGTTCCAGCAGACAGGTGAGGAAACCTCTTTTCATTTC
CATTTATTACACTATTTGCAAAAGTACTTCCATAATTTTCGTCTGCTGAA
ATTAAATTATCTACATGATTTGCTGCTACTAGCTGGATTTCCTAGCATAG
TGGGACTATGAAGAATGGCATGGGCCATACTGGCGTGGTCATTTCCTTGC
AACTGAATTTTTATCAAACCCTTTGTACAGTCACAACTTCAATTTTCCAG
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TTTTACTTGTCTTGATTTCTTCAGCATAGAAATTGCGTGCCTGTATATGG
ATACATCGGCAAACATTGTGGTTTTCCTTGCTCGCTCTTGTTTTTTAAAT
TTGTTTTCAACTTCGGAGACGTTCAAAAAAAATTATAGGTAAATTCGTTA
AACAATTAGACTGGGACGAAGTTTTGATTTGAGTTCTTGAACATGAACAT
TGTACCCTAGTACATATATCCACAGTAAATATGGAACCATTCTTAATTCA
TGCCACACAAAAACTTCAGTTAAGTTGGACCAAGCAAAATTAGATATACA
TGTTAAATATGTGCACTATGGTTCTAACTATTTTAGTTTGCAGGTTTGAG
GCACACATGGAAGTTCATGTTGGATCAATTGACGAGGAAGAGGATGAGCA
GGGAATTGCACATATGATTGAGCATGTTGCATTTCTTGGGAGTAAAAAGC
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TTTTGTGTCTTTCCTCAATTAACTCCTAGTGGTTTGTTTGAGGCCATTAT
GGTTTCCTGTTTCCATATTTTCTTTGACAAGGACTTAAATGAAAATGGAT
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AGTTTACCTTTTGTGTGGCAGGAATATGGCGAAGCCTTACTCCCTTCTGT
GCTGGATGCTTTGAATGAGGTAAGATGTTATTACTCATTTGCATTCCTAT
ATGTAGGAATTATAGGATGTTTGCTGACTTTAGGCTATTTATTCATTAAG
CATATTTGAAATAGTAAGCATATTCAATTTGTTCGAGCAATTATAGTGTC
TGTCAACTATCCGCTATCATTTTTTGTTCTTGTTATTATTGATACGACGA
CACAATCAAACTGGTAGCTGAAATATAGATGCATGCTAGTCTGTTTGACA
GATCTCTTGACATCTCTTATTACTTAGATGTATAAACAGTTCTTCAATTT
TGTTCCCTTCAGATAGCTTTTCATCCTAAGTTTTCTTCATCTCGTGTCGA
GAAAGAGAGAAGAGCAATTCTTTCAGAGCTCCAGATGATGAACACAATCG
AGTACCGTGTTGATTGCCAGGTAAGTTTTTTTTATGGCCAGTGTTTACAG
GTTGAGGAAACTTCTGAGAAGGAATCTGGAACAATGCTGAATCATTTACT
ATAGGGCACTATCTTTCTGTACTAATTGGAGCTCCTATGGTGCAGTTGTT
GCAACATTTACACTCGGAAAACAAATTGAGCAACAGATTTCCTATTGGAC
TTGAGGAGCAAATACTTAAATGGGATCCTGACAAGATCCGCAGATTCCAT
GAGAGATGGTATTACCCTGCTAATGCCACTTTATACCTGGTAGGAGAAAT
TGATGATATTCCCAGAGCAGTAAGGGAGATAGAGGTAATCACAAATTACA
CCCTACTGCTAAGTATTATTGTAAATAGTTAAGCTGATTCCAATAGGATT
AAGTTGCAGGCTGGTTAGCTAACCTATTGCAATGCAGGCTGTGTTTGAAC
ATACACTTCCGGAAAACGGAGCAGCCCCTATGTCGACTGCAAGTCCATTT
GGTGCCATGGCAAGCCTTTTTGCGCCAAAGCTGCCAGGCGGCTTGGCTGC
AAGCCTAACTGGTGAAAGATCACCTGCCACAGATAAAATAAAACCTATAA
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CCTGACGTTCATCAGGATGCCAAGCCTCCAGTGATTTTTCAACATGAGTT
GATTCAGAGTTTCTCTATCAACATGTTCTGTAAGGTATGGTTTGCCTGCT
AGCCTTAACACTTCAGTTATGTTTTGCAGTTTGCACCTTTGTGGTTAGTT
TACCACCAAATCTTTCATTCCATTAGTAGTTCATGTTATAATACTTAGTT
CATAAATAAGCCATACCAGCATTACTGCACTGCATGCGCCACACAGGGCT
TGATAGCCCATCTCTTTTTTGGGTAAAAAGTCTCATGTTAACAATGGTGC
CCTTAATATGGTCTTCTTTAATGATATTTTAACAGAATGATTTCTGCAAC
TAGTTTACTGCTTCTCTCTGTGAAGTTCCTTAATCATGCTGCGTATGGCT
AACTATTGCTTTCCATTGCTTGACAGATACCTGTCAACCGAGTTCAGACA
TACAAAGACCTGCGCAGTGTCCTGATGAAACGGATATTTTTATCTGCTCT
GCATTTTAGAATCAATACGAGATACAAGGTATGTGGTTTTTAGAAACATT
CATGATCTGATGGCCTATGGACACTATTTTCAGATCTTATACATCTCTTT
CAGAAACTTGGTTATATCAGAACTTAACATTTTCTTTGGTTCATAACTTT
ATATCTTTGCATGTTTAGAGCGCTTCATACTTTCATATCTATGCACAATT
GCACATATTAGCACACTACACATTTGAAAATGACATTCACCGTGCACATG
TTATTTTCTCATTTTAGGAGCTTTGTGCCTAACCAGTCCACCACAGTCCA
CATAAAATGACATTCAGTACACGAAGATAATTCATATTTGGTTTGATCGT
ATTTATTAGCTACTCAGTATTCATTATATTGGTATTGAACTTAAATTTTG
AGTTGAATCGCTAGGTTTTCCAGTAAGGAATTTGCACATGTTAGCACACT
ATTCTGTATTTTACAAGGAAACATGTAGTTACATGGTTTCTCTGACTGAG
CAAAGTCTTCTTTTGTTCTTTTATACAGAGCTCAAATCCTCCCTTTACAT
CAGTTGAGCTGGATCACAGTGACTCCGGAAGGGAAGGGTGCACGGTCACT
ACTCTAACAGTAACAGCTGAACCCCAAAATTGGAGGAGTGCCATCAAAGT
TGCTGTTCATGAGGTTTGTGCCTTCACAGCTCAGTTATCCTGTATGTTTT
ACAAATTTCTTTAGCTGAATGTACTGTGTCACTTGAAATATGGACCAATT
ACCTAGATAAAATAAGCTTTGAACCAGTTCACTACCAATATCTAATTATC
TATGCAAATGTAAGTGTCGAGTTAGTATGCACATGAAGAACTATTGCCCT
TGTAGCCACAAGGAATGATTTAGGAAGAACAATAGTTGAAGATAACGGAA
GATGTTACCGCAAGATTATCCTAGCATGAGCCCTTTTCAAGTCAAGCCTA
GCCTGGTCTATGAATTGTCTAGCATAGTAGCCATAGTCTAATATGGCATG
ATCAAGCTTAATCTAGGTCTAATCCAGCCCAAATGTGAGCTGGAACTAAC
CCTAGCCAATTCAGATTTGACATTAAGCCAGGTCAAATCCAGGCCAAGCT
TGAACTCCAGCCAACTAGCTGGTTTATTGCAAGCGTTCCATTTAAAACGT
CTCCAGCTTTATTCAAAAGATGCTAACATATCTGATTGGACAGGCCCAAT
CAGGAATTCAGGGGTTAGTTCAAAAGAAGCTACATCTGAGGCTAAACATA
ATGAATGCTTGGCACGCATATGTGCTGTGCCTTATTAGCCTCTCTACGAG
CAAACACAAATTTAAATCCCTGAACATTTGAGATGATTTGTTCCATCTCT
CTAAAACACTTGGCCGCACGCCGACCTCCTTCCTTGACCTGAATGCCATT
GTTTGACTATAGTTTGACAGTCCGTCTCCAGAATCAATCTTTGGACCCCT
CTCTCGTCTGCAAGCAGTAAGCCATCTCTGCATGCAAGAACCTCTGCAGT
AGTTGGATCCTTCATTTTTTTCATACTTCTGACAGTCCGCAGCGATAAAC
TGACCATCCTCGCATCTTGCTACTGTTCGTGATCCGACAATGCAAGTGTT
CTGTTCCTGTTTACCAATTTCTCCTTATGTTGTTTTAGGTTCGGAGACTC
AAAGAGTTTGGTGTCACAATGGGAGAGATGACCCGTTATATGGACGCACT
AATAAAAGATAGTGAACAGCTTGCTATGATGATTGATAGTGTTCCCTCGG
TTGACAACTTGGACTTCATTATGGAGAGTGATGCACTTGGCCATACTGTC
ATGGATCAGCTGCAGGGACATGAAAGTTTGCTTGGGGTTGCCGAAACCGT
CACGCTTGAAGAGGTACTTACATTATCATTTTTTCTTATATAAGTCATAG
TGGAAATAAATGGCATCATTGCATTTTACTCTCTGCTAGTTTTTAATGAC
ATTGTAATTAAACGAATTTTACCATATGTAGGTTAACACCGTCGGTGCAG
AAGTACTTGAATTTATTTCAGACTTTGGAAAACCCAATGCACCACTTCCT
GCTGCTATTGTTGCCTGTGTACCAAAAAAGGTCCATATTGATGGAGTAGG
TGAAAGTGAATTTGAGATACATCCAGAAGAAATAACCGAGTCCATGAAGG
CAGGTCTTGAAGAACCCATTTACCCGGAGCCTGAGGTATATTGGTTATTT
ATGATGTCGTTTACTTATTATGCTTGAATGTATTTTTTACCACTGTGAAA
ACCATAAAGCAGCATCTTATTGATTGTTTTTGTCCTGGTTGCAGCTTGAG
GTGCCAAAGGAATTGATTACTCAATCAGAACTTGAGGACTTGAAGTTGCA
ACACCAACCATCATTTGTTCCTTTTGGTAAAGAGCAGGATGTGGTGAAAG
TATTTGACAGTGAAACTGGTATAACACAACGCCGCCTATCTAATGGAATT
TCCGTCAACTACAAGGTATTATAGTCAACTGGAAACCTCAGGCTATTTTT
CTAGGCAGAAGAATCATCTTCTTCAGTAGCCATTCTGTGTAGTTTAGCTT
TTGTTTCTTCGTACTAAAAACTTAGTGATGATTGATGACAGATTACTCAA
AATGAGGCAAGGGTTGGTGTCATGCGGCTGATAGTAGGTGGTGGGAGAGC
CACCGAAGATTCTGAATCGAAGGGAGCTGTTATTGTTGGTGTTCGTACTT
TGAGTGAAGGCGGCTGTGTTGGTAACTTCTCTAGGGAACAGGTATCTTCT
TCAAACTATTCAGTTTAATATCCATGGCAGCCAAGCTTTCCAAACTTTCA
ACTTACTACTAATGTCTGTATAAACATTTAAAGTAGTCACTAGCGGGCTA
GTCACAAGATCACCACATCTATTCTTCTAATGTGTACTTCTAGCCCCAAA
TTCCTGTTTATAAATAAAGTAGTTCTCCTTTTTAATTTTACTATATTCTA
ACATTACCGTTGTTTTTACGTAGCGATACACCGTTTTAAGTTTAATAGCC
TCAGTATTCGTATATGTAATCCACTAGTGATGTTCACAGACTATTTGTGT
TTCTATCTTACTAATGCTAACATTTTCATATGATCTGTGTATGACTTTTA
TTTCAGGTTGAACTCTTCTGTGTGAACAATCTCATAAACTGTTCACTGGA
ATCCAATGAGGAGTTTATCTTTATGGAATTTAGGTTTGCTTTAAGAGATA
ATGGCATGCGTGCAGCTTTCCAGCTCCTACATATGGTCCTTGAGGTGTGG
ATTTTCGACTTACTACATAACATACTCACCTGCCTCACTATGAGGAAAAT
TAAGTTTTCTTTGAAGCACGACCTTATTACACTTACACAATTCACTTCTT
TGTGTTACAGCATAATGTGTGGCTAGAAGATGCATTTGATAGAGCAGCTC
AGTTATATTTGTCTTACTACCGCTCAATCCCCAAAAGTTTGGAGCGTGCC
ACGGCTCACAAGCTTATGGTAGCCATGTTGAACAATGATGAAAGGTTTGT
AGAGCCATCTCCACATTCATTGCAGAAGTTGACTCTTCAATCAGTTAAGG
AAGCCGTCATGAACCAGTTTGTGGGTAGCAACATGGAGGTTTGTTGTCAT
TTCTGACTTTCCTTTCTCTTCTCCTTGTTCCAACATTTCTTCTTAACCAG
CTTTAACTTTAATGTTGAAATATTACAGGTCAGTGTAGTTGGTGATTTCA
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GCTTCAAATTCTTCTAACACAGCGGAGCATATTGAGAAGATATCATTCCT
ACCGTTTCCTTCGGATCTGCATTTCCAGCAAGTATGCGTTCATTACTATC
TTTTTAGTACTCTGATCCGATTTAATTGCCGCATTCGTGCCTTGTGCTGT
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GAAGCATTCTGGAAAAAAGGACACTTTGACATTCTGATACTTAACTGGAA
TCATGTGGTTTAAATTTGCAAGTTCAAATAGTTTTGTCGTCCGTAGTCCA
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TTTGCTACTGAAGGAAAGGACCTGTTTAATGTCATTCGGAGTTCTAGCAC
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TTTCTTTGGCATCACTTTGAGTTTGCTGGCTGAAATTATCAATTCCAGGT
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ATGCACGATACATTCTAGTATGCTGCAGAGTGCATGGTGTGTTCACTGAG
CTGTGCCACCTTTGAATGACTAGGTTATGAGTAGTTTGTTTTTTGCAAAA
ATCTTGATGATGCCCTATTTATTCATTTTACATTATTAAAGTGACATACT
TTGGTTACACATCTTATTAATGTCCTTGTGCCACTATTCTTGACTAAAAA
TCCTTGGTCACTTTGTGCTACTAAGATGGTACTGCACTTTTATCTCAGGC
TATTTACGACAGTTCGAGATTCCATGGGATTAACCTATGATGTTTCTTTC
GAATTAAATCTTTTTGACAAACTGGATCTTGGTTGGTATGTGATCGCGGT
AACTTCAACTCCGAGCAAGGTATTTAAGTTGTGATATTAAGCTTGTTGTT
CTCTGCTCTCCTGCTGTTTATACTAACATTTTGCGATCTTTGATGCCAGG
TCCATAAAGCTGTCGATGCATGCAAAGGTGTTCTCAGAGGTTTGCATAGT
AACAAAATTGTTGAAAGAGAGCTGGACCGGGTTAGTCAAATTTTCGTATT
ATTTTGCGTTCTCTGCTTTAAAATTAACATTATACCAACTAGTATGTCAG
AGTGCTACCATTCTTTCTAATCATGGATATGTTGCTTAACAGGTAGATTA
GTTCAAGAAAACTGCCCATTTTTAAGTATTGCACATCTTGTTTGATTTTC
ATGCACTTAAGGCGAATATGCATCTTGGGAATGTATATCCTTGTTGATTG
CATACAAAGCTCATACATAAACATAACTTTACTGTTCTAGTGTATACCCT
TGAGTCCTTGACTATTGAACATTATGTAGCAAGCACCATCATTTTCTACC
TGTTAATTTGATTAGCACTTTCCTTGTGTTTCAGGCAAAGAGGACACTGC
TAATGAAACATGAGGCTGAGACAAAGACAAATGCCTATTGGCTTGGTTTG
CTAGCCCATCTGCAATCTTCGTCCGTGCCTAGAAAGGTATATTCTACATG
ACGGTTATTAGTGCGAATTCTTTAGAAAAATGGAAAAAGAAATAGACTAA
CTCTCCATTCTAGCCCCCCTGGTTGCAAGGTCACTTCGGTTGCCTTGTTC
TTGTCCTACTTTATTGGGAAATGCTATTTGTCCTACTTTATTGGGAAATG
CTATTCGTCCTACTTTATTGGGAAATGCTATTCCAGTCTGCTCCCTGCCT
GTTGCCTACATCTGGACCGTTCATTGTTTGGAGATTCCAACTCTCCACTT
GCGTGTGGGTCCCATGATTAGGGAGAGATAGAATCCTAAGTTACAGAGCA
AGTTTTGAATACAGCTCCGTTTCCAGCCTTTTAGGGTCTCTTTGATTCAC
AAAACACGAGATATAGGAAAAACACAGGATTGGATTGTCATGTCATCTCC
TTTATGAATGGAAAACTACTGGATTGCATCAAAATGTGTTTGACACCACA
GGAAAAACGAATGAATTAATAAGAGGTTCGGGTGGATGGAAATTTTCCTC
CAAAATACAGTACAAAGGAATTTTAGGAAAAAATCCCGATGATTTGAATG
TGTATTATATGTATACTTCACCTGACTGCAATTATAATTATATGATTTGG
TTGACACTTGACATTTGGTACCCAGGTACCGTCGGTACTTGGTACCATCT
GTCAGCTTCCCATGCTGTACATGCAGTTCGCTGATCAAGCAATTTAACTG
AATTAAGTACAACCAAACCTTGTACTTCCACCCACACTTCTGGATGACTT
TAAATGAATGGAAACTATAAATACATATATGAAAAAGTATGAAGATGGCT
AAGACTCTGTCTATTTCGGGTTCTAGTGCTTTTCTTGACCATACTGTATA
CAGAAAAATTGAGAAGTAGTCAGGGTATTGTGTATCTGCTAATGTATGGT
CAACATGTTTAAGGATGGCAGTGGGTACCCATTAGGGTACCCCTTTACCC
TACTTAGTACAAAAAAAATGAACTAAGTTTTGGCAAAACACCACTTTTTG
AGAAAACTAGTTCATTTGTTTGAACTAGGCTAAACTAGAGGGTACCCTAA
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TTTTCTTTTATACTCCGTATTATTATTACCACTTATCCTTCATTATTTTT
ATACTATTATTTTGGGTACTTGTTTTATTTTATTTTCTGGTGTTGTCACT
TAATGTATTTCATTTGTTCCAATAAATGCAGGATATATCCTGTATTAAGG
AACTGACGACACTGTATGAAAGTGCCACAATTGAGGACTTGTATCTTGCG
TATGAGCACTTGAAAGTTGACGATTCATCTTTATTTTCCTGCATCGGTAT
TGCTGGTGCCGAGTCTGGTGAAGACATGAATGGTATGTAACAAGACCATT
AAGTGCCCCCGATGATATGGATTCCCAGTTATCTGAAATATTTTTCATTT
ATGAGCAAAATTATTGCATAAGTATGCCAGTATATGTTAATTTGGAAGTA
AACATGTGTGCTGATCGGCACTCATCAATATGGTCTAGATGTATTTCTTA
AATCAAATTTCATAATTTTATCGATTTTTTTTATTGTTATGTTAGCAGAT
GATGAGCCTGATATGGGGCTTCCTGGTATGGTTCCCATGGGAGGCCGGGG
TCTATCAACTATGACCAGACCGACCACATGAGCTGTACACTTTTCACGAC
CCAGCTTTCTAGGTGTGTTGCAATTTTTGAAGAAAAGTGTGGTGTATTCA
GTGCTCTACATTACAATACCTTTGCCAATTGTGCTGACTTGTGTTCTAAT
TTCAGTTGGCCCACAGGTATGTGACCCTGTGTAGACTACATATCAACCTA
GCTCCTGAAGAGTGGATCCCTATGTGACCCTGTGGAGACTACATATGATG
ACTGTATACTAGCAAGTACTCTAGACCCCATTGATGCGTTCCTTGGGCAT
TGCAACAGCTTGGTATAACATTTTCCCAGAGAATAGAGTTGATTGTTGCC
AAAGTCTTGAAAGCCTTCCAAGGAAGGCCTTGTTCAGAATGTATAGTAAA
GATCGATTCGATTCTTTCACATTCCTGAGTTGTTGTAACTAGTATTCTGC
AGAGTCATCGCAGAAGATAGAATGACAATAGGATCGATGATAAGTTACTG
AGCAATGGCAAAGTAGCATAGGGCATCTGTAACACAATAGTAATAAACAA
TTGTACTCTTGTAACCTTCAGTTATTTTTGTCTTGGTGTAAACTTGAGTT
ATTTATAATGAAAAGGTTCACAATTTTGATGAGAACATTGGATTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.