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GrainGenes Sequence Report: AE048717

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Sequence
AE048717
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE048717
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
TCATCAAAACACCTGCATACCCGTGGAGTCCGATCTATCTTACGCGTTTT
GGTTGGTTTTGGTGGCGACTCGAGACGACGGCGGCGGCGGCGGCGACGCC
GTGCAGCAACTGACGCCGCGCACACCCCGACGCTTGCAGGAGCTTCTTCA
ACGCCGACGCTCTCCTCAGCCTCTCCGTTCTCGTCGCGAGTCCCACCGCA
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ATATGTTGAATAATTGTTGATGTTATTATCAATTCTATGAATTTACGATG
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AAGTTGTGAAAAAGAATGCATCAAAAGTCAACTACTCTACTTTGTTTGAC
TCTGTCTGGCAAGTTTGATTAAACTAGACTATCATAGTACATCACATGGC
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TTACTGATTCTATTTTAGCTAACTACTTATAATGATGGTTAAAACATGTT
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CTGGACCGTATGTTTCGTGAAGCTTGGGGGAAGGAAGCTCCTCAAATGCA
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TGTCTCGGGATCTTTTGGCAGTTGATACATTGAGTACTTATAAACATATA
GTGATGATGCCGAACCTTGACCTAAGGAGAATATTATTTTCCATTTTATA
TTTCACTGCTTCTATTTTATTCCGTATAGTTCTTAATTTGGCGGAGCCTC
GAACTAAGTAGCTTAAGATCTCATACGAGTAATTAATGTACCAGAATATT
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TCTTGGTATCATGGCCACCTTAATCCCCGTGCTTAACCAAGATGCGTTTT
GGAAAATGAAAAGGTGGGAGTATTAGGTAACAAACACATTAGGAATCACC
ATTGTAGCTGTGCTGTTTAATCTTCCTTTGATACATAGTTTATTGGAATT
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TCATGCGCATTTCTGCTTCTCAGCAGTTTTCTTAAGATTCCTGATTTTGC
CCATGTTATATGCTTCCAGGAAAACCGGATAAACGTTTCAATGGAACTTG
TGACGGTTGAATTAGGAGACCATGGGCAAAGGCCAAATGACGATTATGGT
ACTCTCCCTCCCCCTCCCCTGATTCATGTAAAATATGCTCTCCATATACT
TTATTCATTGTTATACTGGAGTAGTGTTTTCTAGTTATAACTTCAAATGT
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GAAAAATCTGTTGAGAGGCGCCGCACTGTGCACTCTCCCGTGCAGCGCGC
AGCGATTCGAAAAACCGTATCGTGATGCGTCTTGTTCCCTAACAACTACT
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CGCGGAGCACGCAGCGGCAGGGTAGGTGCCGCACGAGCATGCAACCGTGT
GAGAGAGGTGCTGCCGTCTGACCACACATCAACCGGGGAAGGCCGCCACT
GCGGAGCATGAAACAGGGAGGCGCGCAGATGATCACATCAAGCCATGTCC
GCGAGGAGTATTGGACCAAAAGCTTCACCTAGGAGAAAATCCTTGGAGCT
TGCAGTGGTTTAGGCGGGGCGACGGACTCGGCGGTGGGGAGTTCGGCGGA
ACGATGACTGCGCATAGATTGGTGTTGATGGGTTTGGCAAGAAGCTCCAC
GGCGGCTCGCCCGAAGCTTGAGACTGTACCACGACGGTGGTGGTTGGGGA
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TAATTTAAACATGGCAATTAGGTTTATTTAATCCGGCAGTTAGGCTTACT
TAATCTGGCAATTTCTAATTAAGGTGACAATTAGTCACGGTTAAATCTGG
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AACCCGACGAACAAGGCCTAATTATTCTCTCAATAAATAACCTAGCAACT
ATGGCTAATTAATCTCGCAATTAGTAACGATTTAATCTGGCAGCTGGACC
TGGAGTATGTAATTAATCGGGTAATTAGCAACTGCATGGTGCGAGCTGGG
GTATGAGCTGTCACAGATTGGATCTTAGCCTTTCGGACTTTTTTCTTCCG
GAATGAATGTCGTGGGCCTGCCCCCAATAATGTTTTGCATTAATCGCGCG
CGGGTCAGGAGAGCACGAGAAATATGCGGCGCCGCTCTTTAGCACAGTCT
TTCATTGTTTGCATTCACTTAGTAGCATGGTTCTATTTGGGGTGTTATAA
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CTTCATCATTATCCTTGTGTTTTTCTAGCTTCTATCTTGGAGCAGTTGGT
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TTGGCAGTCCTTTTTTAAGAATATTTCTTTTGAATGCATATTTATATCAG
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TCATGGTAAACCAAAGTTCTATTCTACTCCAGACGTGATTGCCTTTTGTC
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TGCCTTGCTTGATATAAGTTTCCAATCTGAAGCTGTTTGATATGAGATGC
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AGTTATATTTCTTGTGTATGAGCATTTCACGGAACACCTTCTGATGATTC
AAATGCTAATTTTGACTTCTCTTCTCATGTTTTGCAATCTTTCGGTGGTT
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TTACAATGGATTGTTGTTTCGAGAGGAATCATACGCTCATCTGTGCCAAT
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ACTCTTTACATTGTATGCATCTCTTTGGGGTATAGACTATTGTAGCTGTG
AAGTTATTTTACACTGTACATACTGATAGACATTGTTCAACTGCTATATT
TTTAGTGTCTATGCAATCATGTCATTCATCTGTTGGAGCCATTGTTGTGG
TGCCCTCAAAAAGTGCGCATGTGTACACCGTTGGTTCTTCTCTTAATATT
CTTCTTCTTTCTGTTTACATCTTTGCAAGGGAATCTGCCACTTCCTTTTT
CGGTGCCTATGATGCATTGTGTGAAGTGGGGACTGCCACACAAGTTTGCG
AAGCCCTTGACAGAATAGCTGATATATCTGTACCAGGTAAGTGTCTTGAA
TAATAATTGTTATCGTATACTCTCACTGCTGTTCTAATATGTTTTCATGT
CTCTCTTTGTTTGTAGGGTCCAAGGATCATTTAAAGGTACAGGGTGAGAT
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TGAAAGAAGTCTTGAGAAGCCTCCCCCAGGCTCCATTACATGGAGGTAAG
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TCTTCCTCCCGTGACTCCATTCTCCGTCTAGCAGCTCTGTCCCGGCAGCT
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CGCCTCAGCAGCTCTCCCCGTGCAGTAGGCTGCTGCTCCTCCACTGAATA
CAGCAGCCGTTGCTGCTCCCCTCCGCTTGGTCGGCTGCCGCTGCCACTCC
TCCCCGGAGCTCCTCTGCTCGGCCAGCCGCCGCTGCCGGTGCTCCTCCAC
GGAGGTCCTCTGCTCGTTGGCCGCCTCAGCTGCTGAGCCGTGCTCCTCCA
CCCCAGCAGCTCCTCTGCCCTGCCACCGCCTGCGCTGCACCGCCGACGCC
GCGGACACCTTTGTAAATGCAAGATGATGAGAAGTGCAAGCTGACAAAAT
TGTGTCTTAAATGTATAGTGAATTATGCTCTGTCAAGTACTAACCATGCA
AAATTACAGAGGATATGCTAATGGATCTGTACCTCAAGTTTATCAACATT
TTGACTAGGTGACCAACAGTACCCAAAATAAATACTCCCTCCATTCTGGT
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GCGCACAGGGTTTATAGCTAACGGTCCATCTAAGTTTATTTTATTACGAT
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TCCTAATAAGCGGTGACGAGAAGAAATAGAAGAAACCAATCAAGCAAGCA
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TTAAAATGCAACATAAAATATTTCACCTCGAGCAGCATCAATTGTTTTTT
ATGAATACAGAGACAAACTTGGAGTGACATCAAAACTGGAAAATAATTGG
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CTACTATTATTGTGATGTTTAATTGGCATGTCAATGGTGAGTTGCTGTTT
GTAATAATAATGATTAAGACGGAACAATAATTGCTACAGACATATAAATA
ATAATATCATCTCATGTAGCAATTTTCGAGTGCACCTTTGGTGCCGTATG
GCTGGACTGCAACGGTCTGTTCAACTGCATTAGGGATGAAGCAGGAGCTT
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CTATGGTGTTGTAACTTCTTATTACTTTTACATGAACAGAAAATTAAAGC
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TTGGAAACAGTAGTCTTGATGCTCAGTCTCGAAACAGTGATAAATCGCTT
GTCACTTACTTTTTGGAATCACATCCTACAGACTATGCAACTAAGAAATT
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ATTGCTGTAGATAACAGGCATACTTACATGGTAGATGTTTTATAACTGCA
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TTATCCATGTGCGCAGGGATTCTATTTTTAGACGTTATCAGCATGAGATG
AGGTACGATTGCAAAGTCAATCTCGCATACCTTTAATTCATTGCAGTACC
TTTTTTGTTTGCCTTTTCTTATTTATTATTTGTTATTACATTTAATCGGT
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AGATGGACGATGTGACTCAAAATTCTTCTCAATAAAATAAGTCAGCGTGG
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TGTTCAAGGCGAACAATAAGAAGGGTGCTGAACTTTCCAAAGACAGTAAC
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GGATGGTCTGGCTGGTGAGGATTCAAGTTTGATGGTCAAACTAAAATTCC
TGAATTATAAGGTACTTCATTGTCATTGTTTGCAGCTTCTTTTAGAGCGT
AGGTGCTTGTTGGTTACTTGTTGATGTATGAGTACAATTCTGTTTACTCT
GGATTGCTTGCTTTCATTTTAACATTCGATGCACATCTAACATAAGTATT
ACACTGTCAGTAAATGCTTATATGCTTGGCATATCTGTGTGGACTTCTTT
TCTTTAGAGGCTTTTTTATTCTTGAACGCTGGAGAGGACTGCAATCACAA
AAGTTTGAAACGATGGATATGTATCTGTATCTTCTAACAATTCTCTTACA
TGGCTACCTGACAGATCAGGACCTTTTTAATTCGGGATGGCCTCTCCATC
CTTTTTGAAGACGGCCCATCTAATTATCAAGCTTATTACCTGAGGTATGT
CATGCATTCAAATCTCAAATTTTCGTTCTTCACCTTTCCACAGTTCCTTC
TGCAGTTGGCTGAAACAGATGAGCATTGCAGTTACTAGTCTTCATTTAGT
TCCATTCTGCCCATACTTTTTGTAACGCCAGAAACATAGCTAATGCATCC
TCGAGACATCTACTTAGCTGATATGCATATAAGTAGGAAATGTTAATACC
TGTAAAGCGAGGCCGCTAACATGTTGGGGACCCCTTCTATGCTATTCAAG
AATTTTCTTCATCATATGATGATTTGATGCTTGAAGGCTTCAGCCATGTG
AAATTTTTGAGCTGGGTTGTCGATTTTGACTACATTAAATTTTCGTTGGT
GCTGTTGTATTGAGTGCAAACAGTGTTACCTCTGATATCAATGGTCCTGA
ATGTGTTAGTAGGCAAATGAAGAACTGGGGAACATCAGCAAGTAAACAGA
AAGAGCTTTGCAAACTGTTGGATCAATGGTATATTACTAACTTCTTTCTC
TTCATAGGAGGAATTGTTTTAAGTGTTGTGTTACCAAACTACAGATGTTA
ACTTTATTTTTTATTTGGTTTGCTAAAACAGGGCTATCCACATTACAGGG
AAGTGTGGCAATAAGCCACTCTCGGCCTCAGCGTATCTTGATGAGGCAGA
GCCTTTCCTTGAACAATATGCTAACCAGGCTTTGGTAGGGGCTGCTGGTG
TCTTGGTTCAAGCAGAAAATTTGAGAGATGGAGGTGATGATCTTCAGCCA
GAACGTGGGGCAGCACCTTCTAGTCCTACAATGTCCCTCGATGTTGTTCC
CAAAACTGAAGGCCTTATTGTCTTCTTTCCTGGTAAATTCAATTTTCTTT
TAACAGATTCTAAGGTTTATGTTTCATAAGCACTCTTAATCTTGAGTTGT
TTCAAATCATTAGAATAACTGGTTTTTAATATTGTCAAGATTATAAAAAC
TTGATAATCATTCGTACCGCCCTTGCCCGGCAATGTCTAAACTATCGACC
TAACTGATATGCTGTATTTTTTCTGTTTTTGTGTGAGGTCGGGGGAAGAG
TATACTGCTTTAGATGATAGACCATTTGATTCATTTGGATTTTCCCAATA
GTTATAGATCATTGTACGCATGGAATGTTGAACATGAGCTCAGAACTTGC
AAGTAGGGCCTAGGTGGCCATTGTTTAATGCACCTATTTGAAGCCTAACA
GCCCTGCTCTCGCGGGAAAAAACCCCTGAAAGTAAAAGAAGATAACTTGT
CTAACACTTCCTTGGGGGGCGTCGAACCTGACGTTCAGCCAGAAACTGAG
GTGCCACACCAGCTGGAGTGGCTATATTTTTCCCTTGGAAAACGCGAAGA
TTGCTTCTTGATGGGTTGAATAGATAGAAGAAATATTTCGAAGCCTAAAA
GGGCTGGTTACAACGCAACTCCAAGATAGCGGACAACCCAAGTGCAGGGG
AGACACTCTATAATTCCTGCGCAAGCCCAGGCAATAGCTTCATCCTTATT
TGCTCAAGTAGGCGGTTGAGGCTTGGCTGCTCACAGTTAAAGGCGCAGCC
GCTCCTGTGATTCCACATCATCAAGGGGTGAGGAGCACAATGGATGCCAG
GCCCTTCCTTAGAGGCTTAGAAGTAGCGGTGCGGGCATAAAGCCACCAAT
GATATGGTAGAGTAAGCGAAGAAGTCTTCACCCGGGCGTCGCACCCTGGA
TAGTACCTCAAACCAGGTCCGCTGCACCTTGGGACAATCAACTAGTAGGT
GGGGCGTAGTTTCCAAGCAGAGGAAGCAAACAGGTGCGTGTTGCAACTTT
CGATTCTGTCCACGCTGGTCAGTCCAGCATCCGTCAAGACTGGCAAGCCA
TATGGAGAACTTGACCTACTTTGGCGCGCCAAGTCTTGCAGATGAGTTTC
TAAAGCGGAACTGGGCAATAGTCCAGCAGTAGGCACATCCCTGCTGGACC
AGGGTTCGAATCATATTGGGAGAGAATTTTTGGTATCTCACCCGGGTGGG
CTCTCCCTTTAACAAAAATATCCTGGGTGCTCGTGCCCAACTGCCCATGG
ATCTCATTTTTACCAACATAGGTCTAGAGACCATTGTTTTCAGGTTTTTA
GGCTTAATTAATTATATTTCCTAAATTTGTTGGTTCTGGATTTTTCTTAC
CCTGTGTGAGCATTCATAATATTTGTGAACCTATTTGGTGTAGTTTGGCC
TGCTCTCAATTCTCAAACATTAGCTTATCAAGCTTACAGCTTATAAACCT
GATAAACTAGATAATTAAGTCATGCAAGCAGCTTTTCAACGGATGATTGC
TTAAGTAATATTAACTGTAAGCCTCGGACCAACTGGCTCCTTGGGTTGCT
TGACTTGAACCTGTAAACCCCGTGAGCCTAAGCTTATACCAGACCGATCA
GGTTCTAAGATCATTGTCGATATACCACAATTGTCTAGCTAGTAAATATC
TTGTCAGTTTTATGATTTTCTGATTGCCATTATGTTCTCTTGGTCCTTGT
TATATTGTTTTGTTCTCCGTCAATGTTTATTCTTCTTTCAGGTATACCTG
GTTGTGCAAAGTCCGCTCTATGTAAGGAAATATTGGAAATGCCTGGTGGC
CTTGGTGATAATCGCCCTCTTCATAGTTTGACAGGAGATCTTATTGGAGG
TACGGAACATTTGGCGGTATTCTTTGGTTGCTATGTTCATAGGACCAAAA
CATGGGTTCGGTGGCGGAGGTCCACTTGTTCTTAAATTTTCTCATTCAAT
TAGAATACAATTTTGCATGTGCTTATGAGAACAAATACAAATTGATTATT
CTGGCTGCATGTAGCAATTCTTCCCAACTTTGAATGATTGATATATTCTT
TGTTCAACAATAAGAACTGGTAAAATTTGTTTTTCCTGAGATAGCTTATT
TTTGAGAATTATAATATTCCATTGCGCTAGTGACAAGACTTTCTTTCGCT
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AAGTCATCATTTTGAGTGGCAACAGAACACACTTTTTTTAACTACGGGGA
CAAACGAGCTTTCACTCACTCACTCACATGTTAGAGACACTGGAGTGTAA
CAGGTGAGGTAGGGGTTTCTTTCTGCTAAAAATGGATCCGAAGTTTGCAG
GGCCAGAATAGGACCATATTTCTACTCAATAGGAGGCTGCTGTACTGAAA
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GAATATGATTTTATATTACTTTTAGCAGTATATATTTATAGCATCAGTTG
TTCTATTGGTAGAGTACTGCATAAATATATACCTGTATACATGTTATTCA
ATTTTCTTGCCACTTTAGCTGCTATATTCCATCCAAACTGATTAATTTTC
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TGGCGGCAGGCAAGATTACTTTCAAGTTAGATAGAGTATACCTATCAATG
TTATTTCTTTCACATGCTACAGTTTAGAAAGAACTGAATTGATGGTCTAT
TTATTCTAGATTGAGGATATATGCAGGACCACAAAAGCAGCTGCTGTTCC
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TTCTAGAATGTTATTCCCATCTTCACTGTCTATCTCTATTTATGAAATGC
TTATATTCTTGGATAGGATCACTCAGTTGCTTTGTAATTTTTCTTCATTT
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TGTCTAACATGTTATGACTACCTACTTATAAAGGGACATCTGGACGGGGC
ATTATGGAATGCTGGTTATGTATTGCTAAAGTTCTACAACCTGTATGAGG
GCAAGGTATGTCCTTTCCTGATTAACTGTTTCTGATCTTGCTGGAATGTA
CCATATTATCAATGTTACATTCAAGAAAAATGCACTTCCAGAGTCGAAGT
GAATTCGAAAGCGAACTGTATGAGCGTTTTGGCTTATTGGTTAAGATGCC
TCTCCTGAAGGCAGATAGGTAAGAGATTTTCACATATTCTTGTACTGCTT
CTACCATTGTTTTTTTAATAAAATGTCCTGTTTCTTATGCTCTTATACTT
TTCCTCTTTTATTTTTTTGAGAAAACATAAAGAGGTGTTTGCGTTTCATT
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CTCGTTTGTTTGAGCCAGCCCCCTGTACTGTTTTTAGCAGTTTTCTTGTT
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GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.