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GrainGenes Sequence Report: AE046973

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Sequence
AE046973
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE046973
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
GAAATTAACAACGATATGTACGAGCACGACTCAGGATATCCAGGATTGGT
GGCTCGAAGGTTTCAATTCGACTTTCTTAAAAAGATTACAAACAATTTCT
CTACAAAGAAAATACTTGGAAAAGGAGGGTGCTCGACTGTTTACAAGGTA
CACTTGCATGTCACTAGGATTTCTTAGTTATCTAATATTAATCACAATTG
ACTCTAGGGCATTAACAGAAATCTGAGAACCATGACAATAGGGAGAAGTC
GAAGGTGGGAGAATTCTTGCTGTCAAGGCATTTTCTATTGAGGGAATAGC
TAATTTAATACAGTTTAAGAATGAGGCTCAACATCTTTCAACTCTTACGC
ACCCAAACATAGTAACTCTTGAAGGTTACTGTTATCATGAAGAAATGAGT
GTATTTCAGGAGGACGGGCGTGCTACTACGGCAGCTAAGATATACATGTT
TCTATGCATCGAGTACATGCCCAATGGAAGCCTTGACAATTATCTATCAA
GTATGGTTGTGATATCTAACACAGATGCTATCTTTGGATCTTGTAATATA
GCTTGGTATCTTTGGATCTTATCTATCTGCAGATATAGCACCTTAGTAAC
TTTTGAGACAATTTCTTGATAAACTTACATCATCTGAACGATGTTTATAC
AATAATAATTATAGGAAATTGTACAAATAAAGTGCCTCCTTACAAAAAAA
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GACTAGGGGGGTCTATTACTTTGTCAAGGGTAAGACATAAGACCGTCTTT
CTCAGGGAAAATTGATGTTTTTGCAAAAAATACCTGCTATCAATTGGAAA
AAGCATAATGGTAAGAAATTGTGTAGAGCAGGAAGTAAGAAAAGTTGAGT
TAGTAATACGCATTGGTACAGATCATGTTAGGGAATGTTTAAACTGTTGA
ATGTGTTCTTGAACTTTTTATCAAAGTTTAATACACATCTCTCGAACTTT
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TCAGTAACCAAAGGTCTTGTTTGTAGCGTGAATCCAACATTTTTTTCTGA
GATATAATTTTTGACCTTATCATTATCTCTAGATATGAATTTTGGGGTTC
TCACTAGCATGTAATCAAGAAATACCAGAATCATTTCCATAAGTTTATAG
CGTTTATTTGAAGAAAATTATTTTCTTTACTTTATTTATGTTTTTATGTT
TACCAAGTAGCCATGTTACTTGATTCAATCATATATATATGATACATTTT
TGCAAGGCAACATGTGGAAGGGTTGAAACATTTCCGTATGAGCGTACAGA
AGGATGGGTGGGCTAGACTGAAACTTTCCTACTTTTGGTGATCACAATTA
GTGGGTCAATTTTGCTTCGGTGTCCTCCTCTTCTTCAAACTTTGAAAAAC
AAAAACTTGATACCGATTCATTTCGAAGACCGTACGAACCCACCTGAAGC
CCGTATGATCCTCTTAGATGTATTCTCACTGTACACGTATACTCACGTGT
CTGTGGGAGGCAGAAATCGGGAGGTGGGATCAGGCGGTGGGAACGTGGAT
TATATCCAGCTCGACCGAGTACACCTATTGGAGGTATACATGTCCTGGAT
ATGGGTTTCGACGGGGTCAAAATAAAGCTGCCACATGTAAACTTAAGTTT
GAGGGGGGGGGGGGGGCACCGAATCAAACCTCTTAGTGGGTGGGTAGTTT
ACTTAACAAGCTTTCTAGTGCTAACATTGACTAATTGTTATCTCAAATTT
AACCTTTTTCTTACCTCTAGAGAGGTTTGTTTGAGCGTCTTCAAACTACC
CCGATAAAGACAAGCGTTATTAATGAATGCAGATGAAACTGTTGGACATA
ATTGGTCACAACGTTACTCAATTATCGAGGGGATTTGCCATGGTTTGCAT
TACCTTCACGAGGGAAATAAAGGTTCTCCTCTTATCCATAGGGATCTCAA
ACCTAGCAACATACTATTGGATGATAACATGATACCAAAGATCGCGGACT
TCGATATTTCCGGACTCATTGGTGAAAACAAAACCAGTACAAGCACATAT
ATCATCAGGGGTACATGGTAAGCTATAGGAGATGAGAACTCCACTGTGTT
TCTGATGGGTTCGTAGCATGGAAAACAAAAAATTTCTACCGCAAGAACGA
ACAAAACCTAGATCTAATCCAGATAAAAGCCAAGATCTAATCTATTAGAC
ATGAGCAACGAGATAGATAGGAACTAACCCTCGTAGATCCGAAAGCGTTA
ACGAGATTAGATCTCGTGGTTGATGTAGTCGATCACTTGCCGATCTCAAG
ATCGTGTGGACGATCCTTCCGGCGTCGCGTTCTAGCAGCGCTTCCGCCGT
CGGTCAAGTAGACGATCCTTCCGGCGCCGCGTTTCGGCAGCGCTTCCGTA
GTCGGTCACACGTGCGGAGTCGAAGTAGACCTTCCTCTCCCCGTTCCAGC
GAGCAGCGGAGGTAGTAGATCTTCTCCACGTAATCCCAGCAGCACGACGG
CGTGGTGGTGGTGGTGGAGTAGAAAATTCTGCAGGGCTTCGCCTATGCCT
ATGCAGAATATGGTGGAGGAGAGAGGCGGCAGAGATTGGGTGTTATGAGA
GCTCAGGAGGAGGGAGTGCCCCTGCCCCTCTATTTAAAGAAGGGAGGCGC
CTAGGGAGGGGAAGTCCTTGTAGGACTCCCCTCCCTTGTAGGCCGGCGGA
TTGGAGGTGGGGGGAGGAGTCCTCCTCCCCCACGACTCCGTATCTTGACC
CACCAGGACTCCTTGATCCCTATCTTGATTTTCAAGCAAACTCCAAGATA
TCTTCTAGAACCTTCCGGAACATTCCGAAACCTTCTAGAATCCTCATACA
AACACTCCGGAACATTTCCTAACTTAGAAAATGATCCCCTATATATGAAT
CTTATTCTCCGGACCATTCCGGATCTCCTCGTGATGTCCCGAATCCAATC
TGAGACTCCGAACAACATTCGGTCTCCAACGCACATTCCATATCTACTTA
AAACAACTTCGAACCTTAAGTGTGTCACCCTACGGTTCGTGAATATGTAG
ACATGATAGAGACACATCTCCTATCAATAACCATCAGCGGGACCTGGAGA
TCCATAATGGCTCCCACATACTCAACGATGACTTCACGATCGATTAAACC
ACTTACATATGAAACTAATTCCCTTTGTCTCGCGATACTATACTTATCCG
AGGTTTGATCGTCGGTATCTCCATACCTAGTTCTACCTCGTTACTGATAA
GTACTCTTTACTCGTTCCGTGATATGTCATCCCTTGTGACCCAGTCACAT
GCTTGCAAGCTAACTAGATGACATTCCACCGAGAGGGCCCAGAGCATATC
TATCCGTCATATGGATGGACAAATCCCAATCTTAGTTCATGCGCTTCAAC
ACATACTTTCAGAATACCCAATGACACTTTTATAACCACCCAGTTACGAA
GCGGCGTTTGATGTCATCAAAGTATCCATCCGGTGATGGTGATTAACATA
ACCTCATGGTCGAAGGAATAGGTTACTATGTATTTGAAAGCTTACAGCAA
TATGAACTTAATGACTTGATCTTATGCTACGCTTACTATGGGTGTGTGTC
CATCACATCATTCTCCTAATGATATAATCTTGTTATTAATCACATCCTAA
TGTCCATGATCAGGAAACCATGATCATCAATTAATCAACAAGCTAGTTTA
ACAAGAGGCTTACTAGGGACTCTCTTATGTTTACAAAATACACAAGTATT
AGTGTTTCCTAATAATACAATTATAGCGTGTGATGTAAACATTCATCATA
AACACAAAGATATAATAATAATCACTTTTATTATTGCCTCTTGGGCATAT
CTCCAACAGTCTCCCACTTGCACTAGAGTCAATAATCTAGATTACATGGT
AATATACCGAACACCCATCGCGTTTTGGTGTTGGTCATGCTTTGCCCTAG
GGAGAGGTTTAGTCAACGGATCTGCCACATTCAGATCAGTGTGTACTTTG
CAAATCTTTATGTCACCATCTCGGACATACTCGCGAATAGCGTGGAAACG
TAGCTTGATGTGCTTCAGCTTGCTATGTGACCTTGGCTCCTGCGCATTAG
CTATGGCACCTGTGTTGTCAAAGTAGATGGCCATCGGGTCCAACGCACTG
GGAACCACGCCGAGTTCAGTAATGAATTCCTTCATCCAAACGGCTTCTTG
TGCAGCCTCCGAAGCAGCTATGTATTCCGATTCAGATGAAGATTTCGCCA
CAACGCTTTGCTTCGCACTCCTCCAGCTCACTGCAGCACCATTCAAAATA
AATACGTATCCCGATTATGACTTCGAGTCATCCGGATCGGTGTTCCAACT
AGCATCGGTGTAACCGTTTACAACAAGCTGTTCATCACCTCCATAAGAAA
GAACCATATCCTTAGTCCTATTTAGGTACTTTAGGATATTCTTGACCGCT
GTCCAGTGTTCCACTCCAGGGTCACTTTGATATCTGCTAGTCAAACTAAC
AGCATGTGCTATATCCGGTCTTGTACACAGCATGGCATACATGATAGAAC
CTATGGCCGAGGCATAGGGAATTTTATTCATTTTCTCTCTATCTTCTTCC
GTAGCTAGACTTTGAGTTTTACTCAAGGTCTTACCTGACAACATGGGCAC
GAACCCTTTCTTGCTATCTTCCATTCTAAACTTCTTTAGAACTTTGTCCA
AGTATGTACTTTGTGAAAGCCCTATTAGGCGTCTTGATCTATCTCTATAA
ATCTTGATGCCTAGAATATATGCCGCTTCGCCAAGATCCTTCATTGAAAA
ACTAATATTCAAATAGGTTTTGACGCTATTAAGAAGTTCTATATCATTCC
CAATCAACAATATGTCATCTACATACAGTATTAGGAATGCTACAGAGCTC
CCACTCACTTTCTTGTAAATACAAGCTTCTCCATAAGTTTGAATAAATCC
AAAGTTTTTGATTACTTTATCAAAACGTTGATTCCAACTACGGGATGCTT
GCTTCAGTCCATAAATGGAGCGCTGAAGTTTGCATACCTTGTCAGCATCT
TTAGGATTGACAAAACCCTTGGGTTGTACCATATACAACTCTTCCTCAAT
GTCACCATTAAGGAACGCCGTTTTGACATCCATCTGCCAAATCTCATAAT
CACAATGTGCGGCAATTGCTAACAAAATCCTCATAGACTTTAGCTTCGCT
ACTGGTGAGAAAGTCTCATCATAGTCAACTCCTTGAATTTTTCGGAACCC
TTTCGCGACAAGTCGAGCTTTATAGACGGTAACATTACCATCAACATCTG
TTTTTCTCTTGAAAATACATTTGTTCTCGACAGCCTTACGGCCATCCGGT
AAGTCCACCAAAGTCCACACTTGGTTTTCGTACATGGATCCCATTTCGGA
TTTCATGGCTTCTAGCCATTTGTCGGAATCTGGGCTCACCATAGCTTCTT
CATACGTCGCAAGGTCATCAGCGTTGTCCACCAACATGACGTTCAAGGCA
GAGTCATACCAATCAGGAGTGGTACGAACCTTCATTGACCTGCGAGGTTC
AGTAGAAACTTTGTTTGAAGTTTCATGATCATTATCATTAGCTTCCTCTC
CAATTGGTGCAGGCGGCACAAAAACATCTTCCGGTGCTGCGCTACTCTCA
AATCCGAGAGAAGGTTCAATAACCTCATCGAGTTCTACTTTCCTTCCAGT
CACCTCTTTCGAGAGAAACTCCTTCTCAAGAAAGGATCCATTCTTTGCAA
TGAAAACTTTGCCTTCGGATCTATGATAGAAGGTATACCCAATTGTTTCT
TTAGGGTATCCTATGAAGACGCATTTCTCCGCTTTGGGTTCTAGGTTATC
AGGTTGTAACTTCTTTACATATGCTTCGCAACCCCAAACTTTAAGGAACG
ACAACTTAGGTTTCTTACCGAACCACAATTCGTACGGTGTCGTTTCGACG
GATTTAGATGGTGCCCTATTTAAAGTGAATGCGGCCGTCTCTAATGCATA
GCCCCAAAATGATAACGGTAAATCTGTAAGGACATCATAGACCGAACCAT
ATCTAAGAGAGTTCGATTAGGACGTTCGGACACACCATTACGCTGTGGTG
TTCCCGGCGGTGTCAACTGTGAAAGTATTCCACATTTCTTTAAATGCATG
CCAAACTCGTAACTCAGATATTCACCCCCGTGATCAGAACGCAGAAACTT
AATCTTCTTGTTACGATGATTTTCCACTTCACTTTGAAATTCCTTAAACT
TCTCGAAAGTTTCGGACTTATGTTTCATAAAGTAGACATACCCATATCAA
CTCAAGTCATCCGTGAAAGTGAGAACATAACGATATCCACCACACGATGC
TACACTCATTGGACCGCACACATCGGTATGTATTATTTCCAATAAGTCTG
TAGCTCGCTCCATTGTACTAGAGAATGGAGTCTTAGTCATTTTTCCCATT
AGACATGCTTCGCATCTTTCAAGTGATTCAAAATCAAGTGATTCAAGAAG
TCCATCTGAATGGAGTTTCTTCATACGCTTCACTCCAATGTGACCAAGAC
GACAGTGCCACATGTATGTAGAATTATCATTCAATTTAATTCGTTTAGCA
TCTATGTTGTGAACATTTGTATCAATACTATCGAGATTCAGTAAGAATAA
ACCATTCATCTCAGGTGCATTACCATAAAATATATTACTCATATAAATCG
AATAACCTTTATTCTCGGACTTAAAAGAGTAACCGTCTCGCAATAAACAT
GATCCAGATATAATGTTCATGCTTAACGCAGGCACCAAATAACAATTATT
TAAATTTAAAACTAATCCCGAAGATAGATGTAGAGGGAGCGTGCCGACGG
CGATCACATCAACCTTGGAGCCATTTCCAACGCGCATCGTCACCTCGTCT
CTTGCCGGTCTTCGTTTATTCCGCAGCTCCTGTTTTGAGTTATAAATATG
AGCAACCGAACCAGTATCAAATACCTAGGCACTACTACGATTACTAGTAA
GATACACATCTATAACACATATATCAAATATACCTTTCTTCTTGATGTTG
CCGTTCTTCAGATCCGCCAGGTACTTGGGGCAGTTGCGCTTCCAGTGACC
AGCATCCTTGCAGTAGAAGCACTCAGTTTCAGGATTAGGACCAGCCTTGG
GCTTCTTAGCAGGTGCGGCAGCTTTCTTGCCGTCCTTCTTGAAGTTGCCC
TTGTTCTTAGGCTTGCCCCGTTTCTTGAAATTGGTGGTCTTATTGACCAT
CAACACTTGTTGCTCCTTCTTGATCTCCACTTCAGCAGTTTTCAGCATGG
ACGACAGTTCAGGCAACGTCTTGTTCATGCAGTGCATGTTGTAGTTCATC
ACAAAGTTCTTGTAACTTGGTGGCAGTGATTGAAGGAGACGGTGAATCCC
CAATTCATTAGGAATCGATATTCCCAACTCTTGGAGCTTCTTAGCGTACC
CAGACATGGTGAGCACGTGCTCGCTAACGGAGCTTCCCTCTTCCATCTTA
CAGTTAAAGAATTTCTCGGAGGCCTCATAGCTCTCCATGGCCGCGCGAGT
CTCAAAAATTAGCCTGAGCTCCCTAATGATCTCGAACGGGTCGTGGTGCT
CAAAACGCTGTTGGAGCTCCGCTTCTAAACCGTACAGGATGACACACTGA
ACTGTGGAGTAATGATTCTTCCGAGTGGCGAAAACATTCTTTTCATCATC
GGTGGCATTATCTGCAGGTGGGTCACCTAGCGGTGCATTGAGCACATAGG
TCAACTGACCAGCCCTGAGGACGATCTTCAGTCCACGGAACCAGTCCATG
AAATTGCTTCCATTGTTCTTAAGCTTTTCTTTCTCTAGGAACGCACTGAA
ATTGATGGAGTGGGTCGCCATAATCTACAACAATTTGCAAGTAGTTTAGA
CTAAGTTTATGACAAATTGAGTTCAAATTTAATTATTAAACTAACTAGGT
GAACTCCCACTCAAAACAACACCCCTCACGTTGTCTTAGTGATTACAGGA
ACCAAGTCCACTACACCAAGTCCGATCTTCACGAGAGAAGATGTAGTTTC
ATCGGCGAACAATCTTCATGTTCATCATATCAATTATATGACTCATGCTC
TACCTTTTGCTATTCCGTGTTCCGAGACCATGTCTGTACATGCTAGGCTC
GTCAAGACAACCTTAGTTTCCGCATGTGCAAATCTGGCTTGCACCCGTTG
TATGCACACGTAGAATCTATCACATCTGATCATCACGAGATGCTTCGAAA
CGACGAGTCTTAGCAACGGTGCCAACTAAGGGTGAACACTTTATTACTTG
ATATTTAGTGAGAGGGATCATCTTATAATGCTACCGTCGCGATCTAAGCA
ATACAAGATGCATAAAGGATTAACATCACAGGCAATTCGTAATTAGTGTG
ATATGATATGGCCTTTTCTTCTTGCGCCTTTGATCTCCATCTCCAAAGCA
CGAACATGATCTCCATCATCACCAGCATTGCATCAAGGTCAGTGGCGCCG
CTTCATGGTTGTCCATCATCACCAGCAACTATTACAACTAATTGGAATAA
AGCTATTACAAGATGAATAGACACGCAGGTCTTAACAGAATTAAAGACAA
CCATTAGGCTCCTGCCGGTTGCCATATTACAACAAGGATCATTGCATACA
TCAAATACAATCACAATCACATGATGGCCATATCACATCACAGAACCCCT
GCAAAAACAAGTTAGACGCCTCTAATTTTCTTTGCAAGTTTTACGTGGTT
TGGGGCTTTCGCATAAGACCGATCTTACCTACGAACAAGAACCACAACGT
TGATACAAGTGTTGTCAAGATGCTCATTGTAAATTGAATCTTAACTATGG
TAGGAGAGACAGACACCCGCAAAGCCACTTGTGCAAAGCAAGTTGCACGT
CAAGCGTGGAGCAAGTCTCATGTGCGATGACATGTAATGTTAGCCCGAGC
CGCTTCATCCCACCATGCCACAAGATGCAAAGTACACGCTAAGTCACCGA
CAACAAAAGCATCAACGCCCACAAAAACATTGTGTTCTACTCGTGCAACA
GATCTACGCATAGATAGGGCTATGATACCACTGATAGGTTCGTAGCATGG
AAAACAAAAAATTTCTACCGCAAGAACGAACAAAACCTAGATCTAATCCA
GATAAAAGCCAAGATCTAATCTATTAGACATGAGCAACGAGATAGATAGG
AACTAACCCTCGTAGATCCGAAAGCATTAACGAGATTAGATCTCGTGGTT
GATGTAGTCGATCACTTGCCGATCTCAAGATCGTGTGGACGATCCTTCCG
GCGTCGCGTTCTAGCAGCGCTTCCGCCGTCGGTCAAGTAGACGATCCTTC
CGGCGCCGCGTTTCGGCAGCGCTTCCGCAGTCGGTCACACGTGCGAAGTC
GAAGTAGACCTCCTCTCCCCGTTCCAGCGAGCAGCGGAGGTAGTAGATCT
TCTCCACGGAATCCCAGCAGCACGACGGCGTGGTGGTGGTGGTGGAGTAG
AGAATTCTGCAGGGTTTCGCCTATGCCTATGCAGAAGATGGTGGAGGAGA
GAGGCGGCAGAGATTGGGTGTTATGAGAGCTCAGGAGGAGGTGGCGCCCC
TGCCCCTCTATTTAAAGAAAGGAGGCGCCTAGGGAGGGGAAGTCCTTGTA
GGACTCCCCTCCCTTGTAGGCCGGCGGATTGGAGGTGGGGGGAGGAGTCC
TCCTCCCCCACGACTCCGTATCTTGACCCACCAGGACTCCTTGATCCCTA
TCTTGATTTTCAAGCAAACTCCAGAATATCTTCTAGAACCTTCCGGAACA
TTCCAAAACCTTCTAGAATCCTCATACAAACACTTCGGAACATTTCCTAA
CTTAGAAAATGATCCCCTATATATGAATCTTATTCTCCGGACCATTCCGG
ATCTCCTCGTGATGTCCCGAATCCAATCCGAGACTCCGAACAACATTCTA
TCTCCAACGCACATTCCATATCTACTTAAAACAACTTCGAACCTTAAGTG
TGTCACCCTACGGTTCGTGAATATGTAGACATGATAGAGACACATCTCCT
ATCAATAACCATCAGCGGGACCTGGAGATCCATAATGGCTCCCATATACT
CAACGATGACTTCGCGATCGATTGAACCACTTCGCGATCGATACTATACT
TATCCGAGGTTTGATCGTCGGTATCTCCATACCTAGTTCTACCTCGTTAC
TGATAAGTACTCTTTACTCGTTCCGTGATATGTCATCCCTTGTGACCCAG
TCACATGCTTGCAAGCTAACTAGATGACATTCCACCGAGAGGGCCCAAAG
CATATCTATCCGTCATATGGATGGACAAATTCCAATCTTGGTTCATGCGC
TTCAACACATACTTTCAGAATACCCAATGACACTTTTATAACCACCCAGT
TACGAAACGGCGTTTGATGTCATCAAAGTATCCATCCGGTGATGGTGATT
AACATAACCTCATGGTCGAAGGAATATGTTACTATGTATTTGAAAGCTTA
CAGCAATACGAACTTAATGACTTGATCTTATGCTACGCTTACTATGGGTG
TGTGTCCATCACATCATTCTCCTAATGATATAATCTTGTTATTAATCACA
TCCTAATGTCCATGATCAGGAAACCATGATCATCAATTAATCAACAAGCT
AGTTTAACAAGAGGCTTATTAGGGACTCTCTTATGTTTACAAAACACACA
AGTATTAGTGTTTTCTAATAATAGAATTATAGCATGTGATGTAAACATTC
ATCATAAATACAAAGATATAATAATAATCACTTTTATTATTGCCTCTTGG
GCATATCTCCAACAGTTTCTTGTGAAGTTATGTTCAAATTCGCTGCTTCC
TAAACATTGATGTCTTGATGCAGGCCTTATTTGTCACCAGAATTTAAAGT
AGAAGGCAGAATCTCCAAAGAGTTAGATGTGTTCAGTTTGGGAGTAATTA
TCATACAGATAATATGCGGAAGAAAAATTTACGGCGACAACATCGGGACA
GATAATGATGAGTTTTCTGAGGTTACAAGGAATTTTGTTTTTAAGAGTTT
TAGATTGCATAATCCATCTTGAGACATTGTATCATTTTGCCTATCTATTT
GGACTGTAGATACTTGCAAATTGGCAACCAAGGTTGGAGAGAGAAGGATC
AACGGAAGAGAACATATCACAGTTGCATACATGCATCATATTAGCTATGG
AATGCATGGACACAGACCCGCGAAAAAGGCCAACTACATGATATATAATT
CAGACTCTTAA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.