Query (optional)   in Class  

GrainGenes Sequence Report: AE019561

[Submit comment/correction]

Sequence
AE019561
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE019561
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
ATGACCCCAGGCACGCACCTGTCGCATCCGCTGCCCGTTGCCTTGCCTGC
CTGCCCACCGGCCACCCTCGCTTTCGTCGTCTTCGCGTCTCCCACCACCG
CCCCACTGTGGCTGCCCGGCCGCCGTCTCCACTTCTCCACCCTCTCCCCT
TCCTCCCCGTCGCGCGGCTGGTAACGCCACATCCAGCTACCCCGCCCCCT
CCGCTGCCGGGTACACTGGACTGGGGTGGAGATCCGGACTTCGATTTCGT
CGGTAAGCTCGGTCGGGGCGCACTTAATTCCGAAGCATTTTTCCATTCCG
GCCAAGTAGAATCGATGAACCGTATGAGGGTTTTGGCATCTGGGAAGAAA
CGCATATGCGATGTCGATGTAGTGTCGGAACTTACCAGTAGGGAGGAATG
GATCACCTCGCCAAATTAAGCACCGAGAGCTGAAAATTTCGGGGGAACAA
TTGTTTGACCCAAGCCCTTACTTGTTAGGGCATTTTCTGCTTCGCCCACG
CCAAGCTCCAGCAGGAGGCAGCGAGTCCACCTCTGAGCAGCCGAACAGAA
TGGCCTGTGCCTCCAAGGACGATCTCACTCTCCTCTCCGGTGGGGAGCTT
GTCGCCCACCTCACCAACACCTGTCGCAGGGCTGACTCTGAGGCGGCCGC
GCGCGTCCTTGATGAGCGGGACCGCAAGTTTGCCAAGGACGAGGTTGCAC
TAAAGGCCGTGCTTGCTGACCTGACCTTGACGCAGCGAGCGCGCAAGAGC
GCGAGGTTGCCGAGGCTAAGTCCAAATTGGAGGCCGCTCTCAAGGAGGCC
GACATCCTGCGGAAGAAGTACGAGGCGATCCTGGGCGCCCATGGCCGACC
GCTGGAAGCTGCCAATGAGATGGCACTCCTACTCGAGGCTTCTGCTCCAG
ACACTGTACATCAGGACGAGTCACATGTCGAGGAGGCGAGCAAGGGGGAG
GTGAAAGAGCCTGACATAATTGACCTCAACGTGCTTGGTTGCTGTCCTGC
TGAGGCAGGGGAGATGCGGGTGAGGCAAGAGAGAGGCGAAGGTGGTGGGG
TGGAGCATGGTGGAGGCGCAAGAACAGAGAGGCGGAAGGAAGGGGTGACA
CGGTGGCGCTCACTGAGGGAGCTGTGCGCCCCTCAGGTTGGGCAGGGTGA
GGGGTGAGTCGTGTTTTTTCTTTAAATAAGTTGCTTAGTTTTATTAATTG
CCACAAGATCAAGGCTTGTTTTCCCTTTTGTGGTTAGTTATTGTGCTTAA
ACCTCTGAATGTGTGCACAAAGTTGGTATTCTAGCGAAAGTGCTAAACTG
CAGAGTGCTATTTTAGCAATTACAATGTAGAAGGTGGTATATAGTCAAGT
GCTAAAGTAGGAAATGGTGTATGATTAAAATCCCTAATCAAGTTCTATTG
CCCATAGAATAATTAATGCAATGAATAATCTTTTTGGGCCTATTAGATCA
AACAAGAAGGCAGCGGCAGGTTTAGAGAAGCTTGGGAAGGGCCGAGAGAT
GTCGCTGGGCTATGCTGAGAAGCTGTCGTACCGGGAGGATGTGGGCAGTG
TAGGCATGCCTGAGATGTTCGACTCCCCCAAACTCCTCCAAGGAAAGGTA
GATCATGTTGCATACTACCAAAACTTTTTTTGCTTTGTCTACCTACGCTG
TAAGTGACCTATTGTTCATTCTTCTCTTGTGTTAGCCTTACTTGTTGCTT
GTGTAAACTATTATGCGATTAGTTATGATTAGCTAAGAAATACTCCCTCC
GTTCGGAAATATAAGACGTTTTAGCTTTGTGAATCGAATGTATCTAGACA
TCTTTTAGTGCATAGGTTCGTAGAGGTTCAGAGTGAACTTATACACTAAA
AGGTGTCTAGATACATTCGTTTCACGAAGCTAGAATGTCTTATATTTCCG
AACAGAGGGAGTATATAATAAAATATGATGGGTCTCAGAAGAGAGAAAAT
CTTTCTTTTGTTTCTTTTTCCTTAAGAGTCCGTATCAAGACCCATGCGTG
CCACCTTATAACATAGAAGCCTTGGAGAAGTTTTGGTTAGATAAGTCATA
TGAAAGACTATCAAATTTGGAAAGATTATGTCATGAAGCCACCAGTGTTT
CGTGAAATTGAGTAGTTACTGGGTTGCAAAATTATACTGTGTGATGGTTC
ATTGGTTGTAGAGTTGAATAAATGAAGGAAACATTGTTGGCCTACAACTT
GGTTGGGTGCAAGGGTCTTCTAATCTCATGTTACATACAATTTAATCATA
CACCAGCTTTGGTCCTCATCCTGAGGATTTGTGTTTAGGCTAGTCCAGAA
GTCTAGCTACTAGGTGCTGAAAGGTGTACGAATATGTGGAAAACAAGGAA
TTATATTGTGTGACGGTTCATTGGTTATAGAGTTGAATAAATGAAGGAAA
TATTTTGGGCCTACAACTTGGTTGGGTGCAAGGCTCTTCTAATCTCATGT
TACATACTCCCTCCTTCCATAATAAGTGTCGCTGATTTAGTACAACTTCG
CTAATTTAGTACAACTTTGTACTAAATCAGCGACATTTATTATGGATCGG
AGGGAGTACAATTTAATCATACACCGGCTTGGTCCTCATCCTGAGGGTTT
GTGTTTAGGCTAATCCAAAAGTCTACTAGGTACTGAAAGGCGTACAAATA
CTTAGAAAACTGGGCAGCAAACATCCCCTTTTAGGAAACGTGCTTTAATT
GCCAATATATAAAAAATATTTGGCAGGCATTTGTCCAGTTCTCGTGTAAA
ATTCCCATGTTATAACATGCAGTCATTTTACTACCTGACATTGTTTTCTG
AAGAAAAAAACATTGTTGAAGTGTTCCTTTTGCTGGATTAATGGTGCAGA
TAGAAGAGCTTGCAATTATGGTGCAAAAGGTTGGGCTACGATGGTGGATG
TCAATAAAATCTCTAGTCATGTTTTATATGCAGCAGTTTCAGCGAAATAT
CCCTGATTGTTTCAGAGTAAGCATTTAGTGGTGTTTACCGGAGCAGGGAT
ATCAACTTCATCAGGTATACCTGATTTCCGAGGGCCAAAGGGTGTGTGGA
CTCTGCAGGTAGTCTGTCTATGTTGCTTCCGCTTAGTATGGTTCCCTCCG
TGCATGAATCTTTTTCTTTTCAGAATATGTTGTGATGCTTGATTGCTAAC
CTTTCATATTTCACTGTTCTCGTGTGCCATGTGGTTCATGTGTAACAGAA
AACTTAGGCTTCCATGTAGTTACTATCTGACTTATGTAACCCAAAAGTTA
TGCTTTATGATGTTCTGCAGTTTTATTATGTTAATGACCATACTTATTCA
CATAGTAGTTACCATCATTTCCTATACGATAATTCTACCTTTCATGAGAA
ACCGTTATTTGAATAAATAATAATCAGTTGATATGTCACATGTTTTTTGT
AGCGTGCAGGAAAAGGTGTTCCTGATGCTTCACTCCCATTTCACCGAGCA
GCTCCAACCTTGACACATATGGCGCTAGTTGGATTGGAAAGAGCAGGACT
CCTAAAGTTTGTCATAAGCCAGGTGTGCATTATTGAACTAAGTTTACTGT
ATGGAGTTTTATATTGGTTTTTATGACCACTATTAATGACTTACTATTAT
AAGATCAACTCTTAGGGAGCTTTTGCTCTGAGTAACTATTACAAGGTTAA
CACTTAGGGACTTTGCTCCGAGTCACTATTATAAGGTTAACTCTCAGGAA
CGTTTCTGCAAAATTAGTTTCTATGGGCTGCAGATATTCTACTGATTAGC
GTACTGAAAGCAAATATGCCAATATTTAATATGCGAACTCTGTTTTTGTG
TTTCACAAATTTTACTACTACCAAGTATGTCCTTTCATTACAGTATTATT
CTTTGTGGTGAACAAATTGCCATTTATCACAATCATATTTATTTTATCCA
TGTAATTTGAGCTTGTACATGGCTTACAGAAGTTATTTTTGCCAGAATGT
TGACAGCTTGCATCTGCGCTCTGGCTTCCCGAGGGAGAAGCTGGCTGAGT
TGCATGGGAATTCTTTCAAGGAGATCTGCCCATGCTGTAAAACGGAGTAA
GCTTACCTTGCTCTGCCAAAATATTAGTTCCTTTTTCTTCTATATATTTA
TTCATTTAGCTCTTCCCTGAGTCCTTATCTATATGAAGGTACCTACGTGA
TTTTGAAATAGAGACAATAGGACTGAAGGATACTCCGAGGCGCTGTACCG
ATAAAAACTGTGGAGCTAGATTAAAAGATACAGTTCTTGATTGGGAGGTA
TAAACTATATTAAGAGCTGCAAAATTTCTCTCTCGACTTGCTTTACCAAG
AAAGTGCTTCTTTTTGAACTGAAAGTTCTGTTAGACGATGCATGATTTTA
TCGTTTTACTTGCTTAATATTTGCTATAAAGTTTGTGTATTTCTGTTATA
ATGTGGTTATAGTTGCCTCCATGCCATTTAGAAATCCGTCACTGACGACA
TTGCCTCAAAATGACTTTTTTAATTCATAGCTAGTATGATATTTGGTGAA
TTTACTTGATTATATAATTGCAAACACATTATTTTTTAGGTGTTGTGTTT
ACAAAATCAAATGTTTAACAGTGAAAATATATTAACTTCATGCTCTCCAA
ATAAAATGTTCAACATTGATAACAAAATTCACAGAGCTGTTCTGTGACTA
TTGCAATGACCAATACATGCACAGTACACGGAGGACATATACAAAGTTAC
AAAGAATCCTAGCTGTTTCCTGACTGAATTTGCCTGTGTTTATGTAATCA
GCTTATTATATTTGTTAATGTCCCATTGGGGTCATATGTATCATATATAT
TTATATACACACTACATGGAGGAGATATACAAATAATTTCCTAGAGAGGG
AGAGGGAGAGATGAACTACTACACGTCTACGTCGAAGTTGTTGCCAATTC
ATTAATAATTCCATCGATTTTTCAGGATGCTTTGCCCCCTGAGGAGATGA
ATTCTGCCGAGGAGCAGTGTCGAGCAGCTGATCTTGTCCTATGCCTAGGA
ACTAGGTTTGTCATGCTACCCTCACGCAATAGCTGTAATTTCTTTCACAG
TTTCCTTCTACATTACTGAAGTTATTATGGTTACAAAACTGTCACTTGCC
AATAAATGTCAATTGTTTAATTGATAAGAAACTCAGAACTCCAGTTGCTA
TAGCTCTATTTTTCATTTTATTTTGGAAAACTGTCCAGGTACCATTCGCT
TCAAACAGTTATCCAATGCACCATCAAACACCGCAATAAAGCCAGCTAAC
AGCTTTACGGGGTAGACTAACCATTTGTAGTTCAGGGGGTTTAATGGACT
TGCCTGAAAGCCCAAGGGGTGCAATATGTATCATTTACTAAATTGTATTT
AGTAAGCATCTCATGTTCGACCTGGGACATCAATTGCTGGATTAGTAGTT
CTATAAAAGGCTATGTAGATGCACAAAATTTTAAATGCATGATAACTATT
CCTTTAGTATATCATAGTTAGGACCTGGGATCCCTATTTCTCTTTCGACG
TGCTTGGAAGAGTGTGCTCTGGATACTACACCTTTTGTGGAACGTCAGCC
CAAGGATGGTGCAAGACTTGGCCACAACATGCACATGTTTTGGCCTGAGG
AAATGACCACAAGTACAAGGATCATCCTTTACCTAAGTTGCACAGAGATG
CACCAGGATAATCGAGTCATTTGACACAGCAAAAGACTTTCTCGCACCGA
GTAAGATAAGAAGTGAGAAAAACAGCAATTCAATGGGTGTGGTTGTAGCT
TGTCAAGTGAAAAGTGCTTGCCAACAATACATGCATCTTTCAAGAACGGT
AAGTGTTTCATCAGGCCATTGTAGGTTCAGGTGGCACCAGGAAGACTTCC
TAGATTAGATATAATGGTTGATGACCTAAGCTGCTGCATGGGATCAACCA
ATACCAGTCTGTGCATCCCTAGCTCAACTTCAACAAGTCATCAAGTCCTG
TCTCCTTCAAAGAATGGAACCTTGGTCTGGATCAAAAGTAGTCTGACGAC
TATTTGCGACAGTCACTTTTGATGCATCAAAAGATAAATGAACTATTGAG
TTTCGACATGTCTTCATGCTCTGCCACGTTGCAGTGCAGTGTATGTTTAA
CATGTATAGTAGTCAAGAATTTCAGATCCCCTATCTCCCATATACTTGTT
TTTCACCATGATCCAGTCTGAGGCATTATGTCCTACCCCCCCTCTCATTT
GATCAATATGACCTTTGTTGGTTAGTGTTAGTTCATCGTTTATTTTGGAG
TAGCAGGTTCTTAATGTCCTACCTTATTTATCAGTTCTGCTTGTTGAACG
TTCTTTATGATAATAATGGCCCGTGCTTCTGTTATTGTTTCTTTTCTAAT
ATACAGTAATATGCAGCTTGCAGATTACTCCTGCATGTAATATGCCTCTG
ATGTCAATCAAGAATGGGGGGAAAGTGGCTATTGTTAATCTTCAGGTGCG
TGCAATTGAATACAAGCATACTGTTTTTTGTCTTGAAATATCGACCAAAG
CACTAACTTGCACACTTGTCTCTATTTTCTAGGAATGCCATACTTGTGCT
TGGGAAAATTTTGTTAATATTGATGCTACGCATGTACCTTTACAAAGTTG
GCAATTTTGAAGTAGAACTAAACTGTGTTTCAACTCATATGTGCCAATAT
ATACCGTGTATCTCCGCAAATGACTGCAATACTGTCGGACCATTTTAGAA
ATTTGAAGTGCTGTTTATTTGGTTTTTTCATTAGGCCTTAAAATTTATGG
TTCAAATCACTTAAATCTCTAATTTGACAGTTAAATAGTTGGGGTTTAAA
ATTCGAGTTTGACGTCAGAACTCATTTTGTAGCATGGCCTGCATTTAGAA
CTTGGATTCTAGATTCAATACAAAGGTTTGGATTGAAATAGTTCACAATT
TCCAAAGAACCAATTTTGTAGGTGAAATCTGTCAATTAAATATAGAGTTA
AACACAGGGCATTTACCTTAGTTAAAATTTGACTATTAATGTCTAGAATG
AGATATGACGAAACACTGCTTGCTTTGGTGTATACAGAAAATGAGAGCAG
CATATGCATCCTTGGGATAATAGACCCAAAGACTGCTACTTTCTCATGGC
ATTTGATAAACCTGCAACAAGTTTGCAATCTGATTCCTTACAAGTTCATC
TGTTTCTCTTTTACTTTCAGGCAACTCCGAAGGATAAAAAGGCAAGCCTT
GTCATCCATGGGCTTGTGGATAAGGTGTCTGTTTTTCTTGAGGTTCCTTT
GTTGCTATTATGTTTCCTTGCTATAGTAATTTACTGTGTCAACTCAGGTC
ATTGCTGGAGTGATGTGCATTCTGAATCTGCGCATTCCTCCATATATACG
TATTGACTTCATTCAGCTTCTTCTCCGGCACACAGTCAAAAGTAGGGTCA
TCTCACCATTTCTTAAATATCCATTTGTACTTGGCTCTGCAAATTTCTTG
CTTTCAAAGTTAGTGACAAACTAAATGCTGGCATAATCAAAAGTCCCTCA
TTTCCAATATTTGAGCAACTGAAGATGATGAAGTTCCCTGCAAACTTATG
GTCTCCATACAAATACAAACAGTGAAATTCTGTATGATGTCATTCATAAA
TTGCAAATGAATTTTGATTTATGATTAAGTTCTTTCTGTGCAACTGTCCT
GGGATAGCTATTCGTTTAATTGGCTTTATATGAAAATGGATTTAACCACC
CAGAAACTCGAAAAGGAGGACAAGCTCCATGGAGCCTTTTTTTTTAATTT
ATTCGAAAGTTCATTTGTTCACTTAAAATATATATGGAAAAAAATACGCA
AGAACATATGGATGTCTGGTATGTATAAGGTTTCATTGAATTATGTTTTT
GTTTGCGATCTACAGAAAAACACAAATGTGAAGACCAAACAAAAAATGCC
TATTTAGAGCCCACATTTTTGTGTACTTTTGCATGTTCATAGCGTATGTG
TAAACTGTTTTGGAACTTTTAAATATGATTTTCAATATTTTTTGCAATAA
AGGGTTCCCTGGAGCTCGGGAGCCATATTTCCACACCCATTTAATCACAT
GCTTGCTCATACTGCATCAAATTTCTATTCAGAGAAATGTGTAAGATGGA
CTCTGCGAGTAACAAGCATTCATGGCGTGCGAGCACCACTGTCATTTCTT
CGGTCAATCGAGGTTTTACAACTTTGACTATAATACATCCACATAGTTGT
GTACTACTATGCTTTTATATACTCTACATTATTAAATTCTCCAGCAAGGA
GATACTATTGCATCCAATCGTTTGTGCAAATATTATTGCGTTAAGAATCA
ATTGAATTGAAGTCAGTGTCATTGTTGGCTTCAAGATATGGGTCGTAGTT
TGTGTGCACTAACTAAATACTCCATCCAATACGCTAGTTTCTATTATCAT
ATGTTCGTAATACCCAATAAATTATGACATTACTGATATTTCCCTGACAA
ATCTACATGCATGACAACAACTTTTTGAGAATTGAAGGGAGTAGTAGAAT
CCCCAAAGTGGCACATTCGTAAGAGCTATGCACCCTTTTGCCGATCAAAG
ATGATCACTGTGGCAGCCTTGTCATATATGTTTCTGCCAAGATTTCTTGC
AAGGTAGATACTTTTATCTACTAGACTGACCCATCTCTTTTAGGAAAATT
TCTCATCATTTCTCCTGCTTTGGAGTCTCTAAACATAGAAAGTCTAGCTT
CTGTAACCAACCAATTTGTCGACATACCACTGAACCATTTTTTGTCGTAA
TGACAATGAGCCTTATTGCAGCTGAGTAACAGGGATGTGGCTGCTTGTTT
TCTCCTCTGATGATATGGAAGTTAGTAAGCTAACAGCCAAGATTATTGAA
AGCTGACCATAAAGTATTTCTTAACATAGACGCCTGTGTGTTCTAATGGA
AAGCTTCTCTTACTAACATATGGTCAAATTTTCTTATTCATCAACAGGTT
TCCTTTCCAGAAAGATCTGACATGAAGCCTGTAGTGCTTATGGAGCAACC
ATTTTCTTTGCAGAGGTATATTCGAGATTGTAAAACCCCCCAATCAATGT
GTGCCAACTGATCACACAGAAAAAGAAATGTTTCATTTTTCAAATATTAT
GTGCCATTCACATTGGAGATTTGCCTACTTCTGTAGGGAAACATCAATGT
CTAGCACATTTTTCATGTTGCTGACATTGAACTTCAGTGATGGCTGTGGC
TGCTCGAGATCATCAATTGAATGTCATGTTAATTTTCAGGTTAGCTGCAA
CTGGACACTCCTTTATCATTTTGTTCTGACTAAACTCCATAGAGTAGAGT
GAACTAAAAAAGATAAGCAACAGGCTGATGGACACACCATTTCCTTTTTT
GTTCTTGAATTTAATCAAATTGTGCCTGTTTGCAGTACGTGTAAAGTAGT
GCATCCCTTATTTAGTTATTTTGCAAAGGAAGTAGTGCATCCCTGATAGT
TGGAAAATTTTGGATTAGTGTAACGTGTATTCCACATACATACATGGAGT
AGCTACTCCATACAGGCAGCAGTTCTCTATGTCTTTAATTTACTCGACTA
CGTACTTGGTAGTACCATTCTACTTTACTATTATTCTGTGGACTTGTTGA
AGTGATTTTTACCTACTTTTTTGGACTGGCTGTTTCGCATAATGCCTTGT
AACCATGTTGGTTAACACCAAGTAGATTCCGTTGATCCTGCTTACCGTGC
AATTTAAATGTGACTCATGCAGAAGCAAAAGGAGAGCTTTGTTAGAGAAA
GAAGCCTAGTCCTACAAGAGTTGAAGTGTAGTGCAGAGCGCCAGCGTCGC
GTCGGGCAGCAAGCTATTCTTGAAAGGCAGAATCTGCCACGAGCCGAGAC
ATCTGTACACGCGTTTGTGACCAACCTTGTCAGGTATGATGCTGAAGATC
TCAAGGTGGCCGAGCCCAAGGGTACCTGGATGGACATCGGCAGCGGCAGC
AACAATAATAAGCTTACAAAACGACAAGTGGAAGGCCCTAGCGGGTACCC
AGCATCGCCAAAGAAGCTAAAGTGCTAGAACTGTCTAGATCGAGTCATCT
GACTTGATCCAGTGGAGTTATCGGGCTCGGTAGATGGGTAGTTTGCAGTA
GCAAGAGTAAGATGCAGAGAATTAGATAAGCGAAGTAAGAAGAAGGTAGG
TGCATAGCGAAGGGGCCAGCTCAAGGGAAATTGGTGGAAACACTAGATTG
TATCTTTCCTTTTCTTTTTGTAAAGCTCTCGGAGTTCCGGAACTTCTGAA
GTGTTGATATCATGTTATCCAATTAAGAACTGGAGGTCAAGTAAATGATA
CCAAATGGAACAAGAATT

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.