Query (optional)   in Class  All Allele Author Colleague Collection Assembly Gene Gene Class Gene Product Germplasm Image Journal Keyword Library Locus Map Map Data Marker Pathology Polymorphism Probe Protein QTL Rearrangement Reference Sequence Species Trait Trait Study Two Point Data  

---

GrainGenes Sequence Report: AE046241

[Submit comment/correction]

Sequence	AE046241
Germplasm	BYU132 (oat)
Species	Avena erithiana
Probe	AE046241
Reference	Maughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA	ATGTCCATGTCGGTCAGCACGCAGCTGGCCGGCGACAGCCGCAGGTGGGA GTGGGGCAGCCGTAGCGGCGTGTCGGGGCTGTTGGCACAGAAGAGCAATG TGCTCAGCCCTAGCTTCTGGCACATGATTCGTGAGACTTTTAGGTTCAGG AACGATGCCATCAGGTACCTAAACAACCATGAGAAAAACCCTGATCTGGG CCGGGATGAGACCCTGGGGCAGTTCGTCCGGTCGCATGGGTACTCCCAGC TGTTTCAGGAGGTTTACCTGGTATATTACTGATCGTTATGAATTATACTC CTTAAATTGTCAGTACTAACTATCTCTAAAATATAAAATGTTTTGATAGA CTGTTTTAGGCTACCAAAATATCTTATATTTTGAAAGAGAGGTTGTACAA ATGATAGCTAAATTTATTTGCATCAACAAAGTATGCTAAGCCGGTACTAT GTTGACGATTAATTGCTGCAGATTCCTGTTTGCGCATGCATATGGTCCTG CCCGTCACAAGATGTTCTGGGTTTCCCTGCCCTCTTCGTGCTCTCATGTT ATCAGGTTCTAGAGGTGCGCGCCAATTTCATGGATACAAACAGATTTGAC GTATATATAATGCAGCCACTGACTCTCTTGTTCCTTTCTTTCTTTTGGGT TGTTCTTGCATTCAGCCGTTCGGTCGGTGCACCCAATGGCTTACTGTCAT GGATGGTTCACAGTCCTATGTAACCAAGGTAATTACCAATTTAGTTCAAG CTTGGATATATCATCATCTCTTCGAACCTGAAGGACTATTGTAATGGAAA AGAATCTAGTATAGTTAAAATTTGTTATTTCATAGAGTTTTCTAAACATA ACCAATGCAATATATAATTTTATTTTTACTTACAATATTTGTACCATTAT TGTTTATTATAAACAATGTTAATATGAATGATATGCCATTATTTTTATAT ACATATTGTTGTAAATGTATCTCAATTATGTAATTTAAATAATGTATACA ATATTAGATATCTTATTTATCTTTTGTGCCCACAAGATAGCAATGTATGT ATATTTGCTATTAAAGGAGAGTTGGTGGTAACCATGTTACACTTGTAACT AACTACTGGAAAATGTCACCTCGCTTAGTACCTAGTCACCCATATTTTCA ATTTACTAGTTATCTTCTCATGCCAAACATAAAAGAAAAGCAGAGCGCAT TCCAATCATGTTTAGTTTTAGTTTCCTATTACTATCTCATGCATACAAAG AAAAGCTGCATGTGTACAAATTAATATCAGACTTAGTTTTTTATTACCGT CTCATGTATATAAAGGAACACCATATCCATGCCATCGGATGACAAATTTA GTTTACTATCAATGCTTTTCATACTTGAGCTTTTCATGTCACAACATAGG TCATAACAAGTATGGACATGCCTGTTGTTTCTTTGAAACCTATGGATGTG CCATTGGAGAGAGAAAACTAATTAAATGTTGAAAATAACAATTTGTTTAG AAAGTCACCCGATAAATTAATGGCTAGACATTGTTCTTTAAGAAAACATG TCGTATCGAATGCCTTTCATCTACAAATACCATATGTGTATTTTTAGTAT AGATTATTGACATGTAGAGAAAAATAGGGAGAATAATTTGTTGGGACACG ATAAAAATGACATCATACTGACACAACTTAAACCTCTCGAAGTAGGAATA TTTATGAACTATTCCATGTTATATCACTCTTATATCTCATAAATTAAAAA AAATCAATAAAACCTTAACATCATTTTTTTGAAAGTAATAGAACATGGAA GGGGGAAAATATCATATATTTAAACATAATACAGTATTTCATGTCATCAT ACTCACATGTTTTGATTTTATGAAACATCAACATTTATAAAAAGAACACA TCCAATAGATAGTCAGGCCAGTTTTTTCTTATCATGAACTGGCAGGATGG CCCAGCCCAACATGGTCCACCAAGGCCTATTTGTGAATAGGTCCTGCCAT GTATATAGGCGTGCTTCTAGTACGAAAATGCTGGTGCCGCACAGGGGCCA CTGCCCATTTAGCATCTTCGCACTATTTTATCTTTTGTCATTTTCTATTT CTTTTTTCTATTCTATTTCCGTTTCTTTTATTTTCTTTTCTGTTTTCTTT TGCGGTTTTCATTTTGAATTTCGTTTTCAGTTTTTTGGCTTTTAAAAAAT GTTCAAAATTTTGAAAATGGTTCACGGTTTTTTAAATAAAATGGTTCATT TTTTTTTGGAAAATGTTCATTTTTTTGAATTTTTGGTTCATCGTTTTCTA TTTTGGTTCATGATTTTTCAAGAAATTTCTTGATTTTTTTGAAATTTGGT TAATGTTTTTTTGAAAAATTCCATGATTTTTTCAAAAATTAGTTCATGTT TTTTAAAATTTTGGTTCACGAGTGTCAGATTTTGGTTCATAAATTTTGTT CATGAATATTAAAATTTTTGGTCCATGAATTTTCAAAATTGGTTCATTAA TTTCAAAAAATGTTCATGACTTCTTAAAATTTGGTTCATGAAAAATGCTT GTTTCAATTTTTCAAAATTTGGTTCATGTTCAAATTTTGGTTCATGGTTT TCTTAAAGTCTTCATTATGTAGAAAAATAAACAAGAGAAGGAAGTATTGA ACTTAAAAAGCAGTACGATCAGAACGAAAGAACTAGAACTTGTTTGATCG AAAACGAAAGAAGCACTACCATCACTGAACCTGATGCAAATGCATTCAGC AGTACATACTTTATTGGGCCGAGCCCACTAACACACGGGGGGTTGCGCGC TTCAAGTGGCGAGTTGAGGTCGTACCTCGTAAACCAACCAATAGCACCTT TCCTACTGCGGAAATGCTAATTGCCGCCCGCTCCGACATGTCTAGTAAAC GGGCTAGCCCCTATGGCCCTTTGTGTTGTTTTTTGGATTTTTTTTGGAAA AAACAAAAAGTAAACGGGCCGTAATGCTGACATGCTAGATGTAGGTCATG GCGCAGACATGGCCCTAGGAATACCGCAGACTTGGCAAGGCCCGTTAAGC AACGTGGCGGGTCAAGCCAGTCACTGATTTGGTATACGGGCCAACGTCCT GGCCCATGAAAATCGGCCCATTTGGCCAGCTTTGAACTGGCTGATGTTAC ATGTGTCAAAAAAAATGTAACAGAGCTGGCTCAAAAAAAAACATGTAAAA AAAAGAACTAGCTTCTGTGAGAACTTTTTTTTTTGGTTCTGTGGGCCGCC GCCAGCCGGCATGGCAGTAGCACGGTGATGGCAGACGCTTACGAGGTCCT TGATCAGTGGGCGCCCGGCCTTGCTCCGTTGAGTTTCTCTTGATGGTGAC TCCGGCGGCAGCCCGGACCGGCACCTGCGGTTACGTGCGTATGGCTCGCC GCAGGATCCCGTCTGCGAGACCCGACAGCTTCTCCACCTGCGACGTTGAG GCTGACGCTTACAGGCTACGACCTAGACCTGGGCGTCCAGGAGGGGAAGG AGCACCTTCTGCACTTGAACCTCGGAGCAGACGAGGTCGCTTCGTGGGAG AGTAGTAGTGCTACCGTGCGCATGCCCGCAGCGCAAGCAAGGTATTTGAG AAAATGACTGTAAGACATCGTGCATGCCGTTCTAACATTTTTGGTTGCTT TTGGATTATTATCGGTTAAGAATGGTAATTCCACACCCTGAGAATTAAGG GAATTTCAAACGCGCTTCTTCAAAGAAAATTAAAAAGTGGTCTCACTCGT GTTCCGAGTGTAAAATCCACTCCCAGCTGAATGTTGGTTGCTGTGCATGA ACAAGTTTTTTTTCCTATACAAATACACACCGTGCTATTTATCATTTCAT ATCCAACTTCTGAGATGCAAAGACAATTTTCTGTGATTCGCACACTGCAT TTCATGGTATCTGATACGTGTAGGTCACAGATGAACTGGAAAGCATGGGT TGCAGGATCAAGACCAGCTGCCAAGTCAATTCGGTTTCACGTGTCGACGG AGGTACTGCCAGGCTCATCCATTTCAATTTTTCTTCCGTTCCCTCTGCTG GCAACTCCGAAACGATGTCTCCTCCACTGTGTTATCATTTTTTGCTGGCT GCAGGCTACAGAGTATCAGAGGCTGATGGTTCAGAGGAGGTGTACGACAG GATTGTATTTGATGTGCGTGCACCTCGTGCTCTAAGGATACTAGGAGGTG AAGCAACCCACCAAGAACTAAGAATTCTTGGTGCTTTCCAGTATGCCTGC AGGTAATGTATACTGCTGCCGCTGCTAGCCTGCTACTACTATATACCTCA TTATCTGCAGGGATTCTTACCTGTTACTTGGCATGTTATACAATTATTAT GGCATGCTATGCAACTTGTGTATCTAGTATTTACGCATGTGCCTCACCAT CTGCAGTGATATATACCTCCACTGTGACAAAAGTTTCATGCCATCTAATG TGTCAGCATGGAGCGCATTGAACTTCCTGAAGACATCGAGCGGGGGTGTC TCTGTTACCTACTGGCTGAACCTGCTTCAGGTACAGCGACTTGCAGTGCA TTTACAGTTCACTTTGGTATGCATCGAATCAGGATTCGGGAGCACCCGTG ATATGTTTGTCCTTGTATTTCTTGGAAACTCTAGAACATAGAATCAACCG GCAGACATTACCTGGTTACGCTGAATCCTCCTCACGTCCCGGACCATGTC TTGCTCAAATGGAATGCTAGCCTTTTTGTCCCCTCTGTTTCTGCTGCAAA GGCTTCTCTTGAGCTTCCGCACATCCAGGGGAACAGAGGGATATGGTTCT GCGGGCCATACCAAGGTAACTTAATATCTATTTGTATAGCGCAATGTTCC TTGCTGATTAGGTCTAAAGCGTCTCTTCTTTCCTGGATCACACAGGTTAT GGCTTCCTTGAAGAAGGGGTTAAGGTACTCCATCTGTCATGAAATTTATA TGTTTACATCTGATACTTACATGTTGGATATGTCGATATGTGTAGGCTGG GAAAGCAGCAGCTCAAGGTTTGCTTGGGAAAGGGAGCAGCCTTCTGTTGA GCCCAAAACAGATGGTGCCGTCATGGACCGAGGCTGGGGCACGTATTCTG GTAGCAAGATTTCTCAATCAATTCATATCCCTCGGTAACTTGATGTGAGT TCTTCCATCTGTTGATCTGTATAGTGGGCTATGCATGTCTAACTACGATC GCTCCTCACTTGATTATTTTCACCCCTAGCTTGCTGGAAGAAGGAGGCAA TACATTCAGCTTTGGCAAAGCAGACACAAAGTGTCATGTGAAATCTGTCC TACAAATTCATGACCCTCTCTTCTATTGGAAGGTTTTAACTTTTCCATTC AGTTTCCTTGATGCATCCTCCATTCCACTCCACTTGCTTTATCTGATTTC ATGTAACACGCAATTTTTAGGTTGCAACCGAAGCAGACCTTGGCTTAGCA GATGCCTATATCAACGGTTATTTCTCTTTTGTTGACAAGAGAGAAGGGCT TCTGAATCTTTTCCTGGTAAATTAAAATTTTCATTCTATGTGGTTAATTG CTTCATATGTATACTGGTCTTAATTAATCCATTTCGCTACAGATTTTCAT TTCTAACAGAGATGCGCACAAGAGTCATACCAGCGTTACCAGTAAAAGGT TTGCTTCTCCCTTTGATCTATCATCTTGAGGTCAATATGATGTAGAGAAC ATTAATTCAAAAAGCATAGTAACTACTACGAAATAATTGATGGATCATCT ACTACTATGTGGTATGTAATTCTATGGTTCTTTGGCAGAGGTTGGTGGAC ACCTTTGCTTCTAACAGCAGGGGTTGCATCTGCTAAATATTTTCTTCGCC ACATCTCAAGGAAGAATACTGTCACACAAACTCGCCAAAACATCTCTCAG CACTATGATCTGGTCATTTTATTGTCTTCCCTACTTTCATCATTACTTTC TCTGTCTCGTTATATTTGTGCATAACCTTGATAGTGTCTGTTTTGAAATG TTTGTTCATTAAAGCAAACTAGAGTGTGGTTGTTGCAACGATTACACTCT TTGCCTCTACTTAAATATTTTGTAATAGGTTAAGTGGTTGTTATTATGCC TTCCGTAAATCTGTATAGTCAGTTCCTATTCATTTTTCTTAAAATATAAG TGTTTCTTGTTTTTACTCTTGGCAGTGTGCATATGTTGTGAAGGAAAGAC AGTCTAGAACATATAAAGACCTAACAAATCTCGGCATTGTGTGTGCAGAG TAATGAATTCTTCTCTCTTTTTCTGGATCCAACTATGACCTACTCTTGCG CCATTTTCAAGGTTTGCTTTGTGATTTGATGTTATACTACATGCAACCTT TGATTTTCTTATTCACGGGTGTCATTGTTGGTATTCCTTTGGTAGGTGGA GAACGAAAGCTTTGAAGTGGCCCAACTATGTAAAGTTAGCGTTCTAATCG ACAAGGTAATTTTACTAGCACAACTGAGTTCCATTATCATATCAGATGGA CAGTGCACACATAATCTTATGAATATGTAAATAATCCAAGGCTAAAGTGG AGCGGGATCATCATGTTCTTGAAATTGGCTGCGGTTGGGGCACCTTAGCG ATCCAGGTGGTGAAGCAAACTGGCTGTAAATACACAGGGATTACCTTATC CGTGGAGCAACTTAAGTATGCCCAAAGGAAAGTGAAAGAAGCTGGTTTAG AGGTAAATGTGATGTCAAAAAAACATAATTCTGACCACTAGTTTCTACTG TAATTTATCTCAGAACAAACCTAAACATTGTTTGGTGAATATTTATATAT TTTCCTTGTCAGGAATGTATAACTTTCCTGTTGTGTGACTACCGGCAAGT ACCATCTTACTACAAATATGACAGGATCATATCTTGGTAAGTAACACTGC TGATATGGATCACCGTAACATGATATAGAACTGAAGCAGTGAGTTTGTAC GTAAGTCTTGATTAATTTTCTGGCTGGCCCTTTTGTTCACGCAGTGAGAT GATTGAAGCAGTTGGTCATGAATACATGGACGATTTCTTTGGCTGCTGCG AGTCCCTCTTGGCGCCAGATGGCATACTTGTCCTCCAGGTCCACTTACTA TACATACATCAATTAATCGTACACCAATCTTCATGTGGAATCATCGACTA ATTTTGTTTTTGTTTGCAAATATATCTCGTAATCGGTAATTCGGTATGCA GTTCACCTCAATTCCGGAAGAACGCTATGATCAATACAGGAGAAGTTCAG ATTTTATAAAAGAGTACATCTTTCCAGGATGTTGCATTCCTTCCCTGGCC CGGGTCACGTCTGCCATGTCCGCCGCATCAAGGCTTAGGTGCATGCTTAT ATAGTTCGTCATGTACTCATGGTCCTGATTGTTGATCGACTGTTACTGAT TACTCCGCATATGTGTTGAGTGCAGCATTGAGCATGTTGAGAATATTGGG GATCATTACTACCCAACGCTAATGCGCTGGAGGGACAACTTCATGGACAA CAAAGAGTAAGTCAATCCAGAAAGTAAGATGAGTAAATTCATAAATCAAA CTAGGCACTAAAGTAGGAGTATTACATTTTGTACATTCTCTGGATTTGCA GTAAAATTCTGGCTCTGGGATTTGATGAGAAGTTCATTCGTATATGGGAA TACTACTTCGTATACTGCATGGCTGGTTTTAGGACAAGGACGCTTGGAAA CTACTTGGTATGTATGTTGCTGGCAAAGTTATTACTCCATCCGTTTCAAA ATTTAAGCGAGTCTTGTTTTGTCCTAAATGAAACTTCTATAAATCTAACC AGATATATTTAAAAAATATCAACATACGTAACACCTAATAAATACATTAT GGAGACTAGATTTCATGATGAATCTAATGAACTAATTTAGTGGTATAAAT GTTGGTATGTTTTTTTTATAAAATCAGGCAAACTCAACGAAGTTTAACTA ACGACAAAGATAGAAACATTTACACTTCGACACAGAGGGAGTAATATGCA TGGAACTTATTCAGAGTTTATTACCAGTAGTAGTACTCATACATGTGCTT ACATGTGTGTATTTCCATGCATGCAGATTGTGTTTTCTCGGCCTGGCAAC AACAAGCTAGAACCTTTGCGCAAGATTGCGGCAGCCTAGATGGTTTAACT CCGCAACTATTTGTACGAACCTGTGCTAAGTGGCGCCGTGAAGCGAATGT GAAAACGTGTGTCCACATGTGGTGGCGTTTGTGTTGTTTTGTGCGTGCTC TCTCTAAAACGATCGTTTTGTACCCTCTAGCCTCTCCGAATAAATTTCGG GGCCTACGTTTGTCCTTATAGCCTCAGAAGTTATGTACCTTAAGACTTTG AGTGTATTTTGTTAATAAAGAATCTGTGTGTAATAGCTAGTTACATGTAC GACTGGATTTGTACAGTGGGAATAGTTACTTTGAACACGTCTCATATTCA CGACATCCTTGTGCTTA

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.