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GrainGenes Sequence Report: AE017550

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Sequence
AE017550
Germplasm
BYU132 (oat)
Species
Avena erithiana
Probe
AE017550
Reference
ReferenceMaughan PJ et al. (2019) Genomic insights from the first chromosome-scale assemblies of oat (Avena spp.) diploid species BMC Biology 17.
DNA
CAGATGAACAGACCAAACACCTGCACCAAATCTCGCGACGTGTAAAAATG
GGCGAAGCCGGAAGCAGCGAGCCGCCGATGAGAGGGTAGGCGACACAAAC
ACGCCCCCAAATCAAACCCTAGCCCCGGAGGAGGAGAAGGAGGACGAATC
CGGCGATCTCCTCTTCCCTCAATAACCCTAGCCCCGGCGGCTGCGGCTTC
TGCTGCTGCGGCGGCTGAGATCTCAGGGAAGCGGGAGCGAGGGGCGGGGA
AGGATGTCGGACTCGGCGTCGATGGCTGCTGCCACAGAGGCGCGTTTCAG
CAACCGCGACCTCATCGGCCGCGGCTCCTTCGGCGATGTCTACAGAGGGT
TGGTTCGCTGATCCCCGCTCACGAATAGAGTTTTTTTTTGCCCTCTCTCG
CACGCGGAATTTTAACTAATATACCTCGGCGGCGGCCAGTGGAGCCGTTC
ATTTCGCTTTTGATCGAGCGGCATTGGGGACTCGTACAGCTCATGTCGAA
TTGGGGCATTAGGGATCAGGATTGTGGCAATTAAGTGGCCATTCTAGTGG
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GGATTTAGGGAAACTAGCAGTGTTAATAGGGTCAATTTTGTGACTGCCTG
AGATAGGCAAACAGACCTGTACTAATTTAGTTTGAGATAGCAGGGTACCT
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TTTGAATATCATTGCCAGTTGCGAATCGGCTGAAGCTGGATGTCTTATTT
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TTAGTAGCAATGAACCCACAGCTCAGGCACTCACAAAACACTACTGAATG
CTGGGTTGCTGAGTTAATAGTCAATTGACAGAAACAGTGTGTGTGCGTGC
ACTGATTTGTCCTGAATTCTTCACTTATTATAGTAGAAACAATGACATAA
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ATTGTTCTGAAATGATGCTAGAGCTAATACAACCGAGGTTTTATCTGCAT
TGGATTGAAGTACATAAATTTGGTCTTAGAGAGATTATTGCTGTAGGAAA
TGCTTCTTCTTGGGCCATCATGAACTTAGTGAATAGACTGGCTGTCAGAA
ACTTGAGTTGGTCTAGTTTGTCAAAGTTTGCTATGCAGTCTAGTGCCAGT
ATGTTAAACGATTATGCTTTTGTGCACTTGTGTCATTTGTTCCGCATACT
ATGCATGCTGAGGCCAAGGAGCCAACCCTAGTACGAGAGGACTGGGTTGG
GTCAACCTATGGTGTACCGGTTGTTATGCCAATAGCAGCGCCGGGCAGCT
AAGTTGGTTCACAAAATCATTGATGTCAAAGGGAATTCGAAAATGTTCGA
TGGTCATGGAAAGGATAAGGTTCAATGAATGGCTTGTCTATGAAGGCTAA
AAGCAAGCAAGATAGGCGGGACTTTGACAATGGAGCTTTGAGCTGGAGCT
TTGGACTCTACGAGGTATTGGGTGCTTGCCCTATTGAGAGTATCGTACAT
TCTTTCTTCACCAGACAGATAGACAAATAGGCAATCCGATAGAAAGATTA
TGGCTTCCTTACTATCAGCAAGCTTCCACAGGCGATGAACTGCTTCTGAC
TACTTGTAACTGCCTACTAATTACAGTATCGAGTGTCCTGGTGATGCAGA
TGCTATATATATAGTCTTCTCAAACTCTGAGTGCACTGATCTGTTAAGTT
GTAACTGTACCTTCTAGTTTGTTAATCTGAGCATTTTATAGATAGGATAG
GTCGTCGATTCAGCATTGGATAAAAAAGGGCAGGGTGCTCCTTTTTCTAG
TAAATAGTTCAAACCATTTTATCGATATGAGTGTTCTATATCAGATAAAT
TCTACATTAGTCATTTCCCATTTAAAGCATTTAGGTACTAATACTAATCA
TCAATTTCCTCCTGCGTCCGAAGATCTATTGTGATATATTTGCAGAAGGG
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ATGGATTCTGGCAATGCAACGGAGTTGGGACGCTATGATGATCCAGAGAA
ACGTGTGGTTTCTGAACCCATTGAGATGACCCAAGAATTTCGCTATTTCG
ATTTTGCTAGTCCTTGGGAACAGCGTAGCGACGGATAATTCCGAATCTAC
ATAGGTCTAGTCCAGGGGACAAATCAATAGGAAATGCTATTTGCTTCTTA
AGAAGAATCACTTTTTAGAAATGAAAGAGTTTCCACGGGCGTCGGATATC
ATTTCTTCAAATAAGGAAGAAGTGTTATCGATGGATTTCCTTCCATTCTT
CCTAGTATGGAAGAAGTAAAGAAAAAGACACCGTCGGTGTTGCCTTGCGA
AGAGCTTGCATCGCTCGTGCTCCCTATCGAGGGATCACTCGCTCTTCACC
CTATCCCTTTAGTGTAAAAACTCTTTTAGGGGATAAAGAGCCCTCAATAA
CCCCAATAGAGATAGAGCTTAGAAGTAAGAATTTCTTGGTAGGCATATTG
ATCCTATTTAGTTCCCCTCGGTGATGAACTAAAAATAGAGGGGCTTACGA
GCTGTTTTTACGGTTGTTCATCTTCACAGGCCCGTACGACGAAAGCTGTT
CTTAAAACGAATGCCACCACGGTTACGGCCTGTCACTTGAAAATAAGGTT
GTTTCATTTAGAATTCAGCAAGTTTCTTAGAAAATTGTTGTTAAACAGGT
TGACGTTCCACTGGGAATGGAATAACAAAGGCTTTTGGCAGTTTGTGGAT
CGAGATGTGATTCGCTTTTTGAGTAATCCTGGAGAACTTTTCTGGCTTTG
CCATTTTTCCTTGCTTTGGAGAGCTCATTTTTTAGTATGTTCGTAAGCGT
CCGCATTAGATTTTGCTTTCGGGCCCCGTAGGAACTACGAGATCACCCCA
AGGACGCCTTCGGCGTCCAGGGGTCACGGACCGACCATAGACCCTGTTCA
ATAAGTGGAACACATTAGCCGTCCGCTCTCCGGTTGGGCAGTAAGGGTCG
GAGAAGGGCAATCACTCATTCTTAAAACCAGCACTCCCCACTTGAATGGA
TTTTCTTTCTACTTTTTTCTACTTTTAGTGCCCATAGGAGGGAATTTCTC
CTACTCGAGTCCTGGTCTCGAATCCTTATCGATTTAGAAGCAAAGAAAGC
CTGCGATCTTGATTGTGACTAATCCAGCTAAAGTGGTTCTCCCCGGTTTT
CAAGGTCGTTCTTTCTTATTTTGCTTCGTCCTTTAGATAGCTTAGTCAAT
AATGTAGGATCCTAATTCAAATGGGAAAGAATTCTTTTAGAAACAACAGA
AATCGCATCAACCGCCGTCTGGAATCTTCTCGAAGAGAGTTTGACCTATT
ATAGAAAGACGAATCTTGTTCAAGCATGCAATACGAAATACTATGGGGCT
TTTTTGGAATAGCCTGGACAGAAGAAGTAGACTTCAGATCTCCAGGCATG
TTACTTCCGCAGAGGATGACAACCATATCCGCTAATTTCTGTATCCACTT
TATAAGCTATTGAATATTTTCAAACATATTGGTAGACATTTGCTGAGCCA
TATTTAACCCACAAGTTCTGTTTGTAATCCTTTTCTTCTATTCAGTATGA
AACATTTTAATGCTTATTATGGATTATTTGCTTGTGTTCATTCATAGGTT
TGACAAAGAACTGAGCAAGGAGGTTGCAATAAAAGTTATTGATCTGGAAG
AAGCGTGAGTCCTCAGCTTAAATTTCACTTTGAGTCTCTGTTTCTTAAAG
TAACACATTAATTTTATTAGGTATTGTACACTATAAATACACATGTTATT
AATTGCATTATTTTCTGCGATTTAAACCATGTTTCAATTTACTCTAGGAC
GTTCATTTTCCTGTGAAGTAACTTATTTTTCATGAAAACGTGTTTGTTTT
GTAATATCAGAAAATCTAGACTGAAGAGTAACCTTATTTCGTATTAGTAA
CTGAATTTGAGAATTTTATTCAACTTTTTAATGTCTTTTCAACCTACTCT
ATGCAGCGAGGATGATATCGAAGATATCCAAAAGGTTCTACTTCCAAATT
CTGAGTACTAGGCTATCATGGCATCAACTTACCGTGCAATTAATACAGAA
AGTTCTTTTCCTAAAAGGATTTGTTTCATGTTGCAGGAGATATCTGTTTT
GTCACAATGCCGTTGTCCATATATAACTGACTATTATGGTTCCTATCTTC
ATCAAACCAAACTGTGGATAGTAATGGAGTACATGGCTGGTGGTTCTGTT
GCTGACCTAGTATGTTTTGTATATTCTGTATCTTGATTGTCATAATGCAA
GACTCAACACCATGTAGATAGTAGATATATATGTATTTGATGAGTCATTC
CAGTTTCATAATCAGTGCAAACTACTTGGTTCAAACTGTAATGTTGCTCC
GACTTATATCTCCATATGTAGCTTCAAGCTGGCCCTCCTCTGGATGAAAT
ATCAATTGCTTGCATTCTAAGGGACTTGTTACATGCAGTTGAATATCTGC
ACTCCGAAGGAAAGATTCACCGTGATATTAAAGGTCTTGATTACTCCTCT
CCTTTTGTTTTTTCTTTCTCATCTGCATTTGTATCACAAACGTTTACTAC
TGCTTCGAGAAGATGCCAATCTGGTAAACCCTAGAAGGCTGTCCCCCCAA
GCAACATTAATCTTCTGAGTATGTAAACTGGAACTGATCATATCACTAAG
CTGTGTTTGCTTCTGGTGATCTTGGGCAATTTGTCTAGATTGATCCCTTG
TTCCTTGGTGGGTCAGATCTCTCTTTGTAGTTGGTAATCCCTTAACGCCT
CTGTTGCATTGGCCGTCATCACCACTGTAGTCAGCTTTAGCACCACTTCG
CAAGGTACTTCGTTGAACGGAGGAAGAACTGTGTGGAACGACCCAGCAGC
GTGCTCTTGTGATCCTCACTAGGTTACCCTTGAAGCGCACCTTGATCCCT
ACCTATCACCGTGTTCTCTTGCGTGGAATGCGCAAACAACCAATCATACT
TGCACTGTAGGAAAGACTACTGGCAAGGACACGTCTTCTCAAAGAGATGC
CTTTTGGCAATGGAGAAACAATTTATACCGCCGGGTCGTGCCTCTATCCT
GTGATCATGCACACACAGGCTAGTATTACACATGCATGAAAGAAATGAAA
GGGAAGAAAAAGGCAGGAACAAAATTAATGGCTATGGATAACAATATATA
TGTATGCATGTCATCCGTTTGTTTGCGCGTAAGTTGCACCATTTTGGTTC
CTTGTTTCGCACATGTCAGAGCACACGTTGGGTTTGATCCGTTGTTCCTA
AGGATTCAACTTATCAGGGATGCACGTTGGGTTTGATCCGTTGTTCCTAA
GGATTCAACTTATCAGGGATGCATGTTATCCCAACGTTTTAAGCTCTTCT
AGAATTAATCCATTGGTTGTCATCTTTTAATAAATATGGATTTGGCATCA
GGAGTCAATTTTAGAATAAAGAAGGATGACCTACTATGCAAGTAGTAAGG
ACTGATTAATACAGGGGCATTATCTTCAATGCATATATTTTGTACACTGC
GGTATTTAATACTCCTACCAAGTATACCACAAATTGTGATAGACAGCATT
ATGTTATGTTTTGCAGCGGCCAATATCCTCCTGACTGAAAGCGGAGATGT
GAAGGTATCACTTTTGTAGAGCATGTGGATGATTCTATGTTTGCAACATT
ATTACTGCGTAGCATATAATATATTTCTAAAGTTAATACATGTGTTCCAT
AGGTTGCAGACTTTGGTGTTTCTGCACAGTTGACTAAAACAATGTCTAGG
AGAAAGGTACCATTTTAACCATGATTATGCAACGTCATGTACACAGATAA
TTCAGTGTCTATCTACATATGCATCAGTAACCTGTGGACTCTTCTCAGCT
GCAGATTTAATTGACTAGGCTGTTTGTATAGTATACTAATAAATGGAAGC
TTTGAAAAAAGAAGTTGAGTTGCTATCCGAGCTTCCGTCCCACGACTTAC
CTTTGTTCCACTCACCTGAATAACTTATTTTTGCATATGTAAACTGTCAA
TCTGTATTGCTGACAAACTTGCTCACCGTATCCAGCTTGATTGAATGTAG
CACGTCCAACTGCTACATCGTTTTAACATTATATCTTCTCCCCTGCGTAG
TGAATGGACATCTATTGGCATTTTTTTTGAGATCTATTGGCATTATTAGT
TGTCTGTTCTTCATTGAGTGCATATCGACTGACCTTTAGTTACAGAAGAC
ATTTATGCAGTGTTCTAAAATCGGACACAAATAGGGTAGGTGGTAGTGGC
TACAGCTCTCCAGCTGTTAACCAGCCAAGAAAAGCAAAATACTTGCCACT
GCTTCAGGAAACTGATAGCTGGCTGGTCATGAGTAACCGACCAATAATGA
CTAACTATGAATTTTATACATGATTATGTCCCCTTTAAACTAAGGTTGAG
TGTTGTATCGTAGTATGACTTGGTCTGGATGCAAGCGGGATCCCGCCCAA
ATCCAGCTTCTAGTTCATTTTGAATTTTGGTGGAATCCTGCTTCACACCT
TACTTTGTCAGTAGCGATACTCGTAAACTGGTTTACATGGAGCGAATTTC
CCAGATAGATGGTTCCGGACCCCAAACAAGCCTGTTTGTGCATGCTTAGA
TTGACTGTAAAACTTATTGGAGCAAAATCCTTGCTTGTGGCCTGAGGCTA
TGTTGTACTGTACACTTGTACTCCATTATATTGCACGTGTGTTGCTCTTC
ATTTTCATTCACAATTGTAATTGATTGTTATTATGGAATTCAAGCGAACA
GTATAATGGTGGCATATACTCTTGGTAACATCGGGTGAGTGCCTAAGTGG
GTGGTTGGATATCATTGATCTGGGCACAAGGGGAAAAACAGACTTGATTA
TTATTGCGCATCGTATTTGACATGGATTTGCTGGTAAGAGAGGCAGAATG
TAGGGAAGAAAGGGGAACAAGTGGATGGTTCATGGAAAGAACACCAGTTA
TGTTTTCTATTTCTGCAACCACACATGTTTGCACCAACCGAGCATGCAGT
ATATGGAAGTCTGTAATGTTGTGGACCCGTGATAGTATCTTAGTTTAACT
GCGAACTTGCTTCCTTTGTTTGAATTACGTACAAGAACTATGGTTTGTTT
TTCAGTTCACGTAAATAAGATCAAAATTTACTGATATGTTGCTAATGCCT
AATGGCTTTGAGTTGTCCAGACATTTGTCGGAACTCCCTTTTGGATGGCA
CCTGAGGTTATTCAAAATTCTGATGGGTACAATGAAAAGGTACTTGCACA
TTTTTAAGCCTTTGCTTCTTATCGAGGGTCATTAAATAAGCTTGTGCCTC
AATGCAGGCGGATATCTGGTCTTTAGGTATAACTGCTATAGAAATGGCAA
AAGGTGAACCCCCTTTGGCAGATATTCATCCCATGAGAGTTCTTTTCATG
ATACCTCGTGAAAATCCTCCTCAGGTCACTTGAGTACTTTTTAACAATAT
TATTAAGTACTTCATTGCATTTTGCCAAAGCTTCTGTTATGCACTTTTTG
CAAGAACATAACTGGTGTATATTTATTAACATGCAGCTTGATGAGCATTT
CTCTAAACCAATGAAGGAGTTTGTGTCGCTATGCTTAAGGAAGAATCCAG
CAGAGGTAATATTCTTATTTTGTAGTTCTAACTGTACCAGGAAGAATTTC
TGCGCTTGTTCAATAGAAAGTTCCCATATTCACAGAAACAAAGTTACCAA
GAAATGTTCACACTCTTTGTTCTTTTGAACATTTGAGTGTCACTCTTCGC
TTTATAATTTCCTGTTATACACTGCGACGTTACTAGTTTTGTACTGGCCA
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GGGCTCAAATTCTGCTAGATCAATTAGAGAAGAGGGAATGAAATGTGATC
TAAGGATGCTTTGTGGAGAAACAGGGACAGTACAGAGGCTTTGAGGTTAT
TTCGTTGCATGCCATAGTAAATCCGGTACATAATTTCTAGGTAGATGCGT
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AGATGGAAAGATAAGGAATTTAATAGTCTGTGTCGACATTGCGGTTTTTG
CTTAATGCTGTTCCTTTATATTACATTCTCACAGAGGCCTAGTGCTAAGG
AACTTCTTAAGCATCGTTTCATAAAAAATGCCAGAAAAACTCCAAAGCTT
CTGGAGAGAATAAGGTATATGATATTCTTTTATGCACGTTTTGTTAGTAA
AGCACATTTCTGTTTGACTGATAATTGGAGTGTATCGATATCGTAGAGAG
CGGCCAAAATTTCGTTTCTATCTCATTTTCTCTATGTGCCTCTATTGCTG
ATATTTGTAGAGAGCGGCCAAAATTTACCGTAAAAGGCAGCATCGATGCC
ACACAAAATGGTCAAACGCATATTGAAGAGGATGATTATGGAGGTACTAT
CAAGGTTGAGAGGAATACAAAACATGCAGCTTCTCCGTCCAGGTATGTTT
ATTAAAATACTTCCTCCATTCACTAAGCAGTTAATAAGCTTTTTATTTTG
TCTTCATGTGCCTGATTATTTTTCTTCTACTATAGTCAAGCAACAGTTAA
GAAAGTTGCTGGCCGGGAATTTCCTGATAGATCGGAGGGCACAGGAACTG
TTCGAGGTGGTTTAAGACCACCACAAATAACCTCTACCAAAGAAGGTAGA
TTTGATAATTCAAGTACACTAAAACGTACAGCTGATCGAGAAAATCAGTG
GAGAACATCTGGGACTGGATCTGAAGAATCACCCTCAACAATCATGTCTA
AAGAAGCACAGACTGATCATGGAAGACTAGAAAGTTCTACAGAAGACGTA
AGATCTTAATCAGAAGCATGCAGTCTGTAAATGGTTAATATTTAATGCTG
ATTTTAACTGTGGGTTCTTGCCAGAATGATCAATCTGTAAGTGGGTCTGG
AACTGTGGTATTACGCTCTCCAAGAGCGTCTCAGGTCTACTCAGCAGCTC
CTAACCACAACTCTAAGGTACATTAGAGTACCAATTTTTGTTTTTATCCT
TGGTCCTACCTTGTCCTGAAAGCAATGCACTAAAGGAAGCAGCAACATCT
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TGTCTTCCAGTGGGACGGTCGTTAGGAATCAAACTGAAGAATCAGAAACT
CCACGATCGTCAAGGTCAAGGCTTGGGATACAAGAAAAAACATCAAATGC
TTCACTTGAGGATAGTGCTATTAACCTTGCGGAGGTAATGCACATGGAAC
TTTTTGTTGCCAAACTCTTGCTTGTATGGTCGATGCATAATTATGATGCA
TTCGAGCAATATATGCAGGCAAAGGCTGCTCTACAAGCTGGTTTCAGAAA
GGGTAATGCTCGAGAAAGACCAGTTATCACCAAACATGAAAAGGAATCAC
ATGAACCTAGATTTTCTGGGGTAAACAGTCATGAGGTTCGAAGGTATTTC
AAGCTTTTACTTTAAGCACTGTTTTGACTTACACGTGTGTTATTTATGGT
GTTCCTTAACACAAGTATGTTCTTTGTCCTAGTGAGAATGCTGACTTGCA
AAAAGGTCGCAAATCACGGCAGCCATCTGATGGGCAATCAGCTTCTCGAG
CTTCTGCAGCTTCGCCTGCACTCTCATCGTTGTTAATACCTTCTCTGAAA
GAGGTAAAATATATTAGGCATGTCCCTTTTTTCAATCTAAGTGTCTCTGT
TATTAGGGTAAACTAAGTTAACATTTGTATCTCTACAATCCCGTGAAGAC
CAGGGCACCATTCAACTGATTTTTCGCTGTTTTTATACGAGCCAAACTGA
ATAGGATAATTAATTCTGAATAATAGTTTAGCTGTTCTATCACTGTGATA
TTCCAATATTGATCTTTTCATCCTTCCTGAAATGTCTTCCAACTTTGGAC
TGCTTTCTATCCTGTTTCAGACTACTGGTGACAAGTTTGAAGATCCTGTT
GTCCATGCAGTCCTCAGTTCTCTGATGGATCTAGAACATGAGATTCCTGG
ATCCTGTGAGGTATTGGTTGGTAGATTGCTACATCGGCTAGGGAGGTACG
ACATTCACTCTCATTGTGTATATGCTTCCTCGCTTTTGTGCATGTGCTGC
AGCTTATTGTGCCTCTCTTGCAGCTCGAAAGATTCCTCGCTGAAAAGTTT
ACATGAGACGGCATTGTCGATTTTTACAAAGAAACCTGAGCCTCTGCCCG
AGCCTATAAGCAACAAGAAACCTGCTAGTACGCCACCATTGGCTGCTCCT
ACTGTAAGCCCTCTGGCGAGGTTCCTTCTTACCAGGTTGGTTTACAGACA
TATTTTTTTTCCATCGTGATATACACCCGAAACACAAACACGTGAGGTGG
GGTGACAGTTGTTATTGGTGCAGGTGGCAGAACCAAGTTTCCCAAGACCT
TAACTCCGTTTGATCCAGGCAATCCAATTTTTTTCCATCTTTTGATTCAG
TGTATAATTAATGCTGAGTGTACATAACTCTTATCTTTAGAACCCCCTTT
TCTGCTAGATGTTCTTTAGCGCCATCTGCTTGGTTGATTTGTTGTGTTGT
ACGTGAGAAGTTATTTCCTACCCATTTTCGAATGTAACTGCTACCGGTAT
ACATGTATTACAGCTGAGACAGATGAATACCATATCCAAACCTTGCCAGT
TATTCCTGGAAATTTTGTGATTTTATTGTCTCCTATGTGGCACAAAAC

GrainGenes is a product of the Agricultural Research Service of the US Department of Agriculture.